More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0452 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0452  putative glycosyl transferase  100 
 
 		 332 aa  679    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3554  glycosyl transferase family 2  64.44 
 
 		 329 aa  436  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.200701  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3178  glycosyl transferase family protein  58.36 
 
 		 329 aa  421  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0590  glycosyl transferase family 2  62.01 
 
 		 329 aa  414  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4359  glycosyl transferase family protein  37.23 
 
 		 332 aa  220  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.947946 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1887  glycosyl transferase family protein  35.24 
 
 		 360 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.95114  normal  0.84589 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0383  glycosyl transferase family protein  34.76 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0248  glycosyl transferase family 2  34.63 
 
 		 348 aa  206  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.617572 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2880  glycosyl transferase family protein  35.56 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.764984  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0484  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2046  glycosyl transferase family 2  25.08 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5290  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 334 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0149  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.473763 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4255  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1427  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.45 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1005  putative glycosyl transferase, group 2 family protein  27.92 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2397  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  26.38 
 
 		 752 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2550  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.324951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2908  glycosyl transferase family protein  25.36 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.928359 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0316  glycosyl transferase family protein  25.47 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  24.68 
 
 		 1099 aa  66.2  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3565  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  25.74 
 
 		 822 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1661  glycosyl transferase family protein  24.73 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3137  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.99 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2577  glycosyl transferase family protein  23.99 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4464  glycosyl transferase family 2  26.18 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.78 
 
 		 1115 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  27.78 
 
 		 927 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  27.54 
 
 		 1115 aa  63.9  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  27.78 
 
 		 1119 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  27.41 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  25.61 
 
 		 872 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  28.47 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  27.6 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1965  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000341692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  25.37 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1009  glycosyl transferase family protein  23.25 
 
 		 410 aa  62.4  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal  0.902987 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 306 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5289  glycosyl transferase family 2  25.37 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  22.77 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.92 
 
 		 1115 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  22.77 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  23.89 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  23.89 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  22.04 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  22.04 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  22.04 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  22.04 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  22.04 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2718  glycosyl transferase family protein  23.33 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.543733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  22.04 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.92 
 
 		 1115 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  22.04 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  37 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  23.45 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  28.39 
 
 		 461 aa  59.3  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1813  glycosyl transferase family protein  22.92 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  23.88 
 
 		 253 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  38.61 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  24.51 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  24.75 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  27.84 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  34.74 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0011  glycosyl transferase family 2  32.54 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000912491 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  25.57 
 
 		 785 aa  57.4  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2855  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3382  putative glycosyl transferase, group 2 family protein  32.52 
 
 		 225 aa  57  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.204913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  38.3 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  34.17 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  36.19 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  26.63 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 		 358 aa  56.2  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  26.98 
 
 		 838 aa  55.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3115  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 		 235 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2961  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  30.93 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.720485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  23.72 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  24.29 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2563  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 		 329 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3022  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.9 
 
 		 773 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 		 274 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  28.1 
 
 		 236 aa  55.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.44 
 
 		 312 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 		 346 aa  54.7  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  21.4 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 		 221 aa  54.7  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  23.36 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  21.61 
 
 		 418 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1747  glycosyl transferase family protein  37.11 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4794  glycosyl transferase family protein  24.65 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4562  glycosyl transferase family protein  23.14 
 
 		 651 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.829181  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  24.05 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4945  glycosyl transferase family protein  23.14 
 
 		 651 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420909  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4650  glycosyl transferase family protein  23.14 
 
 		 651 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.492865  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>