37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0061 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0061  exported glycosyl hydrolase, family 16  100 
 
 		 264 aa  551  1e-156  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.558429  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2751  glycoside hydrolase family protein  39.08 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  35.5 
 
 		 334 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4600  glycoside hydrolase family protein  27.73 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2802  b-glucosidase  35.43 
 
 		 345 aa  95.5  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.790099  normal  0.396341 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4955  glycoside hydrolase family protein  26.92 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126867 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5929  endo-1,3-1,4-beta-glycanase  25.74 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1972  glycoside hydrolase family protein  25.11 
 
 		 260 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4988  glycoside hydrolase family protein  29.15 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3662  glycoside hydrolase family protein  26.14 
 
 		 593 aa  73.2  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2550  endo-beta-1,3-1,4-glycanase protein  24.66 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1209  licheninase  24.2 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0812437 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0648  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_25832  cell wall protein in family of putative glycosidases Probable xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase  20.43 
 
 		 413 aa  58.9  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.623887  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06948  putative transglycosidase, GH16 family (Eurofung)  26.92 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03053  putative transglycosidase, GH16 family (Eurofung)  23.44 
 
 		 364 aa  55.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.736555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1939  glycoside hydrolase family 16  26.52 
 
 		 566 aa  53.9  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600804  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05790  cell wall organization and biogenesis-related protein, putative  24.68 
 
 		 376 aa  52.4  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04515  putative transglycosidase, GH16 family (Eurofung)  25.69 
 
 		 435 aa  50.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000384453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2605  glycoside hydrolase family protein  27.91 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  24.66 
 
 		 467 aa  48.9  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40512  predicted protein  29.63 
 
 		 346 aa  48.9  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00933  extracellular cell wall glucanase Crf1/allergen Asp F9 (AFU_orthologue; AFUA_1G16190)  24.19 
 
 		 405 aa  48.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0489883  normal  0.840082 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 1321 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2825  glycoside hydrolase family protein  27.94 
 
 		 492 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  27.69 
 
 		 907 aa  46.6  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  26.62 
 
 		 1918 aa  46.2  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  28 
 
 		 320 aa  46.2  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_4167  predicted protein  21.59 
 
 		 248 aa  45.8  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.512731 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  30.23 
 
 		 608 aa  45.4  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  24.14 
 
 		 475 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.78 
 
 		 912 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  24.14 
 
 		 475 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  27.87 
 
 		 883 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0863  glycoside hydrolase family 16  26.03 
 
 		 842 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  27.27 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  24.52 
 
 		 306 aa  43.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>