More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1001 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1001  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 253 aa  504  9.999999999999999e-143  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.811853  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  43.69 
 
 		 366 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  41.12 
 
 		 382 aa  168  8e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  37.26 
 
 		 386 aa  156  3e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  39.42 
 
 		 360 aa  155  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  38.54 
 
 		 365 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  38.54 
 
 		 365 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  38.54 
 
 		 365 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  38.54 
 
 		 365 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  38.54 
 
 		 365 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  38.54 
 
 		 365 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  38.54 
 
 		 365 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5680  HhH-GPD family protein  46.04 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  38.54 
 
 		 365 aa  153  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  40.38 
 
 		 383 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  38.05 
 
 		 365 aa  153  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  38.54 
 
 		 365 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  36.71 
 
 		 363 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  39.11 
 
 		 386 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4708  HhH-GPD family protein  43.06 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2484  A/G-specific adenine glycosylase  39.81 
 
 		 351 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.054376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  42.25 
 
 		 293 aa  149  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13622  adenine glycosylase mutY  43.96 
 
 		 304 aa  149  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.23263e-43  normal  0.044333 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  41.09 
 
 		 318 aa  149  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  37.37 
 
 		 364 aa  148  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  37.5 
 
 		 381 aa  147  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  40.58 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0468  A/G-specific adenine glycosylase  40 
 
 		 366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4274  HhH-GPD family protein  42.11 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.162627 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3686  A/G-specific adenine glycosylase  36.89 
 
 		 355 aa  146  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.899508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0980  A/G-specific adenine glycosylase  39.11 
 
 		 350 aa  145  5e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.61 
 
 		 360 aa  145  6e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  41.15 
 
 		 303 aa  145  7.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  42.31 
 
 		 303 aa  145  9e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  36.36 
 
 		 373 aa  144  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1972  HhH-GPD family protein  38.21 
 
 		 341 aa  143  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.224545  hitchhiker  0.000205487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0804  A/G-specific DNA glycosylase  37.93 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.591097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9146  A/G-specific DNA glycosylase-like protein  40.98 
 
 		 291 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1378  A/G-specific adenine glycosylase  38.21 
 
 		 407 aa  143  3e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0309494 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  38.54 
 
 		 352 aa  143  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  36.1 
 
 		 352 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  36.1 
 
 		 352 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  42.38 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0467  HhH-GPD family protein  39.35 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  39.51 
 
 		 306 aa  142  4e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5983  A/G-specific adenine glycosylase  37.8 
 
 		 362 aa  142  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.868735 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  34.58 
 
 		 368 aa  142  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  36.84 
 
 		 401 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  42.23 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1519  A/G-specific adenine glycosylase  38.16 
 
 		 360 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.570552  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  40.87 
 
 		 287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  42.51 
 
 		 288 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  42.51 
 
 		 288 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  42.51 
 
 		 288 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  38.46 
 
 		 330 aa  138  7e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3358  adenine DNA glycosylase  36.76 
 
 		 350 aa  138  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.173815 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  40.67 
 
 		 315 aa  138  7e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  35.41 
 
 		 388 aa  138  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2201  HhH-GPD family protein  38.16 
 
 		 305 aa  138  7e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3350  adenine DNA glycosylase  36.76 
 
 		 350 aa  138  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.443349 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3274  adenine DNA glycosylase  36.76 
 
 		 350 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3284  adenine DNA glycosylase  36.76 
 
 		 350 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0228526 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  36.76 
 
 		 350 aa  138  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  38.31 
 
 		 351 aa  138  8.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  41.86 
 
 		 335 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  35.02 
 
 		 353 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5346  HhH-GPD family protein  42.11 
 
 		 290 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3176  A/G-specific adenine glycosylase  35.61 
 
 		 354 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  36.27 
 
 		 350 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  36.27 
 
 		 350 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0383  A/G-specific adenine glycosylase  37.5 
 
 		 371 aa  137  2e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  36.27 
 
 		 360 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0534  A/G-specific adenine glycosylase  34.93 
 
 		 350 aa  137  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000506444  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  36.27 
 
 		 350 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  36.27 
 
 		 350 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  36.27 
 
 		 350 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.87 
 
 		 375 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  36.27 
 
 		 360 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  37.04 
 
 		 384 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3206  adenine DNA glycosylase  39.09 
 
 		 361 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1406  A/G-specific adenine glycosylase  35.32 
 
 		 347 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  38.5 
 
 		 368 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  35.38 
 
 		 368 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3407  adenine DNA glycosylase  37.56 
 
 		 368 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0148197  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  38.5 
 
 		 368 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  38.5 
 
 		 368 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  35.78 
 
 		 360 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  38.5 
 
 		 368 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  38.5 
 
 		 368 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  38.5 
 
 		 368 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0882  adenine DNA glycosylase  37.56 
 
 		 368 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  38.5 
 
 		 368 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06850  A/G-specific DNA glycosylase  38.1 
 
 		 313 aa  135  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1974  A/G-specific adenine glycosylase  37.21 
 
 		 339 aa  135  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  35.07 
 
 		 368 aa  136  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  37.56 
 
 		 381 aa  135  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  39.6 
 
 		 317 aa  135  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  37.5 
 
 		 344 aa  135  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3604  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.5 
 
 		 363 aa  135  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211751  hitchhiker  0.00640648 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1654  A/G-specific adenine glycosylase  38.25 
 
 		 344 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>