More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0373 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0373  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 127 aa  258  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05840  30S ribosomal protein S11  88.6 
 
 		 137 aa  214  2.9999999999999998e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0407415  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1913  30S ribosomal protein S11  80 
 
 		 128 aa  201  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1171  30S ribosomal protein S11  87.72 
 
 		 133 aa  199  9.999999999999999e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0627  30S ribosomal protein S11  67.46 
 
 		 129 aa  189  9e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3138  30S ribosomal protein S11  70.94 
 
 		 135 aa  189  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0205896  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5762  30S ribosomal protein S11  71.79 
 
 		 131 aa  186  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0172  30S ribosomal protein S11  70.16 
 
 		 130 aa  183  7e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.183798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1640  ribosomal protein S11  70.97 
 
 		 133 aa  174  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.218651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  67.26 
 
 		 131 aa  169  9e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  61.9 
 
 		 129 aa  164  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  61.9 
 
 		 129 aa  163  9e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  61.9 
 
 		 129 aa  163  9e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 129 aa  161  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 129 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4368  30S ribosomal protein S11  68.8 
 
 		 131 aa  160  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.276482  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  57.36 
 
 		 129 aa  160  6e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2271  30S ribosomal protein S11  53.54 
 
 		 127 aa  160  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0715573  hitchhiker  0.00306589 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2204  30S ribosomal protein S11  53.54 
 
 		 127 aa  159  8.000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000733078  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  60.16 
 
 		 128 aa  159  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  63.96 
 
 		 131 aa  159  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  61.95 
 
 		 130 aa  159  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2039  30S ribosomal protein S11  52.76 
 
 		 127 aa  158  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000528036  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  58.14 
 
 		 129 aa  157  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 129 aa  156  8e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  56.8 
 
 		 131 aa  156  9e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  62.16 
 
 		 131 aa  155  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2302  30S ribosomal protein S11  55.91 
 
 		 127 aa  156  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.12621  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1549  ribosomal protein S11  60.63 
 
 		 131 aa  156  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  61.26 
 
 		 131 aa  155  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0438  ribosomal protein S11  60.18 
 
 		 183 aa  155  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00108118  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0624  30S ribosomal protein S11  54.26 
 
 		 129 aa  154  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000665656  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  58.56 
 
 		 137 aa  154  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2151  30S ribosomal protein S11  52.71 
 
 		 129 aa  153  8e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000057735  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001719  SSU ribosomal protein S11p (S14e)  52.71 
 
 		 129 aa  153  8e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000259501  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00752  30S ribosomal protein S11  52.71 
 
 		 129 aa  153  8e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  58.41 
 
 		 129 aa  153  9e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0082  30S ribosomal protein S11  54.26 
 
 		 129 aa  153  9e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000625128  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 129 aa  153  9e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  57.85 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  57.85 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  60.18 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  57.85 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  60.18 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 129 aa  151  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3783  30S ribosomal protein S11  53.49 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0247375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3685  30S ribosomal protein S11  53.49 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00109954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3720  30S ribosomal protein S11  53.49 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0247296  normal  0.144698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  57.02 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3613  30S ribosomal protein S11  53.49 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00134375  normal  0.497735 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  57.02 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3612  30S ribosomal protein S11  53.49 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000648166  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3892  30S ribosomal protein S11  53.49 
 
 		 129 aa  151  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000147745  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3977  30S ribosomal protein S11  53.49 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300038  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0604  30S ribosomal protein S11  53.49 
 
 		 129 aa  151  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650942  normal  0.687917 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3728  30S ribosomal protein S11  52.71 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00156058  hitchhiker  0.00442603 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 130 aa  151  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0306  30S ribosomal protein S11  53.49 
 
 		 129 aa  151  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000963543  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0428  30S ribosomal protein S11  53.49 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.684596  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3799  30S ribosomal protein S11  53.49 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0744309  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03148  30S ribosomal protein S11  53.49 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.175069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0416  ribosomal protein S11  53.49 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000707305  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4521  30S ribosomal protein S11  52.71 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000039204  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4619  30S ribosomal protein S11  53.49 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  57.02 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3683  30S ribosomal protein S11  53.49 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000095493  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0416  30S ribosomal protein S11  53.49 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00339967  unclonable  0.0000000142813 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0131  30S ribosomal protein S11  61.24 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000108519  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3592  30S ribosomal protein S11  53.49 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00516698  normal  0.0514386 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0342  30S ribosomal protein S11  52.71 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00110784  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3491  30S ribosomal protein S11  53.49 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000857326  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3780  30S ribosomal protein S11  53.49 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000705759  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03099  hypothetical protein  53.49 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.130382  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  55.86 
 
 		 133 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  55.86 
 
 		 133 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  55.86 
 
 		 133 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  55.86 
 
 		 133 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  55.86 
 
 		 133 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0205  30S ribosomal protein S11  56.76 
 
 		 127 aa  150  5.9999999999999996e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000759645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  55.86 
 
 		 133 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  55.86 
 
 		 133 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2735  30S ribosomal protein S11  55.86 
 
 		 133 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  55.86 
 
 		 133 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  55.86 
 
 		 133 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  55.86 
 
 		 133 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  55.86 
 
 		 133 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  55.86 
 
 		 133 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  55.86 
 
 		 133 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  55.86 
 
 		 133 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2301  30S ribosomal protein S11  51.94 
 
 		 129 aa  150  7e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.598814  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  55.86 
 
 		 134 aa  150  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  55.86 
 
 		 134 aa  150  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0506  30S ribosomal protein S11  53.49 
 
 		 129 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  55.86 
 
 		 134 aa  150  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1826  30S ribosomal protein S11  55.86 
 
 		 127 aa  149  8.999999999999999e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0778  30S ribosomal protein S11  54.78 
 
 		 129 aa  149  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0579728 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  57.85 
 
 		 129 aa  149  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>