More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0181 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0181  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 
341 aa  662    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000844091 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23440  transcriptional regulator, LacI family  55.69 
 
 
350 aa  316  5e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.769589  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0971  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  51.63 
 
 
350 aa  290  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2046  LacI family transcription regulator  48.2 
 
 
344 aa  290  3e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3482  Alanine racemase  52.38 
 
 
359 aa  277  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0777863  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1824  transcriptional regulator, LacI family  47.59 
 
 
347 aa  272  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.021809  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2320  LacI family transcriptional regulator  44.7 
 
 
340 aa  271  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316441  normal  0.202359 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0819  transcriptional regulator, LacI family  51.48 
 
 
348 aa  267  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0091  LacI family transcription regulator  48.09 
 
 
346 aa  265  5.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3252  transcriptional regulator, LacI family  47.18 
 
 
351 aa  257  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0461  transcriptional regulator, LacI family  46.48 
 
 
353 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.686839  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0113  transcriptional regulator, LacI family  49.27 
 
 
350 aa  258  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6831  LacI family transcription regulator  44.41 
 
 
337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2790  LacI family transcription regulator  44.15 
 
 
348 aa  247  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1825  transcriptional regulator, LacI family  48.84 
 
 
346 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319362  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2344  transcriptional regulator, LacI family  45.78 
 
 
349 aa  247  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1983  transcriptional regulator, LacI family  45.19 
 
 
345 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.597613  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0549  Alanine racemase  46.59 
 
 
340 aa  240  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2659  transcriptional regulator, LacI family  44.74 
 
 
339 aa  238  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.34431  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0193  transcriptional regulator, LacI family  44.21 
 
 
340 aa  230  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01670  transcriptional regulator  42.73 
 
 
348 aa  226  4e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3985  transcriptional regulator, LacI family  45.61 
 
 
338 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.610149  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33130  transcriptional regulator, LacI family  44.51 
 
 
361 aa  224  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.260263  normal  0.79569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3319  transcriptional regulator, LacI family  43.28 
 
 
337 aa  222  6e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419074  normal  0.0675752 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0366  transcriptional regulator, LacI family  42.03 
 
 
344 aa  222  6e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3001  transcriptional regulator, LacI family  43.28 
 
 
343 aa  222  8e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1620  LacI family transcription regulator  42.6 
 
 
337 aa  217  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0069  transcriptional regulator, LacI family  45.24 
 
 
342 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4877  transcriptional regulator, LacI family  42.34 
 
 
346 aa  209  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00304627  normal  0.857214 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3338  transcriptional regulator, LacI family  41.74 
 
 
341 aa  202  9e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.680798  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1873  LacI family response repressor  36.9 
 
 
368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.845568  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11530  transcriptional regulator, LacI family  41.06 
 
 
331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809623 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4933  transcriptional regulator, LacI family  39.94 
 
 
339 aa  199  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0794709  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  40 
 
 
353 aa  196  7e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3586  transcriptional regulator, LacI family  40.29 
 
 
333 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  41.81 
 
 
342 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  40.76 
 
 
341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  40.12 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  35.5 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  35.91 
 
 
368 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30450  transcriptional regulator  43.79 
 
 
349 aa  179  7e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.158752  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  34.12 
 
 
348 aa  174  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2720  transcriptional regulator, LacI family  38.55 
 
 
337 aa  175  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.687845  normal  0.476409 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2403  transcriptional regulator, LacI family  39.94 
 
 
379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00011763  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.62 
 
 
335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.52 
 
 
335 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  31.27 
 
 
342 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0907  LacI family transcription regulator  38.87 
 
 
341 aa  170  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  35.48 
 
 
339 aa  170  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1769  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 
339 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1329  transcriptional regulator, LacI family  38.87 
 
 
341 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.315575  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3715  transcriptional regulator, LacI family  38.46 
 
 
341 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.335783  hitchhiker  0.00243488 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3470  transcriptional regulator, LacI family  40.24 
 
 
331 aa  162  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.04 
 
 
335 aa  161  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0502  transcriptional regulator, LacI family  36.76 
 
 
344 aa  158  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0979375 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.75 
 
 
342 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.75 
 
 
342 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  32.06 
 
 
333 aa  156  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0282  LacI family transcriptional regulator  36.9 
 
 
342 aa  156  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.727359 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30 
 
 
338 aa  155  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.36 
 
 
337 aa  155  8e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  34.1 
 
 
336 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.56 
 
 
342 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  31.49 
 
 
340 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  34.62 
 
 
333 aa  153  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4426  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.53 
 
 
341 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4494  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.53 
 
 
341 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4310  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.53 
 
 
341 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4424  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.53 
 
 
341 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4340  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.53 
 
 
341 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.302828  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0948  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.91 
 
 
337 aa  152  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.849116  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0673  transcriptional regulator, LacI family  35.57 
 
 
382 aa  152  7e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208846  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0168  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.84 
 
 
347 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  29.82 
 
 
342 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.17 
 
 
342 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.945809  hitchhiker  0.0011577 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  29.79 
 
 
386 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0116  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.63 
 
 
356 aa  150  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  30.84 
 
 
352 aa  149  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1333  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 
347 aa  149  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00834702  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3795  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.43 
 
 
356 aa  149  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2557  LacI family transcriptional regulator  36.98 
 
 
341 aa  149  8e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000811694  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  34.99 
 
 
346 aa  149  8e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  31.74 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  31.74 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.74 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  31.74 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.74 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.76111 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.74 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  30.31 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.74 
 
 
343 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.74 
 
 
343 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2073  transcriptional regulator, LacI family  34.13 
 
 
336 aa  147  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000787477  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5391  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.53 
 
 
330 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.504328  normal  0.696689 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0182  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.25 
 
 
347 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  33.13 
 
 
337 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.95 
 
 
335 aa  146  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0187  transcriptional regulator, LacI family  36.95 
 
 
339 aa  146  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4333  transcriptional regulator, LacI family  34.31 
 
 
340 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  31.78 
 
 
337 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  28.43 
 
 
341 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>