137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003041 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003041  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  440  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02845  hypothetical protein  75.85 
 
 
219 aa  343  8e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3693  methyltransferase type 11  30.07 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2106  methyltransferase type 12  28.27 
 
 
436 aa  63.2  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0872  Methyltransferase type 11  26.29 
 
 
311 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0115679  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3396  methyltransferase type 12  26.63 
 
 
439 aa  58.5  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  34.82 
 
 
213 aa  58.2  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1472  methyltransferase type 12  31.69 
 
 
308 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.62 
 
 
220 aa  57.4  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  28.28 
 
 
281 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  27.4 
 
 
225 aa  53.1  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  28.76 
 
 
211 aa  52.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 
199 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0834  hypothetical protein  30.77 
 
 
239 aa  52  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1539  Methyltransferase type 12  24.76 
 
 
312 aa  52  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.67 
 
 
205 aa  52  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  26.06 
 
 
202 aa  52  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  25.97 
 
 
329 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  22.51 
 
 
226 aa  50.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3443  methyltransferase type 12  26.6 
 
 
436 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0605302 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3559  Methyltransferase type 12  25.32 
 
 
331 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3256  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2499  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
203 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0157  methyltransferase type 12  25.37 
 
 
338 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0701135  normal  0.868895 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3235  methyltransferase type 12  24.48 
 
 
331 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0226  Methyltransferase type 12  23.71 
 
 
311 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.48 
 
 
237 aa  48.9  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  31.68 
 
 
247 aa  49.3  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  24.68 
 
 
210 aa  48.9  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 
200 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0810  hypothetical protein  28.3 
 
 
239 aa  48.5  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  26.06 
 
 
201 aa  48.5  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.36 
 
 
220 aa  48.5  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 
200 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03996  conserved hypothetical protein  25.94 
 
 
221 aa  48.5  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0273649  normal  0.194457 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1846  methyltransferase type 11  26.52 
 
 
195 aa  48.1  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.441849  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0512  hypothetical protein  31.53 
 
 
207 aa  48.1  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  25.18 
 
 
261 aa  47.8  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  25 
 
 
267 aa  47.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  24.48 
 
 
235 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  24.76 
 
 
268 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.17 
 
 
255 aa  47  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.65 
 
 
237 aa  47  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0749  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 
308 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  27 
 
 
263 aa  47  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  27 
 
 
263 aa  47  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  27 
 
 
263 aa  47  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  27.66 
 
 
272 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2494  methyltransferase type 11  28.85 
 
 
254 aa  47  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162443  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  24.05 
 
 
210 aa  47  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5381  methyltransferase type 11  25.26 
 
 
438 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.554977 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1075  methyltransferase type 12  24.87 
 
 
303 aa  47  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  24.43 
 
 
309 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  24.76 
 
 
268 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2061  Methyltransferase type 12  25.13 
 
 
272 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878422  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0419  hypothetical protein  25.16 
 
 
230 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.271566 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  22.22 
 
 
1340 aa  46.6  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0197  Methyltransferase type 12  23 
 
 
310 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  23.08 
 
 
213 aa  46.2  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  36 
 
 
263 aa  46.2  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  26.35 
 
 
225 aa  45.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  27.55 
 
 
265 aa  45.8  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  25.69 
 
 
242 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.48 
 
 
207 aa  45.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  25 
 
 
331 aa  45.8  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  24.52 
 
 
267 aa  45.8  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  26.06 
 
 
207 aa  45.4  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1085  methyltransferase type 12  23.64 
 
 
235 aa  45.4  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1153  SAM-dependent methyltransferase  28.7 
 
 
196 aa  45.1  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1147  SAM-dependent methyltransferase  28.7 
 
 
208 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  23.46 
 
 
436 aa  45.1  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1222  SAM-dependent methyltransferase  27.05 
 
 
241 aa  45.1  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.100139  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  30.61 
 
 
1523 aa  45.1  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  26.8 
 
 
226 aa  45.1  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1482  putative methyltransferase  24.02 
 
 
514 aa  45.1  0.0009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  24.72 
 
 
456 aa  45.1  0.0009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  24.75 
 
 
258 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2248  demethylmenaquinone methyltransferase  28.85 
 
 
250 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0254  methyltransferase type 11  24.53 
 
 
230 aa  44.3  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.753586 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_550  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  23.9 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00760121  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  30.1 
 
 
275 aa  44.3  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  29.46 
 
 
561 aa  44.7  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 
457 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  29.46 
 
 
561 aa  44.7  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  27.55 
 
 
252 aa  44.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  26.45 
 
 
330 aa  44.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1413  SAM-dependent methyltransferase  27.5 
 
 
196 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3603  Methyltransferase type 11  23.38 
 
 
269 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473766 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0786  hypothetical protein  25.93 
 
 
242 aa  43.5  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.27206  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1063  hypothetical protein  23.44 
 
 
276 aa  43.5  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.051758  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.19 
 
 
253 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1358  methyltransferase type 11  28.3 
 
 
271 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  26.95 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  27.64 
 
 
268 aa  43.9  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0800  hypothetical protein  22.63 
 
 
308 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0187888 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0756  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1922  Methyltransferase type 11  22.28 
 
 
226 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0489  methyltransferase type 12  25.26 
 
 
447 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  26.95 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  28.43 
 
 
258 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  26.95 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>