More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0140 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0140  iron-siderophore ABC transporter, membrane permease component  100 
 
 		 341 aa  656    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2542  transport system permease protein  43.75 
 
 		 346 aa  215  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.805909  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3185  ferric enterobactin ABC transporter permease FepG  43.45 
 
 		 346 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0655779 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2443  ferric enterobactin ABC transporter, permease protein FepG  43.81 
 
 		 346 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06490  ABC-type enterobactin transport system, permease component  42.47 
 
 		 371 aa  180  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.830373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1493  putative ferrichrome transport system permease protein  40.6 
 
 		 346 aa  162  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0887097  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3069  ferric enterobactin transport system permease protein FepG  37.65 
 
 		 346 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.605614  normal  0.369476 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06009  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  35.62 
 
 		 323 aa  156  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  37.59 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1622  transport system permease protein  35.62 
 
 		 366 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2422  transport system permease protein  38.56 
 
 		 355 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000852426  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001071  ferrichrome ABC transporter (permease) PvuD  38.99 
 
 		 323 aa  149  8e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0141  transport system permease protein  34.87 
 
 		 346 aa  146  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3534  transport system permease protein  38.15 
 
 		 350 aa  146  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5946  transport system permease protein  36.51 
 
 		 356 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0307  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  34.23 
 
 		 358 aa  144  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1775  iron compound ABC transporter, permease protein  33.65 
 
 		 321 aa  142  6e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2205  transport system permease protein  40.36 
 
 		 363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  hitchhiker  0.000202612 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.29 
 
 		 678 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1240  transport system permease protein  37.31 
 
 		 356 aa  140  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.6 
 
 		 678 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  32.53 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.29 
 
 		 678 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  35.64 
 
 		 326 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.29 
 
 		 678 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  31.38 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4642  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.29 
 
 		 678 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0598  iron-hydroxamate transporter permease subunit  32.29 
 
 		 678 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0426  transport system permease protein  33.23 
 
 		 355 aa  136  5e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.459391 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1121  iron-enterobactin transporter permease  34.43 
 
 		 330 aa  135  8e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  31.63 
 
 		 338 aa  135  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  31.23 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  31.33 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  31.33 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  31.33 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  31.33 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  31.33 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3784  transport system permease protein  36.25 
 
 		 339 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764686 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0337  ABC-type enterobactin transport system inner membrane subunit  41.16 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738203  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5110  iron-enterobactin transporter permease  32.89 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  31.33 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4265  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.97 
 
 		 678 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  31.33 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02580  ABC-type enterobactin transport system, permease component  35.26 
 
 		 365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.549051  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04154  iron-dicitrate transporter subunit  35.35 
 
 		 318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3712  transport system permease protein  35.35 
 
 		 318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2436  transport system permease protein  37.22 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.237852  unclonable  0.000000000541078 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4865  iron-dicitrate transporter subunit FecD  35.35 
 
 		 318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04117  hypothetical protein  35.35 
 
 		 318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20800  ABC-type enterobactin transport system, permease component  33.99 
 
 		 319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0104  transport system permease protein  31.89 
 
 		 332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000364541  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0740  iron-dicitrate transporter subunit FecD  35.35 
 
 		 318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0100  transport system permease protein  31.89 
 
 		 332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0102196  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  31.55 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06008  hypothetical protein  37.93 
 
 		 338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2721  transport system permease protein  33.1 
 
 		 338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  31.46 
 
 		 362 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  31.92 
 
 		 340 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1629  transport system permease protein  38.79 
 
 		 350 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.286622  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  31.55 
 
 		 338 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5335  transport system permease protein  36.33 
 
 		 361 aa  129  8.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  34.86 
 
 		 353 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2690  transport system permease protein  33.12 
 
 		 354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.027159  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3152  transport system permease protein  35.07 
 
 		 346 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309752  hitchhiker  0.000000000937793 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2244  transport system permease protein  35.26 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0779232  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2828  iron-hydroxamate transporter permease subunit  37.32 
 
 		 644 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.633423  normal  0.836488 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2206  transport system permease protein  35.26 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.690044  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5054  transport system permease protein  38.59 
 
 		 343 aa  126  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0691  iron-dicitrate transporter subunit FecD  32.6 
 
 		 318 aa  126  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  39.27 
 
 		 334 aa  126  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10140  ferric enterobactin transport protein FepG  35.69 
 
 		 343 aa  126  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00034947  normal  0.925248 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  33.88 
 
 		 352 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1325  transport system permease protein  40.73 
 
 		 344 aa  125  9e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0256  transport system permease protein  33.57 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000493486  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4082  transport system permease protein  32.53 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.08527  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 		 352 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  32.27 
 
 		 346 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3638  transport system permease protein  32.8 
 
 		 346 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0879302  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  33.22 
 
 		 352 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  33.22 
 
 		 352 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  33.22 
 
 		 352 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  33.22 
 
 		 352 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0415  transport system permease protein  34.29 
 
 		 346 aa  124  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 		 352 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  32.57 
 
 		 352 aa  123  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00556  iron-enterobactin transporter subunit  33.94 
 
 		 330 aa  122  8e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.969971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0463  hemin permease  32.87 
 
 		 351 aa  122  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00545  hypothetical protein  33.94 
 
 		 330 aa  122  8e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4683  iron compound ABC transporter, permease protein  32.9 
 
 		 352 aa  122  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.106219  hitchhiker  2.60339e-21 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2439  transport system permease protein  40 
 
 		 353 aa  122  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.107589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  29.97 
 
 		 337 aa  122  9e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  33.54 
 
 		 351 aa  122  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1524  transport system permease protein  35.03 
 
 		 329 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2821  transport system permease protein  31.92 
 
 		 322 aa  122  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2407  transport system permease protein  32.11 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0745  iron compound ABC transporter, permease protein  32.9 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  29.65 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3381  transport system permease protein  32.49 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0609  iron-enterobactin transporter permease  33.94 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0491  iron-enterobactin transporter permease  33.94 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>