245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0922 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3317  amino acid permease-associated region  62.39 
 
 		 594 aa  716    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.59573 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5657  amino acid permease-associated region  62.56 
 
 		 594 aa  720    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0675998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3606  amino acid permease-associated region  82.49 
 
 		 571 aa  948    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0922  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 571 aa  1131    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6593  amino acid permease-associated region  62.56 
 
 		 594 aa  725    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000438666 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0446  amino acid permease-associated region  52.52 
 
 		 562 aa  600  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000198962  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5964  amino acid permease-associated region  54.69 
 
 		 559 aa  601  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0671695 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3183  amino acid permease-associated region  52.32 
 
 		 560 aa  574  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.577712  normal  0.0276792 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5970  amino acid permease-associated region  52.09 
 
 		 546 aa  560  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.699386  normal  0.10331 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5831  amino acid permease-associated region  48.08 
 
 		 545 aa  522  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5210  amino acid permease-associated region  48.33 
 
 		 551 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3557  amino acid permease-associated region  47.13 
 
 		 551 aa  520  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5012  amino acid permease-associated region  47.8 
 
 		 551 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0581  amino acid transporter  47.45 
 
 		 551 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3293  amino acid permease-associated region  47.73 
 
 		 551 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373408  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4487  amino acid permease-associated region  46.96 
 
 		 551 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5075  amino acid permease-associated region  47.73 
 
 		 551 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0481  putative amino acid transporter  49.36 
 
 		 551 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.483178  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2118  hypothetical protein  49.36 
 
 		 551 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.755576  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1858  amino acid transporter, putative  49.17 
 
 		 551 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.540964  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0700  amino acid permease  49.36 
 
 		 551 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.163425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0996  amino acid permease  49.36 
 
 		 551 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858254  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0838  amino acid permease  49.36 
 
 		 551 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0750  amino acid permease  49.36 
 
 		 551 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1969  amino acid permease  49.36 
 
 		 551 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303247  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4239  amino acid permease-associated region  48.38 
 
 		 551 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.181537 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3293  amino acid permease-associated region  47.89 
 
 		 555 aa  511  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23200  amino acid transporter  35.28 
 
 		 541 aa  338  1.9999999999999998e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374176 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2292  amino acid transporter  32.34 
 
 		 500 aa  176  9e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3606  amino acid permease  28.6 
 
 		 508 aa  171  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.582205 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0198  amino acid permease-associated region  27.16 
 
 		 490 aa  78.2  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000143228  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5040  Amino acid transporter-like protein  29.65 
 
 		 472 aa  75.1  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973812  normal  0.0393734 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  26.78 
 
 		 476 aa  63.5  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000712  probable transport protein  27.59 
 
 		 467 aa  62.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.234899  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  23.29 
 
 		 483 aa  60.8  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  25.78 
 
 		 494 aa  60.8  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  22.42 
 
 		 482 aa  60.5  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  22.42 
 
 		 482 aa  60.5  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1191  amino acid permease-associated region  26.09 
 
 		 499 aa  59.7  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  23.21 
 
 		 490 aa  58.9  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  28.65 
 
 		 491 aa  59.3  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1623  amino acid transporter  27.96 
 
 		 427 aa  57  0.0000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133426  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3457  amino acid permease-associated region  28.81 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.553768  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  24.65 
 
 		 466 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  22.95 
 
 		 473 aa  56.2  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5170  amino acid permease-associated region  27.36 
 
 		 502 aa  54.7  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.892102 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  24 
 
 		 463 aa  54.7  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 		 566 aa  54.3  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1332  amino acid permease-associated region  25.57 
 
 		 490 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.454402  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1143  amino acid permease-associated region  26.29 
 
 		 464 aa  54.3  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1349  amino acid permease-associated region  25.57 
 
 		 490 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.923637  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1368  amino acid permease-associated region  25.57 
 
 		 490 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  24 
 
 		 463 aa  53.9  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3063  amino acid permease-associated region  25.77 
 
 		 468 aa  53.9  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.313511  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  24.51 
 
 		 476 aa  53.9  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11790  putative amino acid transporter  25.13 
 
 		 482 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0380626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1930  amino acid permease-associated region  24.59 
 
 		 489 aa  53.5  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0285  inner membrane protein YjeH  26.88 
 
 		 427 aa  53.5  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0544  ethanolamine transproter  24.36 
 
 		 482 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2970  amino acid permease-associated region  26.91 
 
 		 494 aa  52.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0596  ethanolamine transproter  23.26 
 
 		 482 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  24.19 
 
 		 500 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1638  ethanolamine transproter  23.3 
 
 		 483 aa  52.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  23.25 
 
 		 474 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0583  ethanolamine transproter  24.36 
 
 		 482 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3197  ethanolamine permease  25.68 
 
 		 480 aa  52.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0388  amino acid transporter  23.85 
 
 		 483 aa  52.8  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000257428  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1740  amino acid permease-associated region  26.79 
 
 		 493 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327226  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  24.6 
 
 		 503 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  25.27 
 
 		 513 aa  51.6  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  25.45 
 
 		 468 aa  51.6  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  25.66 
 
 		 488 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2505  amino acid transporter  26.13 
 
 		 488 aa  51.6  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.187909  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  23.21 
 
 		 464 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0589  ethanolamine transproter  24.5 
 
 		 482 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360598  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5274  lysine-specific permease  25.27 
 
 		 487 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1683  amino acid transporter  27.81 
 
 		 508 aa  50.8  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000204712  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61250  APC family lysine-specific permease  25.27 
 
 		 487 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.405295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  22.45 
 
 		 486 aa  50.8  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  29.55 
 
 		 495 aa  50.8  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 455 aa  50.4  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3674  amino acid permease-associated region  22.5 
 
 		 487 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  28.78 
 
 		 464 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  28.78 
 
 		 464 aa  50.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13282  cationic amino acid transport integral membrane protein  25.7 
 
 		 495 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.260226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  23 
 
 		 446 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  22.62 
 
 		 465 aa  50.1  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1848  ethanolamine transporter  24.91 
 
 		 479 aa  50.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.079886  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  22.61 
 
 		 516 aa  50.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  24.14 
 
 		 503 aa  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3458  inner membrane protein YjeH  30.77 
 
 		 418 aa  49.7  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  26.5 
 
 		 473 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  22.66 
 
 		 512 aa  49.7  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  24.84 
 
 		 482 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0046  amino acid permease-associated region  21.98 
 
 		 481 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2056  amino acid permease-associated region  27.67 
 
 		 509 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  22.56 
 
 		 478 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2102  amino acid permease-associated region  27.67 
 
 		 509 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0313964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2039  amino acid permease-associated region  27.67 
 
 		 509 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3597  inner membrane protein YjeH  25.7 
 
 		 419 aa  48.9  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>