168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02124 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02124  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  348  2e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2920  hypothetical protein  45.18 
 
 
202 aa  144  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43240  hypothetical protein  42.26 
 
 
202 aa  134  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.531737 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3627  hypothetical protein  41.07 
 
 
202 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2452  hypothetical protein  35.67 
 
 
201 aa  121  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108576  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  35.8 
 
 
203 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0405  hypothetical protein  33.94 
 
 
207 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0945  hypothetical protein  36.25 
 
 
210 aa  110  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0602  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.42 
 
 
217 aa  110  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.413112 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2857  hypothetical protein  37.42 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  33.33 
 
 
221 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.73 
 
 
197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  34.91 
 
 
204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  33.77 
 
 
203 aa  108  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2164  hypothetical protein  34.15 
 
 
200 aa  106  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5933  hypothetical protein  36.77 
 
 
209 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0412  hypothetical protein  35.4 
 
 
206 aa  105  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1365  hypothetical protein  34.55 
 
 
196 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300021  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5253  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.55 
 
 
196 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.504075 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.71 
 
 
206 aa  102  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  31.37 
 
 
203 aa  100  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1051  flavin reductase-like, FMN-binding  35.53 
 
 
213 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0090  flavin reductase domain-containing protein  38.03 
 
 
210 aa  100  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00316855 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.14 
 
 
295 aa  99.4  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  30.59 
 
 
200 aa  99.4  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  31.18 
 
 
228 aa  99  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5120  putative flavin reductase  34.38 
 
 
203 aa  99  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5507  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  97.8  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000065263  unclonable  4.40126e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3843  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  97.4  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000198663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5413  hypothetical protein  33.75 
 
 
203 aa  97.4  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.81917e-62 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4263  flavin reductase domain-containing protein  35 
 
 
210 aa  97.4  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5171  hypothetical protein  33.75 
 
 
203 aa  97.4  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000552892  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5565  hypothetical protein  33.75 
 
 
203 aa  97.4  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000029994  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.9 
 
 
199 aa  97.1  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5447  hypothetical protein  31.46 
 
 
203 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000739812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5021  flavin reductase  33.33 
 
 
203 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000378469  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5444  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.53 
 
 
203 aa  96.3  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5005  flavin reductase  33.33 
 
 
203 aa  96.3  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000501887  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5500  hypothetical protein  31.4 
 
 
203 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000371904  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5134  hypothetical protein  32.73 
 
 
220 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7599  hypothetical protein  32.12 
 
 
220 aa  95.5  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.95 
 
 
216 aa  95.5  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  31.1 
 
 
219 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2683  hypothetical protein  32.92 
 
 
203 aa  94.4  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2740  hypothetical protein  32.92 
 
 
203 aa  94.4  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  31.48 
 
 
216 aa  92.8  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5370  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.12 
 
 
223 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.480853 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4410  hypothetical protein  33.75 
 
 
209 aa  91.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5906  hypothetical protein  33.8 
 
 
195 aa  91.7  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  34.64 
 
 
203 aa  90.9  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 
203 aa  90.1  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0364  nitrilotriacetate monooxygenase component B  33.79 
 
 
205 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2654  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.48 
 
 
203 aa  89  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2914  hypothetical protein  35 
 
 
203 aa  89  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3465  hypothetical protein  40.71 
 
 
202 aa  88.6  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3110  hypothetical protein  40.71 
 
 
202 aa  88.6  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0966495  normal  0.11855 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.64 
 
 
203 aa  88.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  30.52 
 
 
201 aa  88.2  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4644  hypothetical protein  29.11 
 
 
231 aa  87.8  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  32.48 
 
 
207 aa  87.4  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  32.03 
 
 
208 aa  85.9  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  29.89 
 
 
205 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  30 
 
 
208 aa  85.5  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  30.2 
 
 
221 aa  85.1  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  31.17 
 
 
201 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6314  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.76 
 
 
294 aa  84.3  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  32.68 
 
 
208 aa  84  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0075  hypothetical protein  32 
 
 
196 aa  84  9e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000447764  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3621  hypothetical protein  29.87 
 
 
220 aa  84  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5786  hypothetical protein  27.22 
 
 
208 aa  84  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.756136  hitchhiker  0.00296108 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  30.52 
 
 
201 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  29.46 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  29.31 
 
 
205 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  28.66 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  30.52 
 
 
201 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  29.53 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5124  flavin reductase-like, FMN-binding  31.58 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.178532 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2070  hypothetical protein  44.71 
 
 
202 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.224794 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  30.52 
 
 
207 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  31.79 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  33.08 
 
 
241 aa  81.3  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  27.33 
 
 
201 aa  81.3  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  29.33 
 
 
208 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  30.57 
 
 
221 aa  80.9  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  29.87 
 
 
207 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  28.3 
 
 
209 aa  80.5  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  31.17 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  27.59 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  28.67 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  30.87 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  31.37 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  35.29 
 
 
209 aa  79  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  32.68 
 
 
201 aa  79  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  31.37 
 
 
200 aa  79  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  30.52 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  27.39 
 
 
218 aa  78.6  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  31.01 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4414  hypothetical protein  26.88 
 
 
218 aa  78.2  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.629184  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  29.22 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>