More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1843 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  51.92 
 
 
639 aa  688    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118564 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  64.35 
 
 
666 aa  905    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0940  AMP-dependent synthetase and ligase  48.64 
 
 
652 aa  640    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0266895  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  55.03 
 
 
652 aa  728    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  54.76 
 
 
636 aa  719    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  53.76 
 
 
632 aa  697    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  49.62 
 
 
655 aa  647    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  55.03 
 
 
652 aa  733    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  52.43 
 
 
667 aa  659    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  52.4 
 
 
660 aa  664    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  52.48 
 
 
644 aa  677    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  54.13 
 
 
636 aa  713    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  51.37 
 
 
657 aa  662    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  51.83 
 
 
655 aa  651    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  52.86 
 
 
638 aa  701    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  51.15 
 
 
667 aa  652    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  52.21 
 
 
666 aa  668    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  52.56 
 
 
661 aa  660    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  50.31 
 
 
652 aa  649    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  52.7 
 
 
649 aa  672    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  54.77 
 
 
648 aa  702    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  52.71 
 
 
656 aa  682    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  53.6 
 
 
632 aa  696    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  53.61 
 
 
631 aa  695    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  100 
 
 
666 aa  1356    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  55.95 
 
 
652 aa  741    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  51.75 
 
 
667 aa  655    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  49.62 
 
 
655 aa  647    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  52.01 
 
 
649 aa  639    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  52.64 
 
 
657 aa  663    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  53 
 
 
663 aa  662    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  48.97 
 
 
657 aa  639    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  52.43 
 
 
643 aa  674    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  68.62 
 
 
666 aa  969    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  50.97 
 
 
664 aa  674    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  52.16 
 
 
653 aa  670    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  54.44 
 
 
652 aa  682    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  54.25 
 
 
631 aa  698    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  51.32 
 
 
655 aa  637    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  54.17 
 
 
660 aa  696    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0262  acetyl-CoA synthetase  52.86 
 
 
661 aa  640    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  51.6 
 
 
650 aa  669    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  51.57 
 
 
655 aa  655    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  52.24 
 
 
639 aa  687    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  53.27 
 
 
649 aa  682    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  54.76 
 
 
636 aa  717    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  82.48 
 
 
670 aa  1137    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  50.23 
 
 
659 aa  650    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  51.85 
 
 
670 aa  672    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  54.05 
 
 
660 aa  685    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  53.4 
 
 
657 aa  671    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  57.69 
 
 
656 aa  750    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  51.05 
 
 
664 aa  664    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  52.08 
 
 
650 aa  683    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  53.17 
 
 
657 aa  646    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  53.09 
 
 
667 aa  671    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  63.89 
 
 
638 aa  843    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1846  acetyl-CoA synthetase  58.3 
 
 
692 aa  804    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  54.55 
 
 
674 aa  637    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  92.58 
 
 
667 aa  1276    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  55.56 
 
 
651 aa  682    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  53.01 
 
 
656 aa  674    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  52.55 
 
 
661 aa  655    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  85.97 
 
 
668 aa  1177    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  51.43 
 
 
664 aa  662    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  53.1 
 
 
656 aa  674    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  61.17 
 
 
664 aa  865    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  51.18 
 
 
680 aa  632  1e-180  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  51.54 
 
 
658 aa  633  1e-180  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  52.44 
 
 
661 aa  632  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  52.94 
 
 
654 aa  632  1e-180  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  47.95 
 
 
656 aa  632  1e-180  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  52.51 
 
 
629 aa  630  1e-179  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  51.86 
 
 
629 aa  628  1e-179  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  49.26 
 
 
661 aa  629  1e-179  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  50.47 
 
 
658 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3168  acetate/CoA ligase  53.81 
 
 
670 aa  630  1e-179  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0566588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  49.69 
 
 
666 aa  626  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  49.62 
 
 
656 aa  625  1e-178  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  50.62 
 
 
657 aa  628  1e-178  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  50.08 
 
 
649 aa  628  1e-178  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  49.69 
 
 
660 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  49.36 
 
 
658 aa  626  1e-178  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  49.69 
 
 
660 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0611  acetate/CoA ligase  53.4 
 
 
667 aa  625  1e-178  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  48.37 
 
 
660 aa  624  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18230  acetyl-coenzyme A synthetase  52.07 
 
 
646 aa  625  1e-177  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.276557  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  49.04 
 
 
658 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  49.11 
 
 
655 aa  623  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2823  acetyl-coenzyme A synthetase  51.79 
 
 
659 aa  624  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.252504  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  50.39 
 
 
715 aa  624  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  51.6 
 
 
644 aa  622  1e-177  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  48.14 
 
 
658 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4841  acetate/CoA ligase  51.37 
 
 
653 aa  623  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  50.47 
 
 
663 aa  622  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  49.69 
 
 
632 aa  622  1e-177  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2132  acetate/CoA ligase  51.03 
 
 
661 aa  619  1e-176  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000882017  normal  0.24992 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  52.19 
 
 
629 aa  619  1e-176  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1576  acetate/CoA ligase  47.83 
 
 
648 aa  619  1e-176  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000882243  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3378  acetyl-coenzyme A synthetase  53.09 
 
 
676 aa  620  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.450372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>