More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1861 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  100 
 
 
178 aa  350  5e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  69.59 
 
 
174 aa  226  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  57.14 
 
 
197 aa  187  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  54.65 
 
 
189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  54.44 
 
 
186 aa  182  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  53.8 
 
 
189 aa  179  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  53.8 
 
 
186 aa  175  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  52.05 
 
 
184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  52.63 
 
 
186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  51.72 
 
 
184 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  50.29 
 
 
186 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  52.05 
 
 
186 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1029  cytochrome b561  62.94 
 
 
181 aa  170  7.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145738  normal  0.0105144 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  50.88 
 
 
186 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  50.88 
 
 
186 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  49.71 
 
 
186 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  50.88 
 
 
186 aa  168  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  50.29 
 
 
186 aa  167  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  48.04 
 
 
185 aa  166  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  49.12 
 
 
182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  48.31 
 
 
197 aa  162  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  50.88 
 
 
206 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  47.13 
 
 
195 aa  155  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  54.71 
 
 
172 aa  153  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0471  cytochrome B561  55.25 
 
 
209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  46.02 
 
 
188 aa  150  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  45.4 
 
 
193 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  43.68 
 
 
193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  45.98 
 
 
182 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  45.71 
 
 
184 aa  142  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  47.16 
 
 
183 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2380  cytochrome b561, putative  53.22 
 
 
187 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1157  putative cytochrome b561  53.22 
 
 
187 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0295  putative cytochrome b561  53.22 
 
 
187 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3379  cytochrome B561  53.22 
 
 
187 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3336  cytochrome B561  53.22 
 
 
187 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  42.86 
 
 
188 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  53.22 
 
 
187 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2565  putative cytochrome b561  53.22 
 
 
187 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  43.02 
 
 
176 aa  134  8e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1271  cytochrome b561, putative  51.18 
 
 
187 aa  134  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  46.15 
 
 
190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  48.33 
 
 
203 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  44.44 
 
 
203 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  47.95 
 
 
183 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  41.86 
 
 
176 aa  130  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  40.34 
 
 
178 aa  125  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2955  cytochrome B561  47.13 
 
 
188 aa  124  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.593019  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  42.62 
 
 
222 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  48.33 
 
 
201 aa  121  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  44.77 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  41.53 
 
 
199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  42.86 
 
 
188 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  37.57 
 
 
173 aa  118  4.9999999999999996e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  39.08 
 
 
180 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  38.76 
 
 
183 aa  117  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1538  cytochrome B561  45.14 
 
 
191 aa  118  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.757647 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  43.6 
 
 
178 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  38.86 
 
 
183 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  39.43 
 
 
183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  38.29 
 
 
183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  38.86 
 
 
183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  39.66 
 
 
196 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  38.2 
 
 
182 aa  114  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  40.7 
 
 
187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  38.2 
 
 
182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  40.57 
 
 
175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  39.08 
 
 
176 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  40.57 
 
 
175 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  40.57 
 
 
174 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  41.86 
 
 
190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  39.08 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  40 
 
 
175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  43.18 
 
 
188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  39.08 
 
 
176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  40.94 
 
 
180 aa  108  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  38.71 
 
 
187 aa  108  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  38.55 
 
 
190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  37.87 
 
 
188 aa  107  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  38.51 
 
 
177 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  43.24 
 
 
197 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  38.51 
 
 
176 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  36.52 
 
 
186 aa  106  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  38.51 
 
 
176 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  35.43 
 
 
181 aa  106  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  38.29 
 
 
191 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  38.51 
 
 
177 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  34.71 
 
 
175 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  39.41 
 
 
179 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1610  cytochrome B561  36 
 
 
184 aa  105  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.726643  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  37.14 
 
 
196 aa  103  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  36.69 
 
 
190 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  34.5 
 
 
176 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  37.16 
 
 
441 aa  102  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  38.62 
 
 
410 aa  102  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03240  cytochrome b561  44.31 
 
 
184 aa  102  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  33.53 
 
 
175 aa  101  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  37.65 
 
 
179 aa  101  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  36.52 
 
 
188 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  36.52 
 
 
188 aa  100  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>