More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3199 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
369 aa  723    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166157  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.62 
 
 
356 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.112359  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0806  ABC dipeptide transporter, inner membrane subunit DppB  57.23 
 
 
356 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.557497  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.6 
 
 
364 aa  371  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.23 
 
 
356 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3887  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  54.49 
 
 
355 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51 
 
 
352 aa  363  2e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0522734  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1905  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.21 
 
 
365 aa  359  5e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.074595  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.15 
 
 
383 aa  358  9.999999999999999e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.56 
 
 
356 aa  355  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3866  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.15 
 
 
346 aa  354  1e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.17 
 
 
355 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.800769  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.21 
 
 
347 aa  352  5e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0789045  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.3 
 
 
355 aa  351  8.999999999999999e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.15 
 
 
352 aa  350  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0196  peptide/opine/nickel ABC transporter inner membrane protein  51.99 
 
 
356 aa  350  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0448682 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1249  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.67 
 
 
352 aa  350  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1443  ABC transporter, permease protein  54.63 
 
 
330 aa  346  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.34 
 
 
345 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.716973 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1918  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  54.74 
 
 
333 aa  343  2e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.84 
 
 
356 aa  343  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2705  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.6 
 
 
345 aa  342  5.999999999999999e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2045  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.56 
 
 
351 aa  342  8e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100967  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.28 
 
 
356 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642947  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.56 
 
 
356 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.598069 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.56 
 
 
356 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0210654  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.28 
 
 
356 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00157663  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.55 
 
 
346 aa  339  4e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5713  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.28 
 
 
356 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.076951 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1252  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  50.28 
 
 
356 aa  338  7e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.35 
 
 
356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3536  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.96 
 
 
355 aa  335  5e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.857231 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.11 
 
 
358 aa  333  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1391  ABC transporter, permease protein  51.57 
 
 
356 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0350688  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1049  ABC transporter, permease protein  51.57 
 
 
356 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1310  ABC transporter, permease protein  51.57 
 
 
356 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0248  ABC transporter, permease protein  51.57 
 
 
356 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0519  ABC transporter, permease protein  51.57 
 
 
356 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.872577  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2561  ABC transporter, permease protein  51.28 
 
 
356 aa  332  8e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1029  dipeptide ABC transporter, permease protein  47.22 
 
 
357 aa  331  1e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.234633  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1275  ABC transporter, permease protein  53.13 
 
 
336 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.572487  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0800  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  55.11 
 
 
356 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.4 
 
 
342 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162218  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.09 
 
 
342 aa  315  8e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.240236  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3249  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB, putative  50.49 
 
 
345 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0957202  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.55 
 
 
336 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.32 
 
 
337 aa  310  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.28 
 
 
365 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285903  normal  0.173747 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.22 
 
 
336 aa  302  5.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5441  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.41 
 
 
364 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.582701  hitchhiker  0.00744073 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.12 
 
 
360 aa  295  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3687  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.69 
 
 
349 aa  293  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4039  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter permease  46.69 
 
 
349 aa  293  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3552  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, permease protein  46.69 
 
 
349 aa  293  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2057  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.1 
 
 
352 aa  289  6e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.239018  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.95 
 
 
340 aa  286  2.9999999999999996e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.7 
 
 
350 aa  274  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.87 
 
 
347 aa  257  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.69 
 
 
346 aa  255  7e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0835992  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
338 aa  252  6e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.09 
 
 
338 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0727691 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 
334 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.51 
 
 
335 aa  244  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  38.44 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4050  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.32 
 
 
337 aa  242  7e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.63 
 
 
337 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298379  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0717  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, permease protein  38.37 
 
 
337 aa  239  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529173  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.82 
 
 
334 aa  239  6.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.41 
 
 
336 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.721542  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1583  alkaline phosphatase  38.32 
 
 
335 aa  235  9e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354079  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2947  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  39.1 
 
 
338 aa  235  9e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.728806  normal  0.808903 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  38.41 
 
 
336 aa  233  5e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.36 
 
 
333 aa  232  9e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0840  alkaline phosphatase  41.02 
 
 
336 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3964  hypothetical protein  37.31 
 
 
335 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.7 
 
 
336 aa  229  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.13 
 
 
336 aa  228  9e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0391  Nickel-transporting ATPase  37.2 
 
 
334 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.941274  normal  0.201292 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
334 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103751  normal  0.0395583 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3232  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  37.61 
 
 
335 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.624237  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.43 
 
 
336 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0330  nickel-transporting ATPase  37.13 
 
 
334 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.32 
 
 
336 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1530  dipeptide ABC transporter, permease protein  38.02 
 
 
335 aa  228  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.755182  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.84 
 
 
364 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.61 
 
 
335 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1585  dipeptide ABC transporter, permease protein  38.02 
 
 
335 aa  227  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  37.61 
 
 
337 aa  227  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  39.22 
 
 
336 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.24 
 
 
336 aa  226  4e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  37.91 
 
 
336 aa  226  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 
335 aa  226  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  40.3 
 
 
336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.32 
 
 
336 aa  226  6e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  39.32 
 
 
336 aa  225  8e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  38.46 
 
 
336 aa  225  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  38.46 
 
 
336 aa  225  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  36.83 
 
 
336 aa  225  9e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
335 aa  225  1e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.905382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>