217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03061 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  193  8.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  58.51 
 
 
94 aa  114  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.85 
 
 
96 aa  101  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3867  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
95 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0190712 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.48 
 
 
99 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.47 
 
 
96 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.63 
 
 
102 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.04 
 
 
96 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.1 
 
 
95 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.63 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  35.48 
 
 
102 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.68 
 
 
94 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  39.24 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06652  hypothetical protein  41.67 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.22 
 
 
99 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1676  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.27 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510049  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1568  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  38.27 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0401  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  38.27 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0712142 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1481  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.03 
 
 
95 aa  63.9  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0336514  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.2 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 
96 aa  63.5  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0579  hypothetical protein  41.67 
 
 
96 aa  63.9  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  29.03 
 
 
96 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2954  hypothetical protein  38.2 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19352  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.44 
 
 
100 aa  63.5  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.57 
 
 
96 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.57 
 
 
96 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.57 
 
 
96 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1827  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.97 
 
 
99 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  37.97 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.023578 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.57 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1332  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 
101 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2964  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  37.97 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3036  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.97 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.398194  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.65 
 
 
97 aa  61.6  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.97 
 
 
96 aa  62  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 
96 aa  61.6  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1588  hypothetical protein  34.18 
 
 
96 aa  61.6  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.113304  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.91 
 
 
95 aa  61.6  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.56 
 
 
99 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1064  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.06 
 
 
98 aa  61.6  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.06 
 
 
96 aa  61.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.89 
 
 
96 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  31.25 
 
 
96 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.08 
 
 
99 aa  60.5  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.14 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.47 
 
 
100 aa  60.1  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.18 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.65 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.57 
 
 
95 aa  60.1  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1341  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.47 
 
 
97 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000990152 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.44 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  38.57 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.24 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2954  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.18 
 
 
112 aa  58.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3005  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35 
 
 
101 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.89 
 
 
97 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.18 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.37 
 
 
106 aa  57.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.18 
 
 
95 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  33.33 
 
 
98 aa  57.4  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.72 
 
 
95 aa  57.4  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3840  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.54 
 
 
108 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3966  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.54 
 
 
108 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.51 
 
 
98 aa  57  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.63 
 
 
95 aa  57  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0485  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.54 
 
 
108 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3784  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.54 
 
 
108 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0405  hypothetical protein  41.94 
 
 
105 aa  57  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  46.3 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0525  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.94 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  46.3 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.71 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0527  hypothetical protein  40.32 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.11 
 
 
99 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.71 
 
 
104 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3337  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.54 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0502  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.22 
 
 
105 aa  54.7  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0748707  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4266  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
99 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.326536  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0538  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.09 
 
 
106 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.894063  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  30.77 
 
 
96 aa  52.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4798  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.78 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0786747  hitchhiker  0.00170038 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5441  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.25 
 
 
114 aa  52.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0526  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.71 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3506  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.46 
 
 
108 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.55 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2003  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.86 
 
 
98 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.72 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1604  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.03 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714924  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10809  hypothetical protein  28.89 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000694209  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2512  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.65 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344542  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  34.29 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2501  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.1 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180823  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.46 
 
 
94 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1910  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.68 
 
 
107 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.72 
 
 
107 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 
103 aa  51.6  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.4 
 
 
114 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1144  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.76 
 
 
107 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.976851  normal  0.57363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>