More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0979 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0979  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 129 aa  257  3e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0952453  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1112  30S ribosomal protein S11  74.22 
 
 		 130 aa  203  8e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169024  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1318  30S ribosomal protein S11  73.44 
 
 		 130 aa  199  8e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000513052  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1368  30S ribosomal protein S11  73.44 
 
 		 130 aa  199  8e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  62.6 
 
 		 131 aa  166  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0764  ribosomal protein S11  67.29 
 
 		 129 aa  164  5.9999999999999996e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1498  30S ribosomal protein S11  64.06 
 
 		 128 aa  160  8.000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1006  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 131 aa  159  9e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109839  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  53.91 
 
 		 129 aa  157  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  53.91 
 
 		 129 aa  157  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  55.47 
 
 		 129 aa  155  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  59.38 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494342  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1116  ribosomal protein S11  60.83 
 
 		 134 aa  154  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625499  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  55.47 
 
 		 129 aa  155  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  54.69 
 
 		 129 aa  154  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0608  30S ribosomal protein S11  59.09 
 
 		 134 aa  153  6e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  53.91 
 
 		 129 aa  153  8e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  53.91 
 
 		 129 aa  153  8e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  53.91 
 
 		 129 aa  153  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  53.91 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4481  30S ribosomal protein S11  61.67 
 
 		 135 aa  152  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.401787  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  52.34 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3671  30S ribosomal protein S11  62.18 
 
 		 135 aa  152  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0291  30S ribosomal protein S11  57.36 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000693018  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1157  ribosomal protein S11  58.59 
 
 		 130 aa  151  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000562813  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3384  30S ribosomal protein S11  63.03 
 
 		 137 aa  151  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  51.56 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  53.12 
 
 		 129 aa  151  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  56.25 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04250  SSU ribosomal protein S11P  63.33 
 
 		 135 aa  151  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.333159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  53.12 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1719  30S ribosomal protein S11  60.16 
 
 		 130 aa  150  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000100084  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  51.2 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  51.2 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  52.34 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  51.56 
 
 		 130 aa  150  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1434  30S ribosomal protein S11  61.67 
 
 		 137 aa  150  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  51.2 
 
 		 129 aa  150  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4292  ribosomal protein S11  60 
 
 		 133 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4972  30S ribosomal protein S11  62.18 
 
 		 136 aa  150  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1140  30S ribosomal protein S11  62.18 
 
 		 138 aa  150  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  52.34 
 
 		 129 aa  150  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1111  30S ribosomal protein S11  62.18 
 
 		 138 aa  150  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1128  30S ribosomal protein S11  62.18 
 
 		 138 aa  150  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  51.56 
 
 		 129 aa  150  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  50.78 
 
 		 130 aa  150  8e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5151  30S ribosomal protein S11  60.66 
 
 		 134 aa  150  8e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.589824 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  53.49 
 
 		 131 aa  149  8.999999999999999e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2619  30S ribosomal protein S11  58.33 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  57.14 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3877  30S ribosomal protein S11  60.83 
 
 		 135 aa  149  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  51.56 
 
 		 129 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0251  ribosomal protein S11  57.81 
 
 		 128 aa  148  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118892  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0332  30S ribosomal protein S11  57.14 
 
 		 135 aa  148  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.147865  hitchhiker  0.000897065 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0498  ribosomal protein S11  52.34 
 
 		 126 aa  149  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.423848  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2685  30S ribosomal protein S11  62.18 
 
 		 138 aa  148  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000312441  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0424  ribosomal protein S11  56.64 
 
 		 132 aa  148  3e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  57.14 
 
 		 131 aa  147  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  50 
 
 		 129 aa  147  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2204  30S ribosomal protein S11  52.94 
 
 		 127 aa  148  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000733078  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2271  30S ribosomal protein S11  53.33 
 
 		 127 aa  147  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0715573  hitchhiker  0.00306589 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  54.69 
 
 		 128 aa  147  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2039  30S ribosomal protein S11  52.46 
 
 		 127 aa  147  6e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000528036  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  50.78 
 
 		 129 aa  147  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  50.78 
 
 		 129 aa  147  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6024  30S ribosomal protein S11  62.5 
 
 		 134 aa  146  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1170  ribosomal protein S11  59.17 
 
 		 136 aa  146  9e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2130  30S ribosomal protein S11  62.04 
 
 		 135 aa  146  9e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.012863  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13496  30S ribosomal protein S11  61.34 
 
 		 139 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2344e-17  normal  0.330141 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0624  30S ribosomal protein S11  54.69 
 
 		 129 aa  146  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000665656  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4288  30S ribosomal protein S11  60.83 
 
 		 135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000331944 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  56.25 
 
 		 129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3897  30S ribosomal protein S11  60.83 
 
 		 135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0205  30S ribosomal protein S11  55.45 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000759645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  54.46 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3886  30S ribosomal protein S11  52.34 
 
 		 129 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  56.25 
 
 		 129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1160  30S ribosomal protein S11  58.82 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271221  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06480  30S ribosomal protein S11  52.34 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3138  30S ribosomal protein S11  59.63 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0205896  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4001  30S ribosomal protein S11  57.14 
 
 		 138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000341479  hitchhiker  0.000619325 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09090  30S ribosomal protein S11  52.34 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0612  ribosomal protein S11  62.02 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0860  30S ribosomal protein S11  52.34 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0312  30S ribosomal protein S11  58.59 
 
 		 129 aa  145  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.830269  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0477  30S ribosomal protein S11  51.56 
 
 		 129 aa  144  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237439 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4726  30S ribosomal protein S11  51.56 
 
 		 129 aa  144  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49415  normal  0.352381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0962  ribosomal protein S11  59.17 
 
 		 136 aa  144  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.837228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0510  30S ribosomal protein S11  51.56 
 
 		 129 aa  144  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  0.0188454 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  54.46 
 
 		 137 aa  145  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0627  30S ribosomal protein S11  52 
 
 		 129 aa  144  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0448  30S ribosomal protein S11  59.38 
 
 		 129 aa  144  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0770716  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  54.46 
 
 		 129 aa  145  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2751  ribosomal protein S11  55.2 
 
 		 129 aa  144  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2806  ribosomal protein S11  57.94 
 
 		 132 aa  145  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000365846  decreased coverage  0.00000000490593 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0714  30S ribosomal protein S11  59.84 
 
 		 135 aa  144  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.119408 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2210  30S ribosomal protein S11  54.69 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3161  30S ribosomal protein S11  55.36 
 
 		 129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.560785  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0276  30S ribosomal protein S11  56.69 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0506  30S ribosomal protein S11  51.56 
 
 		 129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290118  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>