More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0140 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0140  sensor histidine kinase  100 
 
 		 471 aa  964    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003618  signal transduction histidine kinase  54.89 
 
 		 475 aa  480  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1229  sensor histidine kinase  44.92 
 
 		 477 aa  365  1e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.131746 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2327  histidine kinase  32.39 
 
 		 467 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.205174 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3355  histidine kinase  31.67 
 
 		 455 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 454 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 480 aa  202  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2714  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 454 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3512  sensor histidine kinase  32.46 
 
 		 457 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1893  sensor histidine kinase  32.22 
 
 		 457 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 454 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3018  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 454 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 450 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 		 449 aa  196  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 458 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1941  histidine kinase  31.71 
 
 		 514 aa  193  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.531292  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18640  sensory histidine protein kinase,two-component  31.89 
 
 		 472 aa  191  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  30.66 
 
 		 471 aa  189  7e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  30.66 
 
 		 471 aa  188  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 450 aa  186  7e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5865  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 462 aa  179  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0997  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 437 aa  179  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.171327  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  31.8 
 
 		 449 aa  178  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  31.82 
 
 		 478 aa  178  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  31.82 
 
 		 478 aa  177  3e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 462 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4166  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 445 aa  176  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0754013 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2065  putative periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, QseC  31.45 
 
 		 467 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 515 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  34.94 
 
 		 517 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2623  histidine kinase  30.02 
 
 		 519 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  31.29 
 
 		 501 aa  173  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 467 aa  173  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  33.99 
 
 		 518 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1828  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 466 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0770919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  33.99 
 
 		 817 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  33.99 
 
 		 523 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 515 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 466 aa  172  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 		 515 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0643  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 413 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 466 aa  171  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00327402  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 515 aa  171  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 		 517 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.94 
 
 		 515 aa  169  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  34.64 
 
 		 505 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  28.73 
 
 		 454 aa  168  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  34.64 
 
 		 505 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 454 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  34.64 
 
 		 505 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1886  ATPase domain-containing protein  27.21 
 
 		 464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  34.64 
 
 		 505 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4875  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 461 aa  167  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699508  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 517 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 517 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 		 445 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  28.64 
 
 		 499 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  32.44 
 
 		 463 aa  166  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  29.68 
 
 		 438 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3005  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 443 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4040  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 443 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.45469 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  33.84 
 
 		 517 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4977  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 443 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.870976  normal  0.849775 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 519 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2031  sensor histidine kinase  34.53 
 
 		 435 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.465234  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 435 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0135  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.02 
 
 		 455 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0665221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1766  sensor histidine kinase  32.2 
 
 		 449 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00053599  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2599  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 450 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0620227 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2297  sensor histidine kinase  29.27 
 
 		 471 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.40496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  29.43 
 
 		 438 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  29.43 
 
 		 438 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  29.43 
 
 		 438 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1338  sensor histidine kinase  28.09 
 
 		 452 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.117372  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  29.43 
 
 		 438 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  29.43 
 
 		 438 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.09 
 
 		 513 aa  162  9e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  29.43 
 
 		 438 aa  162  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  29.43 
 
 		 438 aa  162  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5522  Signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 		 460 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  29.27 
 
 		 441 aa  161  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  28.53 
 
 		 442 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3012  histidine kinase  27.43 
 
 		 475 aa  162  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 445 aa  161  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3111  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 442 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.217081 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 531 aa  159  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2105  sensor protein YgiY, putative  25.89 
 
 		 476 aa  159  8e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02898  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with QseB  29.91 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.760394  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0674  histidine kinase  29.91 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0671  sensor protein QseC  29.91 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0679985 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2082  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.46 
 
 		 464 aa  159  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0367152  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  32.04 
 
 		 444 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4637  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 485 aa  159  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.337185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3204  sensor protein QseC  29.91 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02848  hypothetical protein  29.91 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  31.68 
 
 		 526 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 463 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 		 481 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0390859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>