39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1913 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4143  amidohydrolase 2  69.43 
 
 		 509 aa  739    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0344533 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1913  amidohydrolase 2  100 
 
 		 505 aa  1036    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  26.18 
 
 		 367 aa  55.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  31.58 
 
 		 396 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  26.22 
 
 		 368 aa  53.5  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  22.94 
 
 		 396 aa  53.5  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  24.64 
 
 		 392 aa  53.5  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  22.15 
 
 		 396 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  24.1 
 
 		 392 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  26.52 
 
 		 335 aa  52.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  22.55 
 
 		 394 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  21.59 
 
 		 409 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  21.14 
 
 		 409 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  26.96 
 
 		 410 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  21.97 
 
 		 409 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  21.97 
 
 		 409 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  21.97 
 
 		 409 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  28.18 
 
 		 392 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  32.28 
 
 		 398 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  21.64 
 
 		 429 aa  49.3  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  25.45 
 
 		 393 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  22.07 
 
 		 345 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  24.12 
 
 		 325 aa  47  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7182  amidohydrolase 2  30.36 
 
 		 400 aa  47  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  25.65 
 
 		 396 aa  47  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  25.65 
 
 		 396 aa  47  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.51 
 
 		 339 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  24.71 
 
 		 404 aa  46.6  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  26.7 
 
 		 361 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  28.49 
 
 		 364 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  23.83 
 
 		 365 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  31.65 
 
 		 441 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  35.37 
 
 		 398 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  26.92 
 
 		 389 aa  44.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  23.78 
 
 		 388 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  20.25 
 
 		 386 aa  43.5  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.4 
 
 		 350 aa  43.5  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  32.22 
 
 		 399 aa  43.1  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  25.83 
 
 		 354 aa  43.5  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>