135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3856 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3856  protein of unknown function DUF35  100 
 
 		 322 aa  647    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.343505  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  58.66 
 
 		 333 aa  351  8e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  57.1 
 
 		 315 aa  330  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  55.45 
 
 		 311 aa  323  3e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  54.81 
 
 		 324 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  53.87 
 
 		 317 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  53.55 
 
 		 318 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  53.55 
 
 		 318 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  53.67 
 
 		 317 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  56.74 
 
 		 305 aa  312  5.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  47.02 
 
 		 319 aa  272  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  43.79 
 
 		 312 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  43.41 
 
 		 319 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  36.04 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2789  hypothetical protein  47.09 
 
 		 177 aa  149  8e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.705189  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  53.08 
 
 		 132 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0059  hypothetical protein  47.02 
 
 		 173 aa  126  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  37.98 
 
 		 137 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  36.43 
 
 		 137 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  40 
 
 		 143 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  37.21 
 
 		 137 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  39.68 
 
 		 131 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  37.4 
 
 		 132 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  38.33 
 
 		 136 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  31.78 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  41.13 
 
 		 120 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  35.83 
 
 		 143 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  28.91 
 
 		 137 aa  71.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  36.99 
 
 		 149 aa  70.5  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  38.98 
 
 		 141 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  33.06 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  34.71 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  31.62 
 
 		 143 aa  64.7  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  35.38 
 
 		 138 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  34.35 
 
 		 135 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  34.65 
 
 		 137 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  34.15 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  34.15 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  34.15 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  34.15 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  34.15 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  34.15 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  34.15 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  34.15 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  31.2 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  34.4 
 
 		 548 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  30.71 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0060  protein of unknown function DUF35  33.05 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  34.4 
 
 		 135 aa  61.2  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  34.75 
 
 		 550 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  34.75 
 
 		 550 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  32.8 
 
 		 548 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4020  hypothetical protein  37.27 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.909625 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  34.75 
 
 		 550 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  37.29 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  34.17 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  34.75 
 
 		 140 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  44.62 
 
 		 130 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  39.25 
 
 		 148 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  40 
 
 		 134 aa  57  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  41.54 
 
 		 130 aa  57  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  40 
 
 		 129 aa  57  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  32.33 
 
 		 151 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  33.08 
 
 		 143 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  30.95 
 
 		 155 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  28.95 
 
 		 147 aa  53.9  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  41.54 
 
 		 130 aa  53.9  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  36.15 
 
 		 136 aa  53.1  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2094  hypothetical protein  33.07 
 
 		 128 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  43.28 
 
 		 145 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0160  MaoC domain protein dehydratase  30.56 
 
 		 151 aa  52.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.424795  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2666  hypothetical protein  27.74 
 
 		 152 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.509352  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  27.82 
 
 		 142 aa  51.6  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4069  hypothetical protein  32.84 
 
 		 166 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.389962  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  34.81 
 
 		 176 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  32.52 
 
 		 128 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  35.83 
 
 		 139 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6482  hypothetical protein  29.6 
 
 		 146 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  35.48 
 
 		 145 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  35.48 
 
 		 145 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  35.48 
 
 		 145 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2496  hypothetical protein  27.19 
 
 		 149 aa  50.1  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  42.11 
 
 		 140 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0428  hypothetical protein  37.23 
 
 		 131 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0261769  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  30.16 
 
 		 138 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1778  hypothetical protein  26.89 
 
 		 149 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0984  hypothetical protein  38.64 
 
 		 132 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  32.14 
 
 		 141 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  26.89 
 
 		 132 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  35.29 
 
 		 131 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  29.37 
 
 		 138 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6833  hypothetical protein  38.57 
 
 		 121 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  29.37 
 
 		 138 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  34.44 
 
 		 130 aa  47  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  27.59 
 
 		 132 aa  46.6  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  26.72 
 
 		 132 aa  46.6  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  29.17 
 
 		 130 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1073  hypothetical protein  34.65 
 
 		 128 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>