More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5871 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5871  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 545 aa  1113    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4137  AMP-dependent synthetase and ligase  46.52 
 
 		 554 aa  449  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3146  AMP-dependent synthetase and ligase  47.2 
 
 		 533 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.683024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2984  AMP-binding domain protein  40.93 
 
 		 546 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  40 
 
 		 546 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  40.37 
 
 		 546 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  39.81 
 
 		 546 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  40.74 
 
 		 539 aa  365  1e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  39.96 
 
 		 538 aa  363  4e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  39.31 
 
 		 549 aa  363  4e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  38.92 
 
 		 544 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  38.8 
 
 		 560 aa  362  1e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  38.39 
 
 		 549 aa  361  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  41.19 
 
 		 549 aa  358  9.999999999999999e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  36.79 
 
 		 566 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  37.89 
 
 		 552 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2319  AMP-binding domain protein  39.18 
 
 		 565 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770298  normal  0.0254377 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  38.75 
 
 		 564 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  38.43 
 
 		 552 aa  354  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  40 
 
 		 540 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  38.79 
 
 		 539 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4878  AMP-dependent synthetase and ligase  39.85 
 
 		 530 aa  352  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148671 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  36.05 
 
 		 547 aa  352  1e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  37.83 
 
 		 557 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  39.81 
 
 		 540 aa  352  1e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  39.81 
 
 		 540 aa  352  1e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  37.64 
 
 		 544 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  39.48 
 
 		 541 aa  350  3e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  36.81 
 
 		 550 aa  350  3e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  37.59 
 
 		 575 aa  348  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  35.7 
 
 		 571 aa  348  1e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  38.31 
 
 		 552 aa  348  1e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  39.82 
 
 		 561 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  37.13 
 
 		 549 aa  348  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  38.3 
 
 		 557 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  37.77 
 
 		 552 aa  347  3e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  38.5 
 
 		 576 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  38.5 
 
 		 576 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  39.3 
 
 		 551 aa  347  5e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  38.5 
 
 		 576 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  37.46 
 
 		 562 aa  346  6e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  38.5 
 
 		 570 aa  346  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  38.7 
 
 		 560 aa  346  7e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  36.96 
 
 		 563 aa  346  7e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  37.59 
 
 		 576 aa  345  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  35.29 
 
 		 574 aa  345  1e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  38.5 
 
 		 576 aa  345  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  38.52 
 
 		 560 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  38.5 
 
 		 576 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  38.5 
 
 		 576 aa  345  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  38.78 
 
 		 538 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  38.98 
 
 		 560 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0404  hypothetical protein  35.23 
 
 		 605 aa  343  5e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.737872  normal  0.0168695 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  37.81 
 
 		 557 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  38.26 
 
 		 564 aa  341  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  37.16 
 
 		 550 aa  341  2e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.727031  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  35 
 
 		 566 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  36.62 
 
 		 579 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  38.41 
 
 		 576 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4355  AMP-binding domain protein  36.7 
 
 		 577 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  37.48 
 
 		 543 aa  339  7e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  38.72 
 
 		 550 aa  339  8e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  38.39 
 
 		 552 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  37.66 
 
 		 1043 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1086  AMP-dependent synthetase and ligase  35.83 
 
 		 566 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12527  AMP-binding domain protein  37.06 
 
 		 547 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0503764 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  36.88 
 
 		 575 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  36.48 
 
 		 560 aa  336  5e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  37.08 
 
 		 575 aa  336  5e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17630  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  36.94 
 
 		 592 aa  336  7.999999999999999e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100128  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  37.46 
 
 		 576 aa  335  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1904  AMP-binding domain protein  35.78 
 
 		 573 aa  335  1e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  37.82 
 
 		 560 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  36.7 
 
 		 575 aa  333  5e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  35.04 
 
 		 587 aa  333  5e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  37.3 
 
 		 575 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  37.3 
 
 		 575 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  37.3 
 
 		 575 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  37.06 
 
 		 576 aa  332  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  36.05 
 
 		 579 aa  332  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  37.99 
 
 		 562 aa  331  2e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  35.41 
 
 		 550 aa  331  2e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  35.96 
 
 		 549 aa  331  2e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  35.6 
 
 		 549 aa  330  3e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  36.14 
 
 		 565 aa  330  4e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  35.9 
 
 		 549 aa  330  4e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  36 
 
 		 549 aa  329  6e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  36.33 
 
 		 578 aa  329  8e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5975  AMP-binding domain protein  36.48 
 
 		 572 aa  328  1.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3066  AMP-dependent synthetase and ligase  35.3 
 
 		 558 aa  326  8.000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0241  AMP-dependent synthetase and ligase  38.46 
 
 		 545 aa  326  8.000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276778  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0473  AMP-binding domain protein  35.89 
 
 		 568 aa  326  8.000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2357  AMP-binding domain protein  34.64 
 
 		 570 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0641132  normal  0.0814981 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2503  AMP-binding domain protein  35.12 
 
 		 568 aa  325  1e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  36.84 
 
 		 570 aa  325  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3045  AMP-binding domain protein  35.36 
 
 		 578 aa  324  2e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0312  AMP-binding domain protein  36.08 
 
 		 550 aa  325  2e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  37.15 
 
 		 553 aa  324  3e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  35 
 
 		 574 aa  323  4e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0252  AMP-binding domain protein  35.27 
 
 		 564 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>