48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2146 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA3011  hypothetical protein  39.94 
 
 
942 aa  652    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1595  hypothetical protein  38.96 
 
 
1109 aa  725    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2146  hypothetical protein  100 
 
 
1099 aa  2247    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.174953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0639  hypothetical protein  40.72 
 
 
1137 aa  795    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2495  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  47.32 
 
 
1115 aa  1031    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2992  hypothetical protein  43 
 
 
1098 aa  857    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296084  normal  0.329203 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0686  AAA family ATPase  43.31 
 
 
1098 aa  858    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0158306  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3563  AAA family ATPase  47.18 
 
 
1122 aa  1013    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0199  AAA family ATPase  42.77 
 
 
1098 aa  859    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1849  hypothetical protein  43.65 
 
 
1098 aa  857    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1756  hypothetical protein  47.13 
 
 
1094 aa  1023    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2192  hypothetical protein  48.24 
 
 
1109 aa  1030    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0654  hypothetical protein  38.74 
 
 
949 aa  644    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2627  hypothetical protein  38.69 
 
 
936 aa  622  1e-176  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1236  hypothetical protein  38.23 
 
 
959 aa  616  1e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.977146  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1875  hypothetical protein  36.88 
 
 
950 aa  610  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1017  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  35.94 
 
 
1108 aa  597  1e-169  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2720  hypothetical protein  36.05 
 
 
948 aa  593  1e-168  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000186641 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0198  hypothetical protein  35.93 
 
 
945 aa  579  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220084  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0636  hypothetical protein  36.2 
 
 
941 aa  572  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0237  AAA family ATPase  31.22 
 
 
865 aa  312  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316597  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0361  hypothetical protein  34.5 
 
 
953 aa  307  9.000000000000001e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1605  AAA family ATPase  30.52 
 
 
854 aa  298  4e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3985  AAA family ATPase  29.89 
 
 
932 aa  277  9e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.943336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4271  AAA family ATPase  28.38 
 
 
1015 aa  267  5.999999999999999e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.365445 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2007  AAA family ATPase  27.99 
 
 
982 aa  245  3.9999999999999997e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3115  AAA family ATPase  26.11 
 
 
1090 aa  232  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.2402  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0508  AAA family ATPase  30.62 
 
 
924 aa  213  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00062963  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1807  hypothetical protein  27.92 
 
 
1122 aa  108  7e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0489397  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1602  hypothetical protein  24.25 
 
 
1080 aa  107  9e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0274  hypothetical protein  24.8 
 
 
1037 aa  103  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2175  hypothetical protein  24.42 
 
 
1034 aa  103  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0743489  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1394  hypothetical protein  41.27 
 
 
149 aa  102  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0015  hypothetical protein  23.16 
 
 
1050 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195292  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1355  hypothetical protein  25.15 
 
 
1062 aa  96.7  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2023  hypothetical protein  33.77 
 
 
294 aa  82.4  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1776  AAA family ATPase  24.5 
 
 
814 aa  79.3  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.355221  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5491  AAA family ATPase  24.74 
 
 
1002 aa  78.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.188779 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5891  AAA family ATPase  24.74 
 
 
1002 aa  78.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2758  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.08 
 
 
1068 aa  75.9  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0386  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.68 
 
 
1068 aa  65.9  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.222582  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  37.31 
 
 
2125 aa  64.3  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  37.31 
 
 
2125 aa  64.3  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3345  AAA family ATPase  24.42 
 
 
834 aa  62  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1310  hypothetical protein  40.3 
 
 
98 aa  55.8  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2686  hypothetical protein  24.13 
 
 
913 aa  53.5  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0983  hypothetical protein  28.89 
 
 
1019 aa  52  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.397538  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2127  hypothetical protein  24.63 
 
 
911 aa  49.3  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>