61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1661 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1661  hypothetical protein  100 
 
 
375 aa  757    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0432  hypothetical protein  89.74 
 
 
371 aa  626  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00842747 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2783  hypothetical protein  58.24 
 
 
373 aa  435  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2041  hypothetical protein  59.52 
 
 
376 aa  434  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.117906 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2365  hypothetical protein  60.38 
 
 
376 aa  435  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0102412  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2625  conserved hypothetical protein  58.61 
 
 
375 aa  432  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0630269  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01020  hypothetical protein  58.61 
 
 
375 aa  432  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.154697  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2263  hypothetical protein  60.11 
 
 
376 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1133  hypothetical protein  58.61 
 
 
375 aa  432  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0150694  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1137  hypothetical protein  58.61 
 
 
375 aa  432  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.108261  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2578  hypothetical protein  58.61 
 
 
375 aa  432  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0453581 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2105  hypothetical protein  58.89 
 
 
375 aa  434  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258925  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1259  hypothetical protein  58.89 
 
 
375 aa  434  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.564709 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3144  hypothetical protein  57.18 
 
 
374 aa  432  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01027  hypothetical protein  58.61 
 
 
375 aa  432  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.210857  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1546  hypothetical protein  57.14 
 
 
375 aa  423  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.391559  normal  0.123429 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2928  hypothetical protein  59.25 
 
 
378 aa  417  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000108571  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1736  hypothetical protein  59.33 
 
 
275 aa  308  8e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.387479  normal  0.0591392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1957  hypothetical protein  58.33 
 
 
275 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551724  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3858  hypothetical protein  44.32 
 
 
396 aa  296  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3368  hypothetical protein  42.33 
 
 
403 aa  289  7e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0438739  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1808  protein of unknown function DUF451  55.65 
 
 
281 aa  286  5e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69294 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3597  hypothetical protein  41.48 
 
 
402 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2600  hypothetical protein  55.3 
 
 
272 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3856  hypothetical protein  58.43 
 
 
275 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.344115  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3279  hypothetical protein  60.08 
 
 
295 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3311  hypothetical protein  56.22 
 
 
278 aa  280  3e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1810  protein of unknown function DUF451  41.33 
 
 
386 aa  279  6e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3370  hypothetical protein  55.24 
 
 
285 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0182189  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3599  hypothetical protein  54.84 
 
 
274 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2873  hypothetical protein  42.86 
 
 
399 aa  270  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107096  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2875  hypothetical protein  55.65 
 
 
274 aa  266  5e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.485418  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2598  hypothetical protein  43.68 
 
 
395 aa  265  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1915  hypothetical protein  40.23 
 
 
375 aa  248  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.395386 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3351  protein of unknown function DUF451  41.09 
 
 
385 aa  233  6e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0591139  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1734  hypothetical protein  43.26 
 
 
385 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0725409  normal  0.221375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4774  hypothetical protein  38.38 
 
 
387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5685  hypothetical protein  37.57 
 
 
376 aa  217  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.421727  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1951  hypothetical protein  38.27 
 
 
378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.406258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7008  hypothetical protein  35.85 
 
 
393 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.926109  normal  0.546103 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0189  hypothetical protein  39.02 
 
 
385 aa  199  5e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0428055 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4912  hypothetical protein  37.67 
 
 
418 aa  199  7e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3899  hypothetical protein  34.37 
 
 
410 aa  199  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0203467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2353  hypothetical protein  36.8 
 
 
396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4288  hypothetical protein  37.1 
 
 
373 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3313  hypothetical protein  37.03 
 
 
375 aa  189  8e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25530  predicted periplasmic lipoprotein involved in iron transport  36.17 
 
 
406 aa  188  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0819691  normal  0.228645 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1955  putative lipoprotein  39.27 
 
 
365 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0906256  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1024  hypothetical protein  38.03 
 
 
292 aa  181  1e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000003997  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0391  hypothetical protein  39.48 
 
 
284 aa  181  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0401  hypothetical protein  39.48 
 
 
284 aa  181  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0230  hypothetical protein  35.04 
 
 
409 aa  176  8e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1567  Peptidase M75, Imelysin  32.43 
 
 
404 aa  170  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4621  hypothetical protein  36.65 
 
 
309 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223907  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4328  hypothetical protein  36.65 
 
 
309 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.924044  normal  0.20283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1777  iron permease FTR1  29.07 
 
 
691 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4242  hypothetical protein  36.68 
 
 
228 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.711551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7481  iron permease FTR1  27.27 
 
 
438 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6260  iron permease FTR1  27.22 
 
 
400 aa  109  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  0.324266 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3403  iron permease FTR1  26.93 
 
 
702 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  25.79 
 
 
677 aa  76.3  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>