More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2204 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2204  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 127 aa  259  6.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000733078  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2271  30S ribosomal protein S11  89.76 
 
 		 127 aa  243  8e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0715573  hitchhiker  0.00306589 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2039  30S ribosomal protein S11  89.76 
 
 		 127 aa  242  9.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000528036  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0205  30S ribosomal protein S11  94.49 
 
 		 127 aa  236  5.999999999999999e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000759645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1826  30S ribosomal protein S11  93.7 
 
 		 127 aa  236  9e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2398  30S ribosomal protein S11  92.13 
 
 		 127 aa  231  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000513173  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0314  30S ribosomal protein S11  88.98 
 
 		 127 aa  229  1e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000333021  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  63.71 
 
 		 129 aa  170  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  63.71 
 
 		 129 aa  170  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  63.71 
 
 		 129 aa  170  6.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5762  30S ribosomal protein S11  64.1 
 
 		 131 aa  170  6.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  64.66 
 
 		 137 aa  168  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0627  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 129 aa  168  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3138  30S ribosomal protein S11  60.68 
 
 		 135 aa  168  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0205896  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  60.48 
 
 		 128 aa  166  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  60.32 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  59.02 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  64.6 
 
 		 131 aa  166  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  62.83 
 
 		 131 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 129 aa  164  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1160  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 		 139 aa  163  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271221  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  57.94 
 
 		 129 aa  163  8e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4001  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 138 aa  163  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000341479  hitchhiker  0.000619325 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  57.94 
 
 		 129 aa  163  9e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  57.38 
 
 		 129 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1549  ribosomal protein S11  59.2 
 
 		 131 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  55.65 
 
 		 131 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  60.18 
 
 		 131 aa  161  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1012  30S ribosomal protein S11  58.54 
 
 		 130 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00012191  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  57.85 
 
 		 129 aa  160  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  56.91 
 
 		 133 aa  160  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  56.91 
 
 		 133 aa  160  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  56.91 
 
 		 133 aa  160  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  56.91 
 
 		 133 aa  160  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  56.91 
 
 		 133 aa  160  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  56.91 
 
 		 133 aa  160  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  56.91 
 
 		 133 aa  160  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  56.91 
 
 		 133 aa  160  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2999  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 137 aa  160  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737948 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2735  30S ribosomal protein S11  56.91 
 
 		 133 aa  160  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  56.91 
 
 		 133 aa  160  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  56.91 
 
 		 133 aa  160  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  56.91 
 
 		 133 aa  160  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  56.91 
 
 		 133 aa  160  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  56.91 
 
 		 133 aa  160  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  56.91 
 
 		 133 aa  160  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0373  30S ribosomal protein S11  53.54 
 
 		 127 aa  159  8.000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0649  ribosomal protein S11  58.06 
 
 		 129 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4526  30S ribosomal protein S11  58.06 
 
 		 129 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.828676  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5057  30S ribosomal protein S11  58.06 
 
 		 129 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000518123  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  56.91 
 
 		 134 aa  159  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  56.91 
 
 		 134 aa  159  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  56.91 
 
 		 134 aa  159  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  54.55 
 
 		 131 aa  159  9e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0251  ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 128 aa  159  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118892  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  55.56 
 
 		 129 aa  159  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1923  30S ribosomal protein S11  57.85 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194942  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2301  30S ribosomal protein S11  57.26 
 
 		 129 aa  159  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.598814  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  61.26 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2930  30S ribosomal protein S11  65.57 
 
 		 134 aa  158  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000145745  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  56.35 
 
 		 130 aa  159  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  57.85 
 
 		 129 aa  158  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4368  30S ribosomal protein S11  69.44 
 
 		 131 aa  159  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.276482  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  57.85 
 
 		 130 aa  158  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 131 aa  159  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  58.2 
 
 		 129 aa  158  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1315  ribosomal protein S11  61.67 
 
 		 132 aa  158  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.515443  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  54.76 
 
 		 129 aa  157  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06480  30S ribosomal protein S11  57.26 
 
 		 129 aa  158  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0172  30S ribosomal protein S11  56.67 
 
 		 130 aa  158  3e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.183798 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3886  30S ribosomal protein S11  56.45 
 
 		 129 aa  157  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0137  30S ribosomal protein S11  62.4 
 
 		 129 aa  158  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000197157  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0860  30S ribosomal protein S11  57.26 
 
 		 129 aa  158  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  57.85 
 
 		 129 aa  158  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1860  30S ribosomal protein S11  59.82 
 
 		 136 aa  158  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  54.76 
 
 		 129 aa  157  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09090  30S ribosomal protein S11  57.26 
 
 		 129 aa  158  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  54.76 
 
 		 129 aa  157  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0624  30S ribosomal protein S11  56.91 
 
 		 129 aa  157  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000665656  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0131  30S ribosomal protein S11  60.8 
 
 		 129 aa  157  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000108519  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  54.33 
 
 		 135 aa  157  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  57.02 
 
 		 129 aa  157  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0477  30S ribosomal protein S11  56.45 
 
 		 129 aa  157  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237439 
 
 
-
 
NC_002950  PG1913  30S ribosomal protein S11  56.9 
 
 		 128 aa  157  5e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1640  ribosomal protein S11  59.2 
 
 		 133 aa  157  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.218651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0510  30S ribosomal protein S11  56.45 
 
 		 129 aa  157  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  0.0188454 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1580  30S ribosomal protein S11  59.35 
 
 		 130 aa  157  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0220248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4726  30S ribosomal protein S11  56.45 
 
 		 129 aa  157  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49415  normal  0.352381 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  63.93 
 
 		 130 aa  157  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494342  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0512  30S ribosomal protein S11  55.81 
 
 		 129 aa  157  6e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11652  hitchhiker  0.00952872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0506  30S ribosomal protein S11  55.65 
 
 		 129 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  57.02 
 
 		 129 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0507  30S ribosomal protein S11  55.81 
 
 		 129 aa  157  6e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00376989  normal  0.069652 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0236  30S ribosomal protein S11  58.2 
 
 		 130 aa  157  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000127993  unclonable  0.00000919144 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  53.97 
 
 		 129 aa  157  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0481  30S ribosomal protein S11  53.17 
 
 		 130 aa  157  7e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0315  30S ribosomal protein S11  65.04 
 
 		 129 aa  156  8e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.50356e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>