39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0686 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0686  putative RNA methylase  100 
 
 
224 aa  449  1e-125  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502689  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1659  putative RNA methylase  65.92 
 
 
224 aa  317  1e-85  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.69991  hitchhiker  0.00475931 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0592  putative RNA methylase  69.09 
 
 
225 aa  308  2.9999999999999997e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1984  putative RNA methylase  65 
 
 
227 aa  287  1e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  31.68 
 
 
367 aa  81.6  0.000000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2015  putative RNA methylase  32.1 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  31.65 
 
 
364 aa  75.5  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1789  putative RNA methylase  36.42 
 
 
304 aa  75.5  0.0000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  33.75 
 
 
351 aa  75.1  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  33.75 
 
 
350 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  32.28 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  40 
 
 
310 aa  65.5  0.0000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  33.04 
 
 
315 aa  63.5  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  35.54 
 
 
317 aa  63.2  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  37.89 
 
 
317 aa  59.3  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  37.37 
 
 
334 aa  58.2  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0615  putative RNA methylase  29.02 
 
 
247 aa  57  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  36 
 
 
343 aa  56.2  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  40.23 
 
 
346 aa  55.8  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  39.13 
 
 
355 aa  55.5  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00740  hypothetical protein  32 
 
 
475 aa  53.1  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.635907  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  37.08 
 
 
344 aa  52.4  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  36.47 
 
 
318 aa  51.6  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0700  putative RNA methylase  32.86 
 
 
374 aa  51.2  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46275  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  30.95 
 
 
389 aa  48.9  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10450  RNA methylase family UPF0020 protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12140)  27.93 
 
 
499 aa  48.5  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45681  predicted protein  27.33 
 
 
591 aa  46.2  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  35.29 
 
 
322 aa  46.2  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1367  protein of unknown function Met10  33 
 
 
380 aa  45.1  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0030  methylase  26.47 
 
 
177 aa  45.1  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0552  methyltransferase small  32 
 
 
380 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  27.97 
 
 
317 aa  43.5  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2938  modification methylase, HemK family  34.74 
 
 
282 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.557385  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3607  putative methyltransferase  30.23 
 
 
195 aa  43.5  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0286  SAM-dependent methyltransferase  31 
 
 
380 aa  42.7  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  34.34 
 
 
279 aa  42.7  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  23.85 
 
 
262 aa  42  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46959  predicted protein  25.1 
 
 
460 aa  41.6  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.897224  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.36 
 
 
287 aa  41.6  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>