More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0627 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0627  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 129 aa  263  5.999999999999999e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5762  30S ribosomal protein S11  77.97 
 
 		 131 aa  204  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0172  30S ribosomal protein S11  71.32 
 
 		 130 aa  196  1.0000000000000001e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.183798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3138  30S ribosomal protein S11  74.58 
 
 		 135 aa  194  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0205896  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0373  30S ribosomal protein S11  67.46 
 
 		 127 aa  189  9e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1913  30S ribosomal protein S11  73.04 
 
 		 128 aa  189  1e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05840  30S ribosomal protein S11  71.05 
 
 		 137 aa  175  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0407415  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1171  30S ribosomal protein S11  73.68 
 
 		 133 aa  172  9.999999999999999e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2271  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 127 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0715573  hitchhiker  0.00306589 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1640  ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 133 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.218651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4368  30S ribosomal protein S11  74.8 
 
 		 131 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.276482  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2039  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 		 127 aa  170  5.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000528036  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2204  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 127 aa  168  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000733078  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0205  30S ribosomal protein S11  67.26 
 
 		 127 aa  167  4e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000759645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1549  ribosomal protein S11  63.36 
 
 		 131 aa  167  5e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1826  30S ribosomal protein S11  67.26 
 
 		 127 aa  166  8e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0867  ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.322465  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0314  30S ribosomal protein S11  65.49 
 
 		 127 aa  164  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000333021  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2398  30S ribosomal protein S11  67.26 
 
 		 127 aa  164  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000513173  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  58.91 
 
 		 129 aa  163  9e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  63.96 
 
 		 129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  66.07 
 
 		 131 aa  162  1.0000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  63.96 
 
 		 129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  63.96 
 
 		 129 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  63.96 
 
 		 129 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  63.72 
 
 		 131 aa  158  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  58.14 
 
 		 129 aa  158  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  58.14 
 
 		 129 aa  157  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  57.36 
 
 		 129 aa  157  4e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  58.14 
 
 		 129 aa  157  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0624  30S ribosomal protein S11  57.36 
 
 		 129 aa  157  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000665656  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  57.36 
 
 		 129 aa  157  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  57.36 
 
 		 129 aa  157  7e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  63.06 
 
 		 129 aa  156  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  61.06 
 
 		 137 aa  156  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0591  30S ribosomal protein S11  65.77 
 
 		 136 aa  155  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.648378  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  61.95 
 
 		 131 aa  155  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  61.26 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0131  30S ribosomal protein S11  58.14 
 
 		 129 aa  155  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000108519  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4001  30S ribosomal protein S11  62.83 
 
 		 138 aa  155  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000341479  hitchhiker  0.000619325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  61.26 
 
 		 131 aa  155  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  55.81 
 
 		 129 aa  154  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1160  30S ribosomal protein S11  63.72 
 
 		 139 aa  154  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271221  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  60.18 
 
 		 131 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1116  ribosomal protein S11  64.86 
 
 		 134 aa  153  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625499  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  55.81 
 
 		 129 aa  153  8e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  55.81 
 
 		 129 aa  153  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  55.81 
 
 		 129 aa  153  8e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  60.36 
 
 		 129 aa  153  9e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  55.81 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0616  30S ribosomal protein S11  52.71 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  61.26 
 
 		 130 aa  151  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  61.26 
 
 		 129 aa  151  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1012  30S ribosomal protein S11  56.15 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00012191  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  53.91 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  61.26 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0438  ribosomal protein S11  62.16 
 
 		 183 aa  151  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00108118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  55.04 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0498  ribosomal protein S11  57.36 
 
 		 126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.423848  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01430  ribosomal protein S11  63.06 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000902694  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4292  ribosomal protein S11  65.77 
 
 		 133 aa  150  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  61.26 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0477  30S ribosomal protein S11  61.72 
 
 		 130 aa  150  4e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000422996  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  59.02 
 
 		 128 aa  150  5e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  60.36 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  63.96 
 
 		 130 aa  150  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494342  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  55.81 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0608  30S ribosomal protein S11  63.96 
 
 		 134 aa  150  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  60.36 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  61.26 
 
 		 129 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  54.26 
 
 		 129 aa  150  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2941  30S ribosomal protein S11  62.2 
 
 		 133 aa  150  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113794  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6024  30S ribosomal protein S11  63.96 
 
 		 134 aa  149  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_002936  DET0500  30S ribosomal protein S11  61.72 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000251151  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3641  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000343638  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_442  ribosomal protein S11  61.72 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000234354  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0137  30S ribosomal protein S11  56.59 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000197157  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2999  30S ribosomal protein S11  61.06 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737948 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0308  30S ribosomal protein S11  53.49 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0082  30S ribosomal protein S11  53.49 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000625128  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  55.04 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3877  30S ribosomal protein S11  58.59 
 
 		 135 aa  149  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5151  30S ribosomal protein S11  64.86 
 
 		 134 aa  148  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.589824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3897  30S ribosomal protein S11  64.86 
 
 		 135 aa  149  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0276  30S ribosomal protein S11  58.33 
 
 		 132 aa  149  2e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16910  SSU ribosomal protein S11P  63.39 
 
 		 134 aa  148  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1215  30S ribosomal protein S11  65.18 
 
 		 132 aa  148  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0134437 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4288  30S ribosomal protein S11  64.86 
 
 		 135 aa  149  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000331944 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3161  30S ribosomal protein S11  60.36 
 
 		 129 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.560785  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0236  30S ribosomal protein S11  60.36 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000127993  unclonable  0.00000919144 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0764  ribosomal protein S11  63.21 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2619  30S ribosomal protein S11  64.86 
 
 		 134 aa  148  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3886  30S ribosomal protein S11  53.49 
 
 		 129 aa  147  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00961  30S ribosomal protein S11  53.85 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000322377  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0278  30S ribosomal protein S11  53.49 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  0.618273 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0612  ribosomal protein S11  63.39 
 
 		 135 aa  148  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0130  30S ribosomal protein S11  58.14 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000100663  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0181  30S ribosomal protein S11  53.85 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000807145  hitchhiker  0.00156032 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3671  30S ribosomal protein S11  57.81 
 
 		 135 aa  147  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0783  30S ribosomal protein S11  53.49 
 
 		 129 aa  147  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483609  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>