More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1640 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1640  ribosomal protein S11  100 
 
 		 133 aa  271  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.218651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0373  30S ribosomal protein S11  70.97 
 
 		 127 aa  191  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0172  30S ribosomal protein S11  68.18 
 
 		 130 aa  189  1e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.183798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5762  30S ribosomal protein S11  70 
 
 		 131 aa  187  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3138  30S ribosomal protein S11  71.19 
 
 		 135 aa  187  5e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0205896  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0627  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 129 aa  186  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05840  30S ribosomal protein S11  73.68 
 
 		 137 aa  184  3e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0407415  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1913  30S ribosomal protein S11  68.97 
 
 		 128 aa  174  5e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2271  30S ribosomal protein S11  60.8 
 
 		 127 aa  171  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0715573  hitchhiker  0.00306589 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2039  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 127 aa  168  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000528036  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4368  30S ribosomal protein S11  70.77 
 
 		 131 aa  167  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.276482  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2204  30S ribosomal protein S11  59.2 
 
 		 127 aa  167  4e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000733078  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1171  30S ribosomal protein S11  73.68 
 
 		 133 aa  167  4e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  60.32 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0205  30S ribosomal protein S11  64.86 
 
 		 127 aa  165  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000759645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  59.52 
 
 		 129 aa  164  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1826  30S ribosomal protein S11  64.86 
 
 		 127 aa  164  4e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  59.52 
 
 		 129 aa  164  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0314  30S ribosomal protein S11  63.96 
 
 		 127 aa  163  9e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000333021  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  56.39 
 
 		 133 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  56.39 
 
 		 133 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  56.39 
 
 		 133 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  56.39 
 
 		 133 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  56.39 
 
 		 133 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  56.39 
 
 		 133 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  56.39 
 
 		 133 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  56.39 
 
 		 133 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  56.39 
 
 		 133 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2735  30S ribosomal protein S11  56.39 
 
 		 133 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  56.39 
 
 		 133 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  56.39 
 
 		 133 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  56.39 
 
 		 133 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  56.39 
 
 		 133 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  56.39 
 
 		 133 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3273  30S ribosomal protein S11  55.64 
 
 		 133 aa  161  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2926  30S ribosomal protein S11  55.64 
 
 		 133 aa  161  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  58.73 
 
 		 128 aa  161  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2995  30S ribosomal protein S11  55.64 
 
 		 133 aa  160  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 129 aa  160  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2398  30S ribosomal protein S11  63.06 
 
 		 127 aa  160  8.000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000513173  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  55.97 
 
 		 134 aa  158  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  55.97 
 
 		 134 aa  158  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  55.97 
 
 		 134 aa  158  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  62.16 
 
 		 131 aa  158  3e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1112  30S ribosomal protein S11  55.64 
 
 		 130 aa  158  3e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169024  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  62.16 
 
 		 130 aa  157  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  56.92 
 
 		 131 aa  157  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0438  ribosomal protein S11  59.29 
 
 		 183 aa  156  8e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00108118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  61.26 
 
 		 131 aa  156  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1549  ribosomal protein S11  55.38 
 
 		 131 aa  156  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  54.07 
 
 		 135 aa  155  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  61.26 
 
 		 131 aa  155  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0624  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 129 aa  154  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000665656  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  59.5 
 
 		 129 aa  154  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  60.36 
 
 		 131 aa  154  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  54.14 
 
 		 133 aa  154  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  60.36 
 
 		 129 aa  154  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0982  30S ribosomal protein S11  63.96 
 
 		 131 aa  154  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000271815  hitchhiker  0.00410898 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  61.79 
 
 		 130 aa  153  8e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494342  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1012  30S ribosomal protein S11  57.14 
 
 		 130 aa  153  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00012191  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  59.46 
 
 		 137 aa  153  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4253  ribosomal protein S11  61.26 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000354003  unclonable  0.00000000000249554 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0477  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237439 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  55.64 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  59.46 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0506  30S ribosomal protein S11  57.85 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1318  30S ribosomal protein S11  51.54 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000513052  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  61.26 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  61.26 
 
 		 129 aa  153  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1368  30S ribosomal protein S11  51.54 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0510  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  0.0188454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4726  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49415  normal  0.352381 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2301  30S ribosomal protein S11  56.2 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.598814  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0207  30S ribosomal protein S11  59.5 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000194302  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3886  30S ribosomal protein S11  58.06 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  54.89 
 
 		 131 aa  152  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0236  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000127993  unclonable  0.00000919144 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0131  30S ribosomal protein S11  57.89 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000108519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0649  ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0591  30S ribosomal protein S11  63.39 
 
 		 136 aa  152  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.648378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4526  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.828676  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5057  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000518123  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4667  30S ribosomal protein S11  59.5 
 
 		 130 aa  151  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000031185  unclonable  0.00000000812252 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4219  30S ribosomal protein S11  54.48 
 
 		 134 aa  152  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.815037  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  59.46 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0181  30S ribosomal protein S11  57.14 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000807145  hitchhiker  0.00156032 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06480  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2302  30S ribosomal protein S11  56.1 
 
 		 127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.12621  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0193  30S ribosomal protein S11  59.5 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310597  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0860  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09090  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4296  30S ribosomal protein S11  59.5 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000132773  unclonable  0.0000000000385388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1116  ribosomal protein S11  62.5 
 
 		 134 aa  150  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625499  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00961  30S ribosomal protein S11  56.39 
 
 		 130 aa  150  7e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000322377  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0512  30S ribosomal protein S11  56.8 
 
 		 129 aa  150  8e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11652  hitchhiker  0.00952872 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4292  ribosomal protein S11  63.39 
 
 		 133 aa  149  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0507  30S ribosomal protein S11  56.8 
 
 		 129 aa  150  8e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00376989  normal  0.069652 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0074  30S ribosomal protein S11  58.56 
 
 		 135 aa  150  8e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.475977  hitchhiker  0.00000000906112 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3877  30S ribosomal protein S11  56.49 
 
 		 135 aa  149  8.999999999999999e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>