More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1860 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1860  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 136 aa  277  4e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4219  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 		 134 aa  164  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.815037  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  64.46 
 
 		 128 aa  164  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  57.35 
 
 		 135 aa  162  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2271  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 127 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0715573  hitchhiker  0.00306589 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  58.33 
 
 		 133 aa  161  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2039  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 127 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000528036  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5047  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 134 aa  162  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3273  30S ribosomal protein S11  58.33 
 
 		 133 aa  161  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2926  30S ribosomal protein S11  58.33 
 
 		 133 aa  161  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0343  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 134 aa  161  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255505  hitchhiker  0.000136373 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0499  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 134 aa  161  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2204  30S ribosomal protein S11  57.85 
 
 		 127 aa  160  4.0000000000000004e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000733078  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0428  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 130 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.316417  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 129 aa  160  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0205  30S ribosomal protein S11  61.61 
 
 		 127 aa  160  5.0000000000000005e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000759645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 129 aa  160  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 129 aa  160  6e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  62.5 
 
 		 130 aa  160  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2995  30S ribosomal protein S11  57.58 
 
 		 133 aa  160  7e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0624  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 134 aa  159  9e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0396  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 134 aa  159  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1045  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 134 aa  159  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0314  30S ribosomal protein S11  61.61 
 
 		 127 aa  159  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000333021  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0404  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 134 aa  159  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  59.5 
 
 		 129 aa  159  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 131 aa  159  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  59.5 
 
 		 129 aa  159  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  61.61 
 
 		 131 aa  158  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2303  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 134 aa  158  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1826  30S ribosomal protein S11  61.61 
 
 		 127 aa  159  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  63.39 
 
 		 131 aa  159  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  62.1 
 
 		 129 aa  159  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  57.58 
 
 		 133 aa  158  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  57.58 
 
 		 133 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  57.58 
 
 		 133 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  57.58 
 
 		 133 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  57.58 
 
 		 133 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  57.58 
 
 		 133 aa  158  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  57.58 
 
 		 133 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  57.58 
 
 		 133 aa  158  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  57.58 
 
 		 133 aa  158  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  57.58 
 
 		 133 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2735  30S ribosomal protein S11  57.58 
 
 		 133 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3925  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 134 aa  158  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  57.58 
 
 		 133 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  57.58 
 
 		 133 aa  158  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  57.58 
 
 		 133 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  57.58 
 
 		 133 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  60.48 
 
 		 134 aa  157  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  60.48 
 
 		 134 aa  157  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  60.48 
 
 		 134 aa  157  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  56.39 
 
 		 131 aa  157  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 129 aa  157  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3419  30S ribosomal protein S11  56.82 
 
 		 133 aa  157  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.119474 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0624  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 129 aa  156  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000665656  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  59.5 
 
 		 130 aa  156  8e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  56.2 
 
 		 129 aa  156  9e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  55.38 
 
 		 131 aa  155  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0291  30S ribosomal protein S11  56.69 
 
 		 130 aa  156  1e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000693018  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  59.5 
 
 		 129 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 130 aa  155  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0171  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 130 aa  155  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000137898  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0236  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 130 aa  156  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000127993  unclonable  0.00000919144 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00961  30S ribosomal protein S11  59.5 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000322377  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 129 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  56.2 
 
 		 129 aa  155  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  58.93 
 
 		 131 aa  155  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 129 aa  155  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  62.5 
 
 		 137 aa  155  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 129 aa  155  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1012  30S ribosomal protein S11  59.5 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00012191  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 129 aa  155  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2398  30S ribosomal protein S11  60.71 
 
 		 127 aa  155  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000513173  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0181  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000807145  hitchhiker  0.00156032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0860  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 129 aa  154  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0193  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 130 aa  154  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310597  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09090  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 129 aa  154  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0207  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 130 aa  155  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000194302  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06480  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 129 aa  154  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4667  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 130 aa  154  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000031185  unclonable  0.00000000812252 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1318  30S ribosomal protein S11  50 
 
 		 130 aa  154  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000513052  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 129 aa  154  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1368  30S ribosomal protein S11  50 
 
 		 130 aa  154  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4296  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 130 aa  154  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000132773  unclonable  0.0000000000385388 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3886  30S ribosomal protein S11  59.5 
 
 		 129 aa  154  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3892  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 129 aa  154  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000147745  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4253  ribosomal protein S11  61.61 
 
 		 130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000354003  unclonable  0.00000000000249554 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0604  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 129 aa  154  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650942  normal  0.687917 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0306  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 129 aa  154  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000963543  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  54.55 
 
 		 129 aa  153  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  54.55 
 
 		 129 aa  153  6e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  54.55 
 
 		 129 aa  153  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2301  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 129 aa  154  6e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.598814  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0074  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 135 aa  153  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.475977  hitchhiker  0.00000000906112 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0342  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 129 aa  153  7e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00110784  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001719  SSU ribosomal protein S11p (S14e)  58.68 
 
 		 129 aa  153  8e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000259501  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 131 aa  153  8e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00752  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 129 aa  153  8e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>