243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2296 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2296  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 		 260 aa  516  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03149  flagellar biosynthesis protein FliR  78.46 
 
 		 260 aa  418  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002827  flagellar biosynthesis protein FliR  77.69 
 
 		 260 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1703  flagellar biosynthesis protein FliR  76.15 
 
 		 260 aa  404  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  51.92 
 
 		 265 aa  251  7e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  51.15 
 
 		 265 aa  249  5e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  51.15 
 
 		 265 aa  248  7e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  51.15 
 
 		 265 aa  248  7e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  50.77 
 
 		 265 aa  247  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  47.31 
 
 		 265 aa  246  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  50.38 
 
 		 265 aa  245  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  50.38 
 
 		 265 aa  245  4e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1373  flagellar biosynthesis protein FliR  48.08 
 
 		 266 aa  246  4e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  50.38 
 
 		 265 aa  245  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  50 
 
 		 265 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  49.2 
 
 		 267 aa  236  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  46.92 
 
 		 262 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  48.19 
 
 		 267 aa  235  7e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  48.39 
 
 		 265 aa  232  5e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1630  flagellar biosynthesis protein FliR  46.25 
 
 		 261 aa  222  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  44.44 
 
 		 260 aa  219  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  43.63 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3035  flagellar biosynthesis protein FliR  44.02 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  47.03 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  41.7 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  41.7 
 
 		 258 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  39 
 
 		 261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  42.11 
 
 		 258 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  46.12 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  42.11 
 
 		 258 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  43.32 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3879  flagellar biosynthesis protein FliR  42.41 
 
 		 258 aa  168  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  36.99 
 
 		 247 aa  168  9e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  41.92 
 
 		 258 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4353  flagellar biosynthesis protein FliR  41.94 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  42.22 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  37.17 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  35.66 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  34.7 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  36.91 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  36.29 
 
 		 258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  36.44 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  34.48 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2160  flagellar biosynthesis protein FliR  43 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001178  flagellar biosynthesis protein FliR  38.21 
 
 		 258 aa  138  7.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.795861  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3432  flagellar biosynthetic protein FliR  37 
 
 		 260 aa  137  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  35.05 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1966  flagellar biosynthetic protein FliR  40.74 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  33.19 
 
 		 264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04965  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  36.28 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3483  flagellar biosynthetic protein FliR  35.19 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3666  flagellar biosynthetic protein FliR  38.94 
 
 		 259 aa  132  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  37.04 
 
 		 262 aa  132  6.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0085  flagellar biosynthetic protein FliR  34.76 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  34.7 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1751  flagellar biosynthetic protein fliR  33.33 
 
 		 256 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1751  flagellar biosynthetic protein fliR  33.33 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  34.55 
 
 		 261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  38.43 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  33.64 
 
 		 261 aa  126  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  32.88 
 
 		 260 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2404  flagellar biosynthesis protein FliR  33.77 
 
 		 260 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.688451  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2304  flagellar biosynthesis protein FliR  33.77 
 
 		 260 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  32.62 
 
 		 261 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  33.8 
 
 		 260 aa  122  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  31.25 
 
 		 260 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  31.25 
 
 		 260 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  31.25 
 
 		 260 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1261  flagellar biosynthesis protein FliR  35.94 
 
 		 264 aa  121  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0910889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  31.7 
 
 		 260 aa  121  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1564  flagellar biosynthetic protein FliR  35.45 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1138  flagellar biosynthesis protein FliR  35.94 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000910874  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2144  flagellar biosynthesis protein FliR  35.48 
 
 		 264 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  hitchhiker  0.00457903 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2197  flagellar biosynthesis protein FliR  35.48 
 
 		 264 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103622  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2139  flagellar biosynthesis protein FliR  35.48 
 
 		 264 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19844  normal  0.226973 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3682  flagellar biosynthetic protein FliR  33.79 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0756404  normal  0.879793 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4759  flagellar biosynthetic protein FliR  33.79 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0696365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2183  flagellar biosynthesis protein FliR  35.68 
 
 		 261 aa  119  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000259397  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2727  flagellar biosynthesis protein FliR  36.53 
 
 		 261 aa  119  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00116197  normal  0.508279 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2050  flagellar biosynthesis protein FliR  36.53 
 
 		 261 aa  119  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000709328  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1234  flagellar biosynthesis protein FliR  35.68 
 
 		 261 aa  119  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000114634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24110  flagellar biosynthetic protein  34.29 
 
 		 264 aa  119  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1698  flagellar biosynthetic protein FliR  36.53 
 
 		 261 aa  118  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412821  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1692  flagellar biosynthesis protein FliR  35.68 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000555568  normal  0.0138418 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4424  flagellar biosynthetic protein FliR  35.02 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.926319 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1071  flagellar biosynthesis protein FliR  34.8 
 
 		 261 aa  117  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309979  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0373  flagellar biosynthetic fliR transmembrane protein  32.88 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0153  flagellar biosynthesis protein FliR  31.96 
 
 		 260 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800809 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3219  flagellar biosynthesis protein FliR  32.14 
 
 		 260 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  32.72 
 
 		 264 aa  112  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2684  flagellar biosynthetic protein FliR  34.08 
 
 		 260 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  34.08 
 
 		 260 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  34.08 
 
 		 260 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  34.08 
 
 		 260 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  34.08 
 
 		 260 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  34.08 
 
 		 260 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0215  flagellar biosynthetic protein FliR  31.37 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.598232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0245  flagellar biosynthetic protein FliR  33.63 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0032  flagellar biosynthetic protein FliR  32.58 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  29.37 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>