More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3643 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3643  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 265 aa  533  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0110  enoyl-CoA hydratase  72.83 
 
 		 277 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0304  enoyl-CoA hydratase  72.83 
 
 		 272 aa  386  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0198  enoyl-CoA hydratase  73.21 
 
 		 286 aa  384  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0166  enoyl-CoA hydratase  72.08 
 
 		 272 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0159  enoyl-CoA hydratase  72.45 
 
 		 272 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3213  enoyl-CoA hydratase  73.21 
 
 		 275 aa  381  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0244  enoyl-CoA hydratase  73.21 
 
 		 275 aa  381  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0076  enoyl-CoA hydratase  73.21 
 
 		 275 aa  381  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.426099  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2926  enoyl-CoA hydratase  73.96 
 
 		 275 aa  381  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  0.995806 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0393  enoyl-CoA hydratase  73.96 
 
 		 295 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.350305  normal  0.0100997 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1350  enoyl-CoA hydratase  73.21 
 
 		 275 aa  381  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6254  enoyl-CoA hydratase  73.96 
 
 		 275 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0484  enoyl-CoA hydratase  72.93 
 
 		 295 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.056437 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2823  enoyl-CoA hydratase  73.96 
 
 		 275 aa  381  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.40925 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4233  enoyl-CoA hydratase  72.93 
 
 		 295 aa  381  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2960  enoyl-CoA hydratase  73.96 
 
 		 275 aa  381  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0080  enoyl-CoA hydratase  71.48 
 
 		 275 aa  380  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0603  enoyl-CoA hydratase  72.83 
 
 		 326 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.383469  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0439  enoyl-CoA hydratase  72.83 
 
 		 275 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0420  enoyl-CoA hydratase  72.83 
 
 		 275 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.411652  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2911  enoyl-CoA hydratase  73.58 
 
 		 275 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210869  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2297  enoyl-CoA hydratase  73.58 
 
 		 275 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201677  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0363  enoyl-CoA hydratase  77.68 
 
 		 249 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2162  enoyl-CoA hydratase  65.31 
 
 		 273 aa  328  5.0000000000000004e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7280  enoyl-CoA hydratase  61.6 
 
 		 281 aa  318  6e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.83721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2750  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.31 
 
 		 268 aa  303  2.0000000000000002e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3993  enoyl-CoA hydratase  68.72 
 
 		 260 aa  303  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169816  normal  0.366348 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3006  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.7 
 
 		 269 aa  300  1e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12694  enoyl-CoA hydratase  54.68 
 
 		 276 aa  281  8.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1633  enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.47 
 
 		 266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5283  enoyl-CoA hydratase  50.56 
 
 		 267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1822  enoyl-CoA hydratase  50.93 
 
 		 269 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0818763  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0287  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.37 
 
 		 270 aa  248  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0921872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1014  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.02 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.108431 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.22 
 
 		 267 aa  155  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.84 
 
 		 264 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0354  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.85 
 
 		 263 aa  151  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000842665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1991  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.12 
 
 		 264 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.19767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6511  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.305352  normal  0.309603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1700  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.63 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.672867  hitchhiker  0.0000387176 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.574629 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4150  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.01 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.135617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0515  enoyl-CoA hydratase  35.24 
 
 		 266 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.57 
 
 		 258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4486  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.31 
 
 		 258 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4399  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.31 
 
 		 258 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2705  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.89 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0321  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  31.65 
 
 		 279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.303532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  31.64 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  28.35 
 
 		 265 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  28.97 
 
 		 262 aa  108  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1840  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4253  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.08 
 
 		 254 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  30.7 
 
 		 257 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.73 
 
 		 254 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3339  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.8 
 
 		 253 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  30.43 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.63 
 
 		 266 aa  103  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  27.24 
 
 		 265 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.55 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6922  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.17 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  30.13 
 
 		 262 aa  99.8  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.76 
 
 		 260 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  27.78 
 
 		 264 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.78 
 
 		 273 aa  99.4  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3726  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.91 
 
 		 258 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452007  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.32 
 
 		 266 aa  99.4  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.65 
 
 		 264 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0368  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.84 
 
 		 248 aa  97.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.585448  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6835  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.74 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.31 
 
 		 267 aa  96.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 269 aa  96.3  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  31.67 
 
 		 266 aa  95.9  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  29.24 
 
 		 259 aa  95.9  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.74 
 
 		 260 aa  95.9  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  27.31 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  29.25 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  35.85 
 
 		 276 aa  94.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0151  enoyl-CoA hydratase  32.11 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.28 
 
 		 268 aa  94.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  26.09 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  28.91 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.91 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.6 
 
 		 257 aa  93.2  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  26.29 
 
 		 264 aa  93.2  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.06 
 
 		 287 aa  93.2  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.02 
 
 		 258 aa  92.8  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.49 
 
 		 254 aa  92.4  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  32.1 
 
 		 263 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.08 
 
 		 269 aa  92  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.79 
 
 		 264 aa  92  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  29.64 
 
 		 258 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.89 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  30.19 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  30.6 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  33.91 
 
 		 266 aa  90.5  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>