More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1225 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1225  ABC transporter related  100 
 
 		 274 aa  557  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1591  ABC transporter related  70.66 
 
 		 263 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.963081  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6520  ABC transporter related  66.91 
 
 		 276 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.510638 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6108  ABC transporter related  66.67 
 
 		 276 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.665492 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4534  ABC transporter related  69.88 
 
 		 263 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2185  ABC transporter related  69.11 
 
 		 263 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.839848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2499  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  65.57 
 
 		 279 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2603  ABC transporter related  66.39 
 
 		 256 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980266 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1341  ABC transporter-like  58.02 
 
 		 262 aa  299  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.359238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0742  putative ABC transporter, ATP-binding protein  58.65 
 
 		 257 aa  299  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1889  ABC transporter related  59.92 
 
 		 257 aa  296  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.110075  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4240  ABC transporter, ATP-binding protein  55.56 
 
 		 260 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2397  ABC transporter related  53.75 
 
 		 268 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3974  ABC transporter  55.14 
 
 		 260 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.161065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3976  ABC transporter related  58.62 
 
 		 257 aa  280  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2684  ABC transporter related protein  52.99 
 
 		 263 aa  276  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0610  ABC transporter related  56.77 
 
 		 268 aa  275  5e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.376916  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2358  ABC transporter related  56.47 
 
 		 246 aa  270  1e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.869822  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4452  ABC transporter related  50.8 
 
 		 253 aa  271  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1364  ABC transporter related  53.75 
 
 		 289 aa  270  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.245091  normal  0.0323343 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2730  ABC transporter related  59.22 
 
 		 280 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1124  ABC transporter  55.13 
 
 		 267 aa  267  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0048  ABC transporter related  51.49 
 
 		 259 aa  264  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3490  ABC transporter related  47.66 
 
 		 303 aa  202  7e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  43.98 
 
 		 303 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  43.12 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  43.98 
 
 		 303 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  43.98 
 
 		 303 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  43.07 
 
 		 304 aa  177  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  46.04 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2105  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.5 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  40.8 
 
 		 304 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  42.17 
 
 		 259 aa  175  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  42.17 
 
 		 259 aa  175  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  45.05 
 
 		 304 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  44.67 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  39.3 
 
 		 339 aa  170  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  45.05 
 
 		 264 aa  170  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  41.52 
 
 		 260 aa  169  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  40.27 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0964  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.57 
 
 		 369 aa  169  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  43.28 
 
 		 267 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1077  ATPase  41.75 
 
 		 251 aa  168  7e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.096527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  40.69 
 
 		 261 aa  168  7e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0039  ABC transporter related  42.4 
 
 		 276 aa  168  9e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147558  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  40.27 
 
 		 254 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  39.82 
 
 		 254 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  40.08 
 
 		 350 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  42.73 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0622  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.17 
 
 		 365 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2599  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.2 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3518  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.2 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  40.08 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  44.83 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  41.78 
 
 		 366 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  40.71 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  39.81 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  41.4 
 
 		 333 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  45.59 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  41.4 
 
 		 333 aa  166  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  42.65 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  42.92 
 
 		 315 aa  166  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  45.64 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  41.4 
 
 		 333 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  41.4 
 
 		 333 aa  166  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  42.51 
 
 		 261 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1633  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.55 
 
 		 353 aa  165  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3611  ABC transporter related  41.83 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  41.43 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  39.26 
 
 		 259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1776  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.81 
 
 		 352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  41.44 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  38.97 
 
 		 276 aa  163  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  39.63 
 
 		 245 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  43.69 
 
 		 259 aa  163  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3104  ABC transporter ATP-binding protein  40.09 
 
 		 361 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1581  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.47 
 
 		 352 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  43.41 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1333  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.09 
 
 		 361 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.938281  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2467  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit, CysA  39.35 
 
 		 352 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37453  normal  0.40558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  40.59 
 
 		 264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1124  sulphate transport system permease protein 1  40.47 
 
 		 352 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1216  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding subunit  40.09 
 
 		 361 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1604  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.47 
 
 		 352 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96838  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  43.9 
 
 		 254 aa  162  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3450  ABC transporter related  41.94 
 
 		 384 aa  162  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622564  normal  0.365938 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  37.92 
 
 		 257 aa  162  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  44.5 
 
 		 657 aa  162  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  40.93 
 
 		 333 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4742  ABC sulfate transporter, ATPase subunit  40 
 
 		 352 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0517835  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1500  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.09 
 
 		 352 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.823264  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  42.86 
 
 		 293 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  41.95 
 
 		 292 aa  161  9e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  42.86 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1968  sulphate transport system permease protein 1  38.89 
 
 		 378 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  41.7 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  40.85 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  41.63 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1047  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.89 
 
 		 330 aa  160  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.37 
 
 		 375 aa  161  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>