42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1776 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1776  AAA family ATPase  100 
 
 
814 aa  1637    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.355221  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3345  AAA family ATPase  40.5 
 
 
834 aa  561  1e-158  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2758  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  28.37 
 
 
1068 aa  253  8.000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0386  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  28.22 
 
 
1068 aa  250  6e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.222582  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0237  AAA family ATPase  22.94 
 
 
865 aa  109  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316597  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1236  hypothetical protein  23.06 
 
 
959 aa  105  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.977146  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0361  hypothetical protein  24.22 
 
 
953 aa  97.4  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2686  hypothetical protein  22.2 
 
 
913 aa  92.4  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0198  hypothetical protein  22.83 
 
 
945 aa  92  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220084  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0636  hypothetical protein  23.08 
 
 
941 aa  91.7  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1875  hypothetical protein  22.82 
 
 
950 aa  91.7  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4271  AAA family ATPase  23.18 
 
 
1015 aa  90.1  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.365445 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0095  hypothetical protein  21.27 
 
 
910 aa  89.7  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.417783  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3102  hypothetical protein  24.7 
 
 
914 aa  88.2  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2627  hypothetical protein  21.23 
 
 
936 aa  88.2  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3985  AAA family ATPase  22.82 
 
 
932 aa  88.2  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.943336 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2127  hypothetical protein  22.55 
 
 
911 aa  87.8  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2720  hypothetical protein  22.66 
 
 
948 aa  87.4  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000186641 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0015  hypothetical protein  24.03 
 
 
1050 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195292  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0654  hypothetical protein  22.28 
 
 
949 aa  81.6  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2146  hypothetical protein  24.5 
 
 
1099 aa  79.7  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.174953  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3011  hypothetical protein  20.81 
 
 
942 aa  79  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0639  hypothetical protein  22.49 
 
 
1137 aa  77.8  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1605  AAA family ATPase  22.36 
 
 
854 aa  75.9  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0686  AAA family ATPase  23.38 
 
 
1098 aa  72.4  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0158306  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0199  AAA family ATPase  22.63 
 
 
1098 aa  72.4  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0508  AAA family ATPase  21.8 
 
 
924 aa  72  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00062963  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2007  AAA family ATPase  22.8 
 
 
982 aa  70.9  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3563  AAA family ATPase  23.69 
 
 
1122 aa  70.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1355  hypothetical protein  22.35 
 
 
1062 aa  70.5  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2992  hypothetical protein  22.05 
 
 
1098 aa  69.7  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296084  normal  0.329203 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1756  hypothetical protein  19.92 
 
 
1094 aa  69.3  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3115  AAA family ATPase  21.52 
 
 
1090 aa  69.3  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.2402  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2175  hypothetical protein  21.04 
 
 
1034 aa  68.6  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0743489  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2192  hypothetical protein  23.51 
 
 
1109 aa  67  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1849  hypothetical protein  21.93 
 
 
1098 aa  66.6  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0274  hypothetical protein  21.56 
 
 
1037 aa  63.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2495  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.33 
 
 
1115 aa  60.1  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0983  hypothetical protein  20.08 
 
 
1019 aa  58.2  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.397538  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1807  hypothetical protein  21.29 
 
 
1122 aa  58.2  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0489397  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1017  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  20.62 
 
 
1108 aa  53.5  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0718  hypothetical protein  23.71 
 
 
1015 aa  48.9  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000573342 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>