202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3348 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  100 
 
 		 677 aa  1332    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3403  iron permease FTR1  43.71 
 
 		 702 aa  477  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1777  iron permease FTR1  52.85 
 
 		 691 aa  233  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25520  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  50.38 
 
 		 294 aa  227  6e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0297463  normal  0.133563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7009  iron permease FTR1  48.46 
 
 		 291 aa  218  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.35089 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4287  iron permease FTR1  47.23 
 
 		 290 aa  213  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0229  iron permease FTR1  47.71 
 
 		 284 aa  204  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3388  iron permease FTR1  49.43 
 
 		 294 aa  200  7.999999999999999e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1914  iron permease FTR1  47.06 
 
 		 281 aa  200  9e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7481  iron permease FTR1  33.33 
 
 		 438 aa  190  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  42.64 
 
 		 287 aa  179  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4773  iron permease FTR1  42.8 
 
 		 303 aa  176  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1568  iron permease FTR1  41.13 
 
 		 304 aa  163  8.000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1952  iron permease FTR1  41.77 
 
 		 304 aa  156  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495146  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  36.73 
 
 		 281 aa  149  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2597  Iron permease FTR1  36.71 
 
 		 290 aa  145  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6260  iron permease FTR1  29.81 
 
 		 400 aa  143  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  0.324266 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3898  iron permease FTR1  39.22 
 
 		 537 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1811  iron permease FTR1  38.22 
 
 		 283 aa  135  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.668278 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3352  iron permease FTR1  43.64 
 
 		 277 aa  135  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.257454 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01019  putative membrane protein  37.45 
 
 		 279 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.348057  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4913  iron permease FTR1  37.55 
 
 		 579 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2784  iron permease FTR1  34.06 
 
 		 281 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1258  iron permease FTR1 family protein  37.17 
 
 		 276 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.20725  normal  0.52486 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01026  hypothetical protein  37.17 
 
 		 276 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.377125  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1132  iron permease FTR1 family protein  37.17 
 
 		 276 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0198612  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2106  iron permease FTR1 family protein  37.17 
 
 		 276 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.178558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1136  FTR1 family iron permease  37.17 
 
 		 276 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.161686  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2579  FTR1 family protein  37.17 
 
 		 276 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3859  iron permease FTR1  34.18 
 
 		 280 aa  131  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627947  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  34.53 
 
 		 281 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  35.77 
 
 		 304 aa  131  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3596  hypothetical protein  35.94 
 
 		 284 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2872  Iron permease FTR1  36.09 
 
 		 279 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121627  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3367  Iron permease FTR1  34.56 
 
 		 284 aa  126  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2366  iron permease FTR1  36.15 
 
 		 282 aa  126  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0450502  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2040  ferrous iron permease EfeU  36.54 
 
 		 285 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.19312 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1954  iron permease FTR1  38.66 
 
 		 289 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.860822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1545  FTR1 family protein  34.44 
 
 		 277 aa  125  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884821  normal  0.11427 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2264  ferrous iron permease EfeU  36.15 
 
 		 282 aa  124  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0433  iron permease FTR1  38.08 
 
 		 278 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287745 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1660  iron permease FTR1  37.69 
 
 		 278 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0188  iron permease FTR1  35.51 
 
 		 283 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0228999 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3314  iron permease FTR1  37.68 
 
 		 281 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3368  hypothetical protein  25.45 
 
 		 403 aa  100  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0438739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1177  iron permease FTR1  38.64 
 
 		 279 aa  100  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0971353  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5173  iron permease FTR1  30.29 
 
 		 314 aa  97.8  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262497 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3473  iron permease FTR1  34.55 
 
 		 308 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2875  iron permease FTR1  36 
 
 		 280 aa  95.1  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1789  iron permease FTR1  31.08 
 
 		 315 aa  93.6  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1810  protein of unknown function DUF451  27.99 
 
 		 386 aa  92.8  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5685  hypothetical protein  25.85 
 
 		 376 aa  90.5  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.421727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1763  Iron permease FTR1  31.98 
 
 		 315 aa  89.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3323  iron permease FTR1  33.18 
 
 		 307 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  32.14 
 
 		 308 aa  87  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3597  hypothetical protein  23.21 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3351  protein of unknown function DUF451  28.39 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0591139  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  34.86 
 
 		 653 aa  83.6  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4288  hypothetical protein  29.15 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1915  hypothetical protein  28.35 
 
 		 375 aa  80.5  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.395386 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2783  hypothetical protein  24.21 
 
 		 373 aa  79.3  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  31.03 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01020  hypothetical protein  24.44 
 
 		 375 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.154697  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2625  conserved hypothetical protein  24.44 
 
 		 375 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0630269  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0432  hypothetical protein  26.94 
 
 		 371 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00842747 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1133  hypothetical protein  24.44 
 
 		 375 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0150694  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0189  hypothetical protein  26.91 
 
 		 385 aa  76.3  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0428055 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2578  hypothetical protein  24.44 
 
 		 375 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0453581 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01027  hypothetical protein  24.44 
 
 		 375 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.210857  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2105  hypothetical protein  24.44 
 
 		 375 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1137  hypothetical protein  23.61 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.108261  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1834  iron permease FTR1  32.1 
 
 		 288 aa  75.5  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163431  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3144  hypothetical protein  22.92 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2928  hypothetical protein  23.71 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000108571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7008  hypothetical protein  25.57 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.926109  normal  0.546103 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1783  iron permease FTR1  28.35 
 
 		 634 aa  74.7  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498306  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1259  hypothetical protein  24.17 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.564709 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0839  iron permease FTR1  30.26 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2421  high-affinity iron transporter  32.37 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.328401  normal  0.0402063 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1567  Peptidase M75, Imelysin  22.31 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0230  hypothetical protein  27.78 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4774  hypothetical protein  25.68 
 
 		 387 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1661  hypothetical protein  23.7 
 
 		 375 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1546  hypothetical protein  22.88 
 
 		 375 aa  73.2  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.391559  normal  0.123429 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4318  iron permease FTR1  32.21 
 
 		 303 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000385507  hitchhiker  0.00248903 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  30.71 
 
 		 647 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  30.71 
 
 		 647 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4257  iron permease FTR1  29.81 
 
 		 303 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  33.96 
 
 		 652 aa  72.4  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1385  iron permease FTR1  27.95 
 
 		 634 aa  72.4  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  29.91 
 
 		 631 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  30.29 
 
 		 636 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2353  hypothetical protein  26.19 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1951  hypothetical protein  25.91 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.406258 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2365  hypothetical protein  26.3 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0102412  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3311  hypothetical protein  25.64 
 
 		 278 aa  69.7  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2041  hypothetical protein  26.3 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.117906 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  32.87 
 
 		 653 aa  68.9  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0822  iron permease FTR1  34.72 
 
 		 396 aa  68.6  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3858  hypothetical protein  26.7 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>