More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2191 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2191  response regulator receiver protein  100 
 
 
139 aa  277  4e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  49.21 
 
 
216 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.55 
 
 
318 aa  108  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 
243 aa  107  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.67 
 
 
243 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.3 
 
 
230 aa  106  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  49.62 
 
 
326 aa  105  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  45.67 
 
 
242 aa  104  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0308  two component transcriptional regulator  45.24 
 
 
248 aa  104  4e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.030574  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3391  two component transcriptional regulator  45.53 
 
 
227 aa  104  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141218  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  48.44 
 
 
231 aa  104  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  49.59 
 
 
231 aa  103  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.8 
 
 
243 aa  103  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  44.88 
 
 
242 aa  103  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.8 
 
 
243 aa  103  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  47.15 
 
 
231 aa  102  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.6 
 
 
247 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  46.97 
 
 
230 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  46.97 
 
 
230 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  46.97 
 
 
230 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  48 
 
 
221 aa  102  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.97 
 
 
228 aa  102  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  45.97 
 
 
248 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  45.16 
 
 
248 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  47.93 
 
 
235 aa  102  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1930  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 
233 aa  101  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.465475  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  48.39 
 
 
230 aa  101  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  49.59 
 
 
326 aa  102  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  42.75 
 
 
244 aa  101  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  44.72 
 
 
123 aa  101  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2266  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  45.53 
 
 
230 aa  101  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01511  two-component response regulator  45.16 
 
 
248 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.22 
 
 
234 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1567  response regulator receiver protein  44.54 
 
 
124 aa  101  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358518  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0136  two component transcriptional regulator  45.16 
 
 
248 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1500  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 
248 aa  100  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.72 
 
 
224 aa  100  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2384  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 
259 aa  100  6e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.01 
 
 
1390 aa  100  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.01 
 
 
1390 aa  100  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.01 
 
 
1390 aa  100  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1637  DNA-binding response regulator ResD  41.73 
 
 
250 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0246031  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1601  DNA-binding response regulator ResD  41.73 
 
 
250 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953648  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1531  DNA-binding response regulator ResD  41.41 
 
 
238 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1569  DNA-binding response regulator ResD  41.73 
 
 
250 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45334e-32 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1386  DNA-binding response regulator ResD  41.41 
 
 
238 aa  99.4  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01531  two-component response regulator  44.35 
 
 
248 aa  99.4  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3814  DNA-binding response regulator ResD  41.41 
 
 
238 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.95849e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1399  two component transcriptional regulator  42.19 
 
 
238 aa  99.8  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1359  response regulator  41.41 
 
 
238 aa  99.4  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319788  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3303  two component transcriptional regulator  42.4 
 
 
229 aa  99.4  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000702519  hitchhiker  0.00000106408 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02061  two-component response regulator  43.55 
 
 
248 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.540525 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1358  response regulator  41.41 
 
 
238 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.37 
 
 
227 aa  99.8  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.2 
 
 
1431 aa  99.8  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1497  DNA-binding response regulator ResD  41.41 
 
 
238 aa  99.4  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862661  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1257  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 
229 aa  99.8  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.536699  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.73 
 
 
232 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  40 
 
 
239 aa  99.4  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.8 
 
 
226 aa  99.4  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  44.26 
 
 
229 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 
232 aa  99.4  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2802  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.6 
 
 
219 aa  99  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.204502 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0600  response regulator receiver protein  45.3 
 
 
301 aa  99  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01621  two-component response regulator  43.55 
 
 
248 aa  98.2  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.367767  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  44.54 
 
 
122 aa  98.2  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  43.9 
 
 
229 aa  98.2  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  45.16 
 
 
321 aa  98.6  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5001  response regulator receiver protein  44.64 
 
 
127 aa  98.2  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.28 
 
 
236 aa  98.2  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4400  two component transcriptional regulator  41.35 
 
 
236 aa  98.2  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998417  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  45.53 
 
 
237 aa  97.4  5e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  45.53 
 
 
231 aa  97.4  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  42.97 
 
 
236 aa  97.1  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2749  two component transcriptional regulator  40.31 
 
 
241 aa  97.4  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000593879  unclonable  0.00000330773 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  45.53 
 
 
229 aa  97.1  7e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  41.04 
 
 
230 aa  96.7  8e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  46.34 
 
 
230 aa  97.1  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1740  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.16 
 
 
225 aa  96.7  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000204942  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.6 
 
 
310 aa  96.7  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1597  two component transcriptional regulator  40.98 
 
 
237 aa  95.9  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  40.48 
 
 
236 aa  96.7  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1017  two component transcriptional regulator  40.91 
 
 
229 aa  96.3  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.957911  normal  0.735899 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  40.3 
 
 
223 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.83 
 
 
1385 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3838  response regulator receiver domain-containing protein  43.18 
 
 
234 aa  96.3  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000539223  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  45.16 
 
 
235 aa  96.3  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  40.3 
 
 
223 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2199  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  43.1 
 
 
344 aa  96.3  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.425276 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.52 
 
 
237 aa  96.7  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.9 
 
 
233 aa  96.3  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1200  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 
238 aa  95.9  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.86 
 
 
1361 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.77 
 
 
236 aa  95.9  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  40.98 
 
 
229 aa  95.9  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0632  two component transcriptional regulator  39.37 
 
 
236 aa  95.5  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.883969  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 
223 aa  95.9  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1148  two component transcriptional regulator  44.29 
 
 
243 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000285872  normal  0.61114 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2969  two component transcriptional regulator  41.6 
 
 
229 aa  95.5  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000855765  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2505  two component transcriptional regulator  44.36 
 
 
226 aa  95.9  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.457878  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>