79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1512 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1512  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  100 
 
 		 152 aa  310  3.9999999999999997e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1827  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  56.93 
 
 		 148 aa  157  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3950  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  54.14 
 
 		 143 aa  157  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0822744 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3837  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  54.14 
 
 		 143 aa  157  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.488766 
 
 
-
 
NC_003296  RS02013  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  52.27 
 
 		 136 aa  151  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0657  thioesterase superfamily protein  50.74 
 
 		 140 aa  147  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0277  putative 4-hydroxybenzoyl CoA thioesterase  51.8 
 
 		 147 aa  144  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7163  thioesterase superfamily protein  50.36 
 
 		 147 aa  144  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0500589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4073  thioesterase superfamily protein  51.91 
 
 		 147 aa  137  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1590  thioesterase superfamily protein  43.61 
 
 		 144 aa  120  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.228465  hitchhiker  0.00903187 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4467  thioesterase superfamily protein  43.7 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192711 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0821  thioesterase superfamily protein  43.18 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2690  thioesterase superfamily protein  40.6 
 
 		 137 aa  100  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3245  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.86 
 
 		 145 aa  100  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398056  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2179  thioesterase superfamily protein  37.88 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2197  thioesterase superfamily protein  38.1 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021618  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2232  thioesterase superfamily protein  36.92 
 
 		 134 aa  88.2  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5092  thioesterase superfamily protein  35.11 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.144651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0588  thioesterase superfamily protein  33.82 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3622  thioesterase superfamily protein  30.88 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.22745 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1329  thioesterase superfamily protein  37.31 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.866642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2192  thioesterase superfamily protein  33.81 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.947686  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0777  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0740  thioesterase superfamily protein  26.15 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0509002  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0777  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2808  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.511725  hitchhiker  0.00696789 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6462  thioesterase superfamily protein  29.58 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14220  4-hydroxybenzoyl CoA thioesterase  30 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126924  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1990  thioesterase superfamily protein  27.14 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0483278  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3016  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.396701 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2312  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2489  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115223  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7090  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3100  thioesterase-like  29.66 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3039  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.71 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4381  thioesterase superfamily protein  27.2 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1359  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.195734  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1888  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3023  thioesterase superfamily protein  31.06 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3576  thioesterase superfamily protein  26.37 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  26.87 
 
 		 286 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1744  hypothetical protein  30.23 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0304185  normal  0.745927 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01931  thioesterase  24.81 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.976791  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1931  thioesterase superfamily protein  22.54 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.46 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4124  hypothetical protein  25.53 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4370  thioesterase superfamily protein  25.98 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.327633  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.98 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  24.17 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2435  hypothetical protein  27.89 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2063  thioesterase-like  24.63 
 
 		 314 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.529459 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3500  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.06 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.076356 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0673  putative thioesterase  29.46 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0436073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2326  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.46 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.91 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164673  normal  0.152655 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2027  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.56 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0763  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.65 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21776  normal  0.179555 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2451  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.29 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1848  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149836  normal  0.418825 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0674  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 		 143 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.712036 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0175  hypothetical protein  23.31 
 
 		 150 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.883072  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 		 135 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  30.08 
 
 		 130 aa  42.4  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.64 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92060  predicted protein  22.73 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.691769  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.64 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2812  thioesterase superfamily protein  21.74 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  26.87 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3458  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1390  thioesterase superfamily protein  25.3 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27301  thioesterase  29.25 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01911  thioesterase  23.31 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4902  thioesterase-like  24.29 
 
 		 165 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3205  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25.35 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.473316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  26.56 
 
 		 154 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>