More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0315 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0315  putative response regulator  100 
 
 		 576 aa  1168    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.601639  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2074  response regulator receiver domain-containing protein  24.45 
 
 		 551 aa  83.6  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1458  response regulator receiver protein  28.86 
 
 		 416 aa  82  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.893415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01935  Response regulator with TPR repeat  30.37 
 
 		 546 aa  74.7  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1457  response regulator receiver protein  22.82 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05651  hypothetical protein  22.63 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4261  response regulator receiver domain-containing protein  31.33 
 
 		 534 aa  70.5  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.143411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0359  putative PAS/PAC sensor protein  23.31 
 
 		 560 aa  69.7  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1911  response regulator/TPR domain protein  28.76 
 
 		 533 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.014975  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0809  response regulator receiver protein  30 
 
 		 535 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0768  response regulator/TPR domain-containing protein  30 
 
 		 535 aa  67  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0795  response regulator receiver protein  30 
 
 		 535 aa  67  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184844 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3496  TPR repeat-containing response regulator  28.1 
 
 		 533 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0041  response regulator  28.68 
 
 		 535 aa  65.9  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1257  response regulator VieB  26 
 
 		 553 aa  65.1  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00784807  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01904  CheY-like receiver protein  29.93 
 
 		 533 aa  64.7  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.466885  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2920  response regulator receiver protein  22.76 
 
 		 538 aa  63.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0284416  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0477  response regulator receiver domain-containing protein  27.19 
 
 		 537 aa  62.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4421  response regulator receiver protein  29.33 
 
 		 535 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2107  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 768 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0897  response regulator receiver protein  22.08 
 
 		 546 aa  61.6  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4101  response regulator receiver:tetratricopeptide TPR_4  21.37 
 
 		 572 aa  61.6  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06171  hypothetical protein  25.76 
 
 		 555 aa  61.6  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2579  response regulator receiver protein  21.9 
 
 		 547 aa  61.2  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2318  response regulator receiver protein  21.24 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  24.59 
 
 		 127 aa  60.5  0.00000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  25.6 
 
 		 1763 aa  59.7  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  26.83 
 
 		 130 aa  59.3  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1176  response regulator receiver protein  25.68 
 
 		 540 aa  59.3  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0885  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 127 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123702  hitchhiker  0.00202919 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2540  response regulator receiver  29.37 
 
 		 131 aa  58.5  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1169  two component transcriptional regulator, AraC family  23.13 
 
 		 549 aa  58.5  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1854  response regulator receiver domain-containing protein  26.49 
 
 		 549 aa  58.2  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.274781 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2924  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 470 aa  57.4  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.777319  hitchhiker  0.0000000000564278 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3160  response regulator receiver domain-containing protein  28.57 
 
 		 131 aa  57.4  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  30.88 
 
 		 1765 aa  57.4  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2668  response regulator receiver protein  28.12 
 
 		 675 aa  57.4  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0419  response regulator receiver  29.66 
 
 		 127 aa  57.4  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487855  normal  0.449259 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0489  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 127 aa  57.4  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514722 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0452  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 127 aa  57.4  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0577794  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.66 
 
 		 1767 aa  57.4  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0388  response regulator receiver protein  29.06 
 
 		 127 aa  57  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.66 
 
 		 1767 aa  57.4  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0010  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 		 508 aa  57  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0502065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2223  response regulator receiver protein  29.06 
 
 		 127 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0738  response regulator receiver protein  32.43 
 
 		 227 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000561574  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1181  response regulator receiver domain-containing protein  26.61 
 
 		 131 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0518  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  29.84 
 
 		 129 aa  55.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150153  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1285  response regulator receiver  26.61 
 
 		 131 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0521811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1366  response regulator receiver protein  26.61 
 
 		 131 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280194  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3407  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.35 
 
 		 458 aa  56.2  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0610  response regulator receiver protein  27.12 
 
 		 128 aa  55.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.667708  normal  0.178716 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1179  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 457 aa  56.2  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.655382  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.42 
 
 		 1771 aa  55.5  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0598  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  23.26 
 
 		 470 aa  55.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 		 841 aa  55.5  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2092  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 462 aa  55.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2459  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  26.02 
 
 		 335 aa  54.7  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.685644  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57140  putative two-component response regulator  27.56 
 
 		 366 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0897  response regulator receiver domain-containing protein  27.56 
 
 		 131 aa  54.7  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.13034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.2 
 
 		 1767 aa  54.7  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4967  putative two-component response regulator  28.21 
 
 		 321 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  23.39 
 
 		 129 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  23.39 
 
 		 129 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  23.39 
 
 		 129 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3903  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  25.98 
 
 		 455 aa  53.9  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000574971 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0947  response regulator receiver protein  25.9 
 
 		 539 aa  53.9  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00824863  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  23.39 
 
 		 129 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  23.39 
 
 		 129 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  23.39 
 
 		 129 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  23.39 
 
 		 129 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  23.39 
 
 		 129 aa  53.9  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0145  response regulator receiver:tetratricopeptide TPR_4  26.45 
 
 		 449 aa  53.5  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3647  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 471 aa  53.9  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0209004  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0904  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  24.16 
 
 		 479 aa  53.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14803  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  22.83 
 
 		 129 aa  53.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  22.76 
 
 		 129 aa  53.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  22.83 
 
 		 129 aa  53.5  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4715  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.41 
 
 		 466 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.112239  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  23.39 
 
 		 129 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0598  response regulator receiver and unknown domain protein  28.68 
 
 		 223 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00972259 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  23.39 
 
 		 129 aa  53.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  23.39 
 
 		 129 aa  52.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0092  response regulator receiver protein  27.12 
 
 		 682 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.79 
 
 		 223 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2578  response regulator receiver protein  21.07 
 
 		 577 aa  52.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000176794 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1397  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  29.63 
 
 		 228 aa  52.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362742  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  23.39 
 
 		 129 aa  52.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0008  sensory box histidine kinase/response regulator  26.43 
 
 		 516 aa  52  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 		 386 aa  52  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3669  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.77 
 
 		 432 aa  52  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3002  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.69 
 
 		 1234 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2521  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.57 
 
 		 457 aa  51.6  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2718  two component signal transduction response regulator  28.24 
 
 		 467 aa  51.6  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3819  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  25.2 
 
 		 455 aa  51.6  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.785821  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2539  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 487 aa  51.6  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.846517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2828  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 410 aa  51.2  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0812  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 453 aa  51.2  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0257022  hitchhiker  0.00000328811 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.57 
 
 		 819 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02206  hypothetical protein  28.57 
 
 		 827 aa  51.2  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>