70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0361 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0361  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 202 aa  411  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5435  Methyltransferase type 12  52.24 
 
 		 202 aa  204  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0879885  hitchhiker  0.0072084 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  37.02 
 
 		 440 aa  82.4  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  32.16 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  33.93 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0687  Methyltransferase type 12  35.98 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.557107 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  25.5 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  32.73 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  30.86 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  27.84 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  31.94 
 
 		 1287 aa  62.4  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  29.52 
 
 		 214 aa  62  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  29.52 
 
 		 214 aa  62  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  30.6 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  27.95 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  28.07 
 
 		 250 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  26.56 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  32.82 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  27.56 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  28 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  29.93 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  27.05 
 
 		 364 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  22.06 
 
 		 575 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.71 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  23.44 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  25.37 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0572  methyltransferase type 11  25 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  27.03 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2658  O-methyltransferase family 2  37.14 
 
 		 338 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  26.4 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  30 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  29.03 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  30.37 
 
 		 209 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1089  hypothetical protein  26.21 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1131  hypothetical protein  26.21 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00128  Methyltransferase type 11  22 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000851543  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  25.15 
 
 		 222 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5472  hypothetical protein  26.97 
 
 		 212 aa  44.7  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  26.11 
 
 		 209 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  22.07 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0330  hypothetical protein  26.19 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  normal  0.271742 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  29.87 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0524  methyltransferase type 11  34.35 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  32.05 
 
 		 200 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1197  methyltransferase type 12  26.51 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.500309 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  23.48 
 
 		 222 aa  42.4  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01393  hypothetical protein  27.93 
 
 		 535 aa  42.4  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  29.24 
 
 		 276 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  34.69 
 
 		 225 aa  42.4  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  21.7 
 
 		 263 aa  42  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1679  hypothetical protein  33.64 
 
 		 205 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756736  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  28.82 
 
 		 305 aa  41.6  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2181  hypothetical protein  33.64 
 
 		 205 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3136  hypothetical protein  33.64 
 
 		 205 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.944578  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2620  hypothetical protein  33.04 
 
 		 205 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1454  hypothetical protein  33.64 
 
 		 205 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.64865  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  27.72 
 
 		 311 aa  41.6  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2566  hypothetical protein  33.04 
 
 		 205 aa  41.6  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4739  Methyltransferase type 11  28.07 
 
 		 218 aa  41.6  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.27 
 
 		 217 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  25.57 
 
 		 199 aa  41.6  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  28.33 
 
 		 222 aa  41.2  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  29.66 
 
 		 234 aa  41.2  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  25 
 
 		 208 aa  41.2  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  22.22 
 
 		 192 aa  41.2  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  25.6 
 
 		 203 aa  41.2  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>