More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0499 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000128  signal transduction histidine kinase  71.46 
 
 		 484 aa  722    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000230722  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05735  hypothetical protein  72.52 
 
 		 473 aa  729    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0499  sensor histidine kinase  100 
 
 		 499 aa  1032    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000013599  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0651  membrane associated signal transduction protein,histidine kinase  56.08 
 
 		 491 aa  557  1e-157  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0972  sensor histidine kinase  31.51 
 
 		 484 aa  188  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 		 518 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.315276 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4362  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 509 aa  72.8  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2532  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.55 
 
 		 854 aa  69.3  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1878  sensor histidine kinase  24.9 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000152464  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  27.05 
 
 		 392 aa  67  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2084  histidine kinase  29.24 
 
 		 393 aa  67  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6071  two component sensor kinase  25.85 
 
 		 902 aa  64.3  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2581  histidine kinase  27.14 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0578515  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1899  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558048  normal  0.259205 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0410  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 		 300 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5361  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 		 897 aa  63.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0303077 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0806  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 		 587 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2941  histidine kinase  27.91 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 		 587 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.773486  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8521  Signal transduction histidine kinase-like protein  27.19 
 
 		 468 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 		 634 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3977  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.59 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1031  Signal transduction histidine kinase-like protein  24.63 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.286161  normal  0.755502 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0845  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.36 
 
 		 431 aa  62  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021022  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.369985  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3781  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 592 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233259  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 592 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130733  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1570  histidine kinase  27.06 
 
 		 453 aa  61.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.115391 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0474  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 759 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.453015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2734  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  26.81 
 
 		 810 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0089  histidine kinase  28.86 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.12 
 
 		 455 aa  60.5  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  0.00000000404182 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0806  histidine kinase  27.6 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233531 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0208  histidine kinase  23.35 
 
 		 532 aa  60.1  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2325  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.830525  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2237  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.5102  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0123  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.43 
 
 		 433 aa  59.7  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  29.25 
 
 		 391 aa  59.7  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1647  oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  26.61 
 
 		 453 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.232053 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2142  histidine kinase  26.67 
 
 		 502 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.000590991  normal  0.0793761 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  24.29 
 
 		 446 aa  59.7  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2798  two-component sensor protein  28.22 
 
 		 462 aa  60.1  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1676  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0099  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 746 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0713  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 		 867 aa  58.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3611  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 		 566 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.716129  hitchhiker  0.000346414 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3702  osmolarity sensor protein  26.11 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3699  osmolarity sensor protein  26.11 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3779  Osmosensitive K channel His kinase sensor  27.98 
 
 		 857 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3774  osmolarity sensor protein  26.11 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1292  histidine kinase  28.17 
 
 		 341 aa  59.3  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00188773  hitchhiker  0.0000922476 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1623  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0941  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 777 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 		 321 aa  59.3  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0558  ATP-binding region, ATPase-like protein  25.71 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  25.24 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3806  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 		 533 aa  59.3  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.576691  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3808  osmolarity sensor protein  26.11 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3870  osmolarity sensor protein  26.11 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.671059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4207  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.43 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4359  ATPase domain-containing protein  27.08 
 
 		 494 aa  59.3  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191758  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1450  histidine kinase  26.21 
 
 		 446 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3828  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.2 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.287383  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3493  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 		 867 aa  58.5  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.789076  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 463 aa  58.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1354  sensor histidine kinase  25.33 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0755  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.84 
 
 		 588 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.452305  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  25.82 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1894  histidine kinase  28.78 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0479288 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4210  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.89 
 
 		 612 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2879  histidine kinase  29.03 
 
 		 553 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3689  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.142231  normal  0.016382 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1075  two-component system sensor histidine kinase transcription regulator protein  26.28 
 
 		 784 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.708175 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2823  histidine kinase  29.22 
 
 		 501 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6174  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 468 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00340  signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 500 aa  58.2  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00418447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3103  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.14 
 
 		 522 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5020  histidine kinase  24.8 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.48 
 
 		 674 aa  57.8  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.808009  normal  0.64014 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0750  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.542154  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3500  histidine kinase  25.91 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0489  Signal transduction histidine kinase  22.69 
 
 		 470 aa  57.8  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.41 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2188  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3724  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 592 aa  57.4  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 		 474 aa  57.4  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.623691  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3568  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.283138  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14051  two-component sensor histidine kinase  30.69 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1727  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 545 aa  57.4  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.595056  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0931  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 446 aa  57  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.523505  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1987  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.41 
 
 		 577 aa  57  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0917  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 		 494 aa  57  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000856467  hitchhiker  9.75464e-20 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3018  Signal transduction histidine kinase, NtrY  25.69 
 
 		 712 aa  56.6  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3461  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.87 
 
 		 528 aa  57  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0023015  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0172  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 		 395 aa  57  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000580  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with RstA  26.58 
 
 		 431 aa  56.6  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00239122  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1854  GAF sensor hybrid histidine kinase  25.17 
 
 		 579 aa  56.6  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.46631 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3061  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.29 
 
 		 436 aa  56.6  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>