61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3144 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2783  hypothetical protein  87.43 
 
 
373 aa  664    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3144  hypothetical protein  100 
 
 
374 aa  764    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2928  hypothetical protein  82.01 
 
 
378 aa  608  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000108571  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2263  hypothetical protein  77.93 
 
 
376 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2365  hypothetical protein  77.93 
 
 
376 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0102412  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2041  hypothetical protein  77.93 
 
 
376 aa  602  1.0000000000000001e-171  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.117906 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1259  hypothetical protein  73.32 
 
 
375 aa  555  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.564709 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1546  hypothetical protein  73.66 
 
 
375 aa  555  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.391559  normal  0.123429 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1137  hypothetical protein  73.05 
 
 
375 aa  553  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.108261  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2105  hypothetical protein  72.78 
 
 
375 aa  553  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258925  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2578  hypothetical protein  73.05 
 
 
375 aa  553  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0453581 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1133  hypothetical protein  73.05 
 
 
375 aa  553  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0150694  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01027  hypothetical protein  73.05 
 
 
375 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.210857  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01020  hypothetical protein  73.05 
 
 
375 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.154697  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2625  conserved hypothetical protein  73.05 
 
 
375 aa  553  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0630269  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1661  hypothetical protein  57.8 
 
 
375 aa  413  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0432  hypothetical protein  59.08 
 
 
371 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00842747 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3856  hypothetical protein  67.73 
 
 
275 aa  320  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.344115  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1957  hypothetical protein  60.38 
 
 
275 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551724  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1808  protein of unknown function DUF451  61.35 
 
 
281 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69294 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3370  hypothetical protein  61.9 
 
 
285 aa  299  5e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0182189  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2600  hypothetical protein  59.38 
 
 
272 aa  297  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2875  hypothetical protein  62.3 
 
 
274 aa  297  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.485418  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3599  hypothetical protein  61.51 
 
 
274 aa  297  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1736  hypothetical protein  60.57 
 
 
275 aa  294  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.387479  normal  0.0591392 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3311  hypothetical protein  57.66 
 
 
278 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3597  hypothetical protein  43.15 
 
 
402 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1810  protein of unknown function DUF451  43.19 
 
 
386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3858  hypothetical protein  41.16 
 
 
396 aa  279  5e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3368  hypothetical protein  41.57 
 
 
403 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0438739  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3279  hypothetical protein  52.94 
 
 
295 aa  263  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2873  hypothetical protein  41.05 
 
 
399 aa  252  7e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107096  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2598  hypothetical protein  39.42 
 
 
395 aa  249  7e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1915  hypothetical protein  38.44 
 
 
375 aa  239  5e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.395386 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5685  hypothetical protein  37.68 
 
 
376 aa  236  7e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.421727  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1734  hypothetical protein  40.62 
 
 
385 aa  219  8.999999999999998e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0725409  normal  0.221375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4774  hypothetical protein  37.57 
 
 
387 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1951  hypothetical protein  36.12 
 
 
378 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.406258 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3351  protein of unknown function DUF451  36.44 
 
 
385 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0591139  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0189  hypothetical protein  38.55 
 
 
385 aa  209  6e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0428055 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4288  hypothetical protein  36.99 
 
 
373 aa  209  8e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2353  hypothetical protein  35.96 
 
 
396 aa  205  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3313  hypothetical protein  36.44 
 
 
375 aa  203  4e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4912  hypothetical protein  36.18 
 
 
418 aa  196  8.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1955  putative lipoprotein  35.64 
 
 
365 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0906256  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4328  hypothetical protein  42.63 
 
 
309 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.924044  normal  0.20283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4621  hypothetical protein  42.63 
 
 
309 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223907  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1024  hypothetical protein  42.74 
 
 
292 aa  194  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000003997  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7008  hypothetical protein  35.57 
 
 
393 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.926109  normal  0.546103 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1567  Peptidase M75, Imelysin  35.48 
 
 
404 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25530  predicted periplasmic lipoprotein involved in iron transport  34.7 
 
 
406 aa  188  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0819691  normal  0.228645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3899  hypothetical protein  34.23 
 
 
410 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0203467 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0230  hypothetical protein  34.46 
 
 
409 aa  186  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0401  hypothetical protein  40.95 
 
 
284 aa  178  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0391  hypothetical protein  40.95 
 
 
284 aa  178  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4242  hypothetical protein  41.67 
 
 
228 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.711551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1777  iron permease FTR1  31.02 
 
 
691 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7481  iron permease FTR1  26.74 
 
 
438 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3403  iron permease FTR1  24.8 
 
 
702 aa  99.8  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6260  iron permease FTR1  24.34 
 
 
400 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  0.324266 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  22.92 
 
 
677 aa  73.6  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>