More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02503 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02503  ferredoxin  100 
 
 
165 aa  338  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1452  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.84 
 
 
189 aa  97.8  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1340  putative ferredoxin-type protein NapF  35.84 
 
 
189 aa  97.1  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2720  putative ferredoxin-type protein NapF  35.84 
 
 
189 aa  97.1  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0610  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.84 
 
 
209 aa  87.4  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.260421  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4000  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  35.58 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.692634 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1593  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  34.29 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5178  ferredoxin-type protein NapF  30.86 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.818564  normal  0.868281 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05379  ferredoxin-type protein  36.2 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2368  ferredoxin-type protein NapF  33.33 
 
 
172 aa  79  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.957681  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0615  iron-sulfur cluster-binding protein NapF  34.19 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1712  ferredoxin-type protein NapF  31.06 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00359598  normal  0.496256 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1432  ferredoxin-type protein NapF  32.73 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.390259 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000511  nitrate reductase  36.81 
 
 
161 aa  79  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1663  ferredoxin-type protein NapF  30.91 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2764  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.58 
 
 
211 aa  73.9  0.0000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.936882 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2933  ferredoxin-type protein NapF  31.48 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000053627  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2610  ferredoxin-type protein NapF  30.3 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.326175  hitchhiker  0.000000545081 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2677  ferredoxin-type protein NapF  30.3 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131835  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1326  ferredoxin-type protein NapF  31.01 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2784  ferredoxin-type protein NapF  30.91 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.9279  hitchhiker  0.000480705 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3988  hypothetical protein  30.38 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0935811  normal  0.360541 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1445  ferredoxin-type protein NapF  32.92 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000171683  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49220  ferredoxin protein NapF  32.08 
 
 
163 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.36196  hitchhiker  0.00430686 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1512  ferredoxin-type protein NapF  28.66 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0688671  normal  0.812249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4203  ferredoxin protein NapF  31.85 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.197134  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2871  ferredoxin-type protein NapF  29.01 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  hitchhiker  0.000000902156 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1271  ferredoxin-type protein NapF  30.77 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.853171  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1383  ferredoxin-type protein NapF  28.66 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2793  ferredoxin-type protein NapF  30.77 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.167014 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1385  ferredoxin-type protein NapF  30.77 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.570523  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1476  ferredoxin-type protein NapF  28.66 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000676016  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1481  ferredoxin-type protein NapF  28.66 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000195514  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0116  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.5 
 
 
247 aa  67.8  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3224  hypothetical protein  33.77 
 
 
163 aa  67  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1157  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.63 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0986005  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3488  ferredoxin-type protein NapF  29.38 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104519  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1518  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  28.12 
 
 
160 aa  65.5  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000119119  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0442  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.78 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111137  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2176  ferredoxin-type protein NapF  33.77 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.455284  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2598  ferredoxin-type protein NapF  33.09 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1790  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.33 
 
 
229 aa  63.9  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2445  ferredoxin-type protein  30.67 
 
 
163 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.399328 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2396  ferredoxin-type protein  30.67 
 
 
163 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2604  ferredoxin-type protein  30.67 
 
 
163 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  normal  0.656417 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0728  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.88 
 
 
171 aa  62.4  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000860866  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1059  ferredoxin-type protein NapF  28.32 
 
 
182 aa  62.4  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0492  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.88 
 
 
213 aa  62  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.363621 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4011  ferredoxin-type protein NapF  34.13 
 
 
188 aa  62.4  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1451  ferredoxin-type protein NapF  28.75 
 
 
164 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0733  ferredoxin-type protein  28.75 
 
 
164 aa  61.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2507  ferredoxin-type protein  28.75 
 
 
164 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3345  ferredoxin-type protein  28.75 
 
 
164 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0931001  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06170  4Fe-4S protein  30.97 
 
 
226 aa  61.2  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2356  ferredoxin-type protein  28.75 
 
 
164 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2225  ferredoxin-type protein NapF  30.6 
 
 
165 aa  60.8  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000128219  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2487  ferredoxin-type protein  30.25 
 
 
163 aa  60.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2713  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.41 
 
 
656 aa  60.8  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.875426 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2713  ferredoxin-type protein NapF  29.68 
 
 
178 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1442  ferredoxin-type protein  28.12 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22790  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  31.72 
 
 
219 aa  59.7  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0618  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.12 
 
 
174 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2346  ferredoxin-type protein  28.12 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0478  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.39 
 
 
213 aa  58.9  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3167  ferredoxin-type protein napF  34.11 
 
 
170 aa  58.9  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02135  ferredoxin-type protein, predicted role in electron transfer to periplasmic nitrate reductase (NapA)  27.5 
 
 
164 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02094  hypothetical protein  27.5 
 
 
164 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14300  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  33.59 
 
 
331 aa  57.4  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.06573e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2409  ferredoxin-type protein NapF  29.63 
 
 
178 aa  57.4  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27410  4Fe-4S protein  30.07 
 
 
206 aa  57  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3342  quinol dehydrogenase periplasmic component  28.12 
 
 
231 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.379134  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0847  quinol dehydrogenase periplasmic component  32 
 
 
244 aa  54.7  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0703  quinol dehydrogenase periplasmic component  32 
 
 
244 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4114  periplasmic nitrate reductase maturation protein NapF  28.74 
 
 
160 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3319  quinol dehydrogenase periplasmic component  32 
 
 
244 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1160  quinol dehydrogenase periplasmic component  28.66 
 
 
250 aa  54.7  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0746915  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3431  quinol dehydrogenase periplasmic component  32 
 
 
244 aa  54.3  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02132  quinol dehydrogenase periplasmic component  28.12 
 
 
231 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.192803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1454  MauM/NapG family ferredoxin-type protein  28.12 
 
 
231 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2343  quinol dehydrogenase periplasmic component  28.12 
 
 
231 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3149  quinol dehydrogenase periplasmic component  31.33 
 
 
244 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0861746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1445  quinol dehydrogenase periplasmic component  28.12 
 
 
231 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0710  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.89 
 
 
252 aa  53.9  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.696153 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2504  quinol dehydrogenase periplasmic component  28.12 
 
 
231 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02091  hypothetical protein  28.12 
 
 
231 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.181289  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0115  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.16 
 
 
393 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2353  quinol dehydrogenase periplasmic component  28.12 
 
 
231 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1287  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.88 
 
 
192 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2498  quinol dehydrogenase periplasmic component  28.75 
 
 
231 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441878 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2393  quinol dehydrogenase periplasmic component  28.75 
 
 
231 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0736  quinol dehydrogenase periplasmic component  28.12 
 
 
231 aa  52.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1208  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.21 
 
 
252 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226249  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2442  quinol dehydrogenase periplasmic component  28.75 
 
 
231 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.426735 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2484  quinol dehydrogenase periplasmic component  28.75 
 
 
231 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0774  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.78 
 
 
394 aa  52.8  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.290777  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3221  hypothetical protein  32.67 
 
 
263 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0113  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.97 
 
 
252 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.565926  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2601  quinol dehydrogenase periplasmic component  28.75 
 
 
231 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.334591 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1321  ferredoxin  31.45 
 
 
273 aa  52.4  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1640  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.78 
 
 
524 aa  52  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>