53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2693 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2693  cytochrome c class I  100 
 
 		 306 aa  624  1e-178  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12222  ubiquinol-cytochrome C reductase qcrC (cytochrome C subunit)  60.46 
 
 		 280 aa  322  7e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3056  cytochrome c class I  62.79 
 
 		 295 aa  302  5.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.294486  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3558  cytochrome c, class I  58.43 
 
 		 273 aa  299  4e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0912153 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2955  cytochrome c, class I  59.69 
 
 		 278 aa  297  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3292  cytochrome c, class I  58.05 
 
 		 272 aa  295  6e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.250177  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3303  cytochrome c, class I  58.05 
 
 		 272 aa  295  6e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3354  cytochrome c, class I  58.05 
 
 		 272 aa  295  6e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal  0.0591201 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1374  cytochrome c class I  51.79 
 
 		 270 aa  285  7e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317055  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10680  cytochrome c, mono- and diheme variants family  52.11 
 
 		 275 aa  272  6e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0523281  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3249  cytochrome c class I  56.85 
 
 		 255 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00726195  hitchhiker  0.0000284914 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3341  cytochrome c class I  47.13 
 
 		 295 aa  245  6e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3294  cytochrome c, class I  45.05 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79873  normal  0.176806 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3526  cytochrome c class I  44.24 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4119  cytochrome c class I  43.49 
 
 		 271 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.83541 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0963  cytochrome c, class I  42.45 
 
 		 268 aa  209  4e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0745087 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1891  cytochrome c class I  42.07 
 
 		 259 aa  209  4e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.527374  hitchhiker  0.000337472 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16190  cytochrome c, mono- and diheme variants family  38.75 
 
 		 263 aa  202  4e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188569  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1295  cytochrome c class I  41.67 
 
 		 276 aa  202  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2210  cytochrome c, class I  44.44 
 
 		 262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0119453  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15700  cytochrome c, mono- and diheme variants family  40.55 
 
 		 259 aa  193  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2676  hypothetical protein  43.88 
 
 		 269 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.543217 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3107  cytochrome c, class I  39.34 
 
 		 305 aa  191  9e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510771  normal  0.352992 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1678  cytochrome c class I  39.48 
 
 		 289 aa  189  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1947  cytochrome c class I  42.74 
 
 		 262 aa  188  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000151337 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14180  cytochrome c, mono- and diheme variants family  39.11 
 
 		 266 aa  185  7e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.616928  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12130  cytochrome c, mono- and diheme variants family  40.52 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.298886  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1447  cytochrome c class I  40 
 
 		 284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0356963  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3062  cytochrome c class I  40.62 
 
 		 303 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0184477  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1810  cytochrome c class I  35.93 
 
 		 294 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3251  cytochrome c class I  39.33 
 
 		 277 aa  172  7.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2076  cytochrome c class I  42.17 
 
 		 261 aa  172  9e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1021  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c subunit  35.23 
 
 		 307 aa  170  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.121328  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3135  cytochrome c, class I  42.91 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2009  cytochrome c class I  41.99 
 
 		 259 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3134  cytochrome c class I  30.46 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1827  cytochrome c class I  30.9 
 
 		 280 aa  136  5e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1569  cytochrome c, class I  33.96 
 
 		 241 aa  47.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0100945  normal  0.526038 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3572  hypothetical protein  30.77 
 
 		 272 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.26 
 
 		 308 aa  46.2  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6817  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.64 
 
 		 474 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.164997 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0456  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  22.93 
 
 		 312 aa  44.3  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.844005  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5973  cytochrome c class I  45 
 
 		 412 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  28.57 
 
 		 212 aa  44.3  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0353  cytochrome c family protein  28.38 
 
 		 357 aa  43.9  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0320  cytochrome c family protein  28.38 
 
 		 369 aa  43.9  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5127  extracellular solute-binding protein  30.4 
 
 		 415 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3241  extracellular solute-binding protein  30.4 
 
 		 415 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0294244  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1358  cb-type cytochrome c oxidase subunit III  32.91 
 
 		 152 aa  43.1  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.112598  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42120  hypothetical protein  29.89 
 
 		 273 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1092  cytochrome c class I  26.67 
 
 		 333 aa  43.1  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  27.27 
 
 		 125 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1014  Quinoprotein glucose dehydrogenase  31.68 
 
 		 732 aa  42.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.101534  normal  0.630139 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>