38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0280 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0280  RNA polymerase, insert  100 
 
 		 283 aa  574  1.0000000000000001e-163  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2145  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  35.66 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000343639  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1052  RNA polymerase insert  34.8 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.127014  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1803  DNA-directed RNA polymerase subunit D  37.12 
 
 		 276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0972243  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0039  DNA-directed RNA polymerase subunit D  34.9 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1244  DNA-directed RNA polymerase subunit D  36 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00140782  normal  0.836144 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2222  DNA-directed RNA polymerase subunit D  38.04 
 
 		 276 aa  146  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2385  DNA-directed RNA polymerase subunit D  36.19 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0325899  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2899  DNA-directed RNA polymerase subunit D  34.52 
 
 		 272 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0075  DNA-directed RNA polymerase subunit D  36.68 
 
 		 266 aa  132  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1621  RNA polymerase, insert  33.96 
 
 		 264 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1166  RNA polymerase insert  30.91 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1969  RNA polymerase insert  34.32 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00862498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2551  RNA polymerase insert  33.33 
 
 		 249 aa  119  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0697  RNA polymerase, insert  31.65 
 
 		 262 aa  117  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00773924  normal  0.0619032 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35770  predicted protein  28.76 
 
 		 360 aa  118  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000177628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1819  RNA polymerase insert  35.38 
 
 		 250 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13566  predicted protein  31.13 
 
 		 320 aa  117  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2592  RNA polymerase insert  31.09 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.906586  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0423  RNA polymerase insert  31.5 
 
 		 249 aa  115  7.999999999999999e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119616  DNA-directed RNA polymerase II subunit 3  31.25 
 
 		 318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.67705  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74652  RNA polymerase III (C) subunit  30.88 
 
 		 336 aa  111  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.621842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1399  RNA polymerase insert  32.04 
 
 		 273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03040  conserved hypothetical protein  31.67 
 
 		 350 aa  109  5e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612704  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0633  RNA polymerase insert  43.24 
 
 		 195 aa  102  6e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_52094  predicted protein  27.81 
 
 		 319 aa  102  8e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.830096  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0567  RNA polymerase insert  40.54 
 
 		 180 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2097  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  30 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0271  DNA-directed RNA polymerase, subunit D  40.54 
 
 		 180 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0428  RNA polymerase insert  35.19 
 
 		 221 aa  100  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0123472 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80709  45 kDa subunit of RNA polymerase II  28.87 
 
 		 315 aa  99  8e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2521  RNA polymerase insert  28.1 
 
 		 247 aa  99  8e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.088721  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06252  RNA polymerase II subunit 3 (AFU_orthologue; AFUA_2G13090)  29.09 
 
 		 333 aa  98.6  9e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.586686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1351  RNA polymerase insert  39.19 
 
 		 180 aa  98.2  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146665  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2327  RNA polymerase, insert  29.64 
 
 		 259 aa  95.9  6e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000000580045  hitchhiker  0.00000634877 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1098  RNA polymerase insert  37.09 
 
 		 197 aa  91.7  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02415  DNA-directed RNA polymerase I and III subunit Rpc40, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13720)  27.27 
 
 		 373 aa  89.4  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0361662 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05120  RNA polymerase II subunit 3, putative  51.85 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>