63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6231 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0131  hypothetical protein  41.93 
 
 		 1249 aa  944    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103261  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6231  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 1275 aa  2588    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2883  WGR domain-containing protein  34.55 
 
 		 1216 aa  155  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.282061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0389  WGR domain-containing protein  36.79 
 
 		 1127 aa  155  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489109  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2966  hypothetical protein  34.9 
 
 		 1083 aa  147  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00498883  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3099  hypothetical protein  35.47 
 
 		 963 aa  146  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  35.48 
 
 		 1314 aa  145  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3293  hypothetical protein  27.38 
 
 		 1139 aa  144  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3309  molybdate metabolism regulator  28.05 
 
 		 1139 aa  142  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0596  WGR domain-containing protein  33.22 
 
 		 1130 aa  142  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3301  molybdate metabolism regulator  27.16 
 
 		 1139 aa  140  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  32.92 
 
 		 1422 aa  140  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1532  WGR domain-containing protein  31.83 
 
 		 1264 aa  138  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  31.94 
 
 		 1262 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  31.94 
 
 		 1264 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0598  WGR domain-containing protein  30.82 
 
 		 1125 aa  136  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2250  molybdate metabolism regulator  31.49 
 
 		 1264 aa  135  6.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02045  molybdate metabolism regulator  34.3 
 
 		 1264 aa  134  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4404  hypothetical protein  36.89 
 
 		 1012 aa  130  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1890  hypothetical protein  34.62 
 
 		 1104 aa  129  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2909  hypothetical protein  36.32 
 
 		 1116 aa  127  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.011304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1888  WGR domain-containing protein  35.04 
 
 		 1099 aa  127  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.735495  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2998  hypothetical protein  28.87 
 
 		 1139 aa  124  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.379625  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  30.95 
 
 		 1329 aa  123  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1981  molybdate metabolism regulator  25.85 
 
 		 1137 aa  122  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1670  hypothetical protein  32.35 
 
 		 988 aa  122  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.596851  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4265  hypothetical protein  34.2 
 
 		 1178 aa  119  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1490  molybdate metabolism regulator  26.43 
 
 		 1146 aa  118  6e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0927  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  28.04 
 
 		 1220 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02046  hypothetical protein  30.38 
 
 		 1210 aa  116  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02004  hypothetical protein  30.38 
 
 		 1210 aa  116  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2251  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  30.38 
 
 		 1210 aa  116  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1541  putative regulator  29.54 
 
 		 1210 aa  115  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3102  molybdate metabolism regulator MolR homolog  27.46 
 
 		 1209 aa  115  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.772316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1531  putative regulator  30.38 
 
 		 1210 aa  115  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4309  hypothetical protein  35.59 
 
 		 1055 aa  111  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4413  hypothetical protein  33.63 
 
 		 1001 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1889  WGR domain-containing protein  32.91 
 
 		 1086 aa  105  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00599399  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0597  WGR domain-containing protein  30.71 
 
 		 1086 aa  101  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1013  hypothetical protein  25 
 
 		 1108 aa  100  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  35.06 
 
 		 1291 aa  99  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73033 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1496  hypothetical protein  24.38 
 
 		 465 aa  98.2  9e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00864727  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1394  WGR domain-containing protein  32.03 
 
 		 1297 aa  95.5  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753889  normal  0.407272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3551  hypothetical protein  25.61 
 
 		 670 aa  80.1  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0236032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0234  molybdate metabolism regulator  28.09 
 
 		 1094 aa  77  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  20.62 
 
 		 754 aa  75.5  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7811  hypothetical protein  24.66 
 
 		 817 aa  75.5  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  21.99 
 
 		 762 aa  73.2  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  21.1 
 
 		 789 aa  72  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2623  hypothetical protein  23.19 
 
 		 903 aa  71.2  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.830052  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4075  hypothetical protein  24.79 
 
 		 634 aa  70.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1935  hypothetical protein  21.99 
 
 		 837 aa  69.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.273514  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  21.05 
 
 		 898 aa  67.4  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  21.05 
 
 		 857 aa  58.2  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1930  hypothetical protein  22.13 
 
 		 852 aa  55.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7144  hypothetical protein  25.27 
 
 		 811 aa  55.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  20.41 
 
 		 774 aa  53.9  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  17.98 
 
 		 800 aa  50.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2790  lipoprotein  21.93 
 
 		 862 aa  48.5  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4266  hypothetical protein  35.25 
 
 		 971 aa  47.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794814  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6953  hypothetical protein  23.75 
 
 		 725 aa  46.6  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448128  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2787  lipoprotein  18.86 
 
 		 862 aa  46.6  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000522963  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1886  hypothetical protein  31.25 
 
 		 838 aa  45.8  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292841  normal  0.495378 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>