More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4368 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4368  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 131 aa  266  5.9999999999999995e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.276482  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5762  30S ribosomal protein S11  90.84 
 
 		 131 aa  226  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3138  30S ribosomal protein S11  84.75 
 
 		 135 aa  215  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0205896  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0627  30S ribosomal protein S11  74.8 
 
 		 129 aa  207  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0172  30S ribosomal protein S11  72.8 
 
 		 130 aa  196  7.999999999999999e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.183798 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0373  30S ribosomal protein S11  68.8 
 
 		 127 aa  190  7e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1913  30S ribosomal protein S11  75.65 
 
 		 128 aa  189  1e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05840  30S ribosomal protein S11  73.68 
 
 		 137 aa  182  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0407415  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2039  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 127 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000528036  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2271  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 127 aa  181  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0715573  hitchhiker  0.00306589 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1640  ribosomal protein S11  70.77 
 
 		 133 aa  181  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.218651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2204  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 127 aa  181  4.0000000000000006e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000733078  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1826  30S ribosomal protein S11  69.03 
 
 		 127 aa  176  8e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0205  30S ribosomal protein S11  68.14 
 
 		 127 aa  174  3e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000759645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1171  30S ribosomal protein S11  74.56 
 
 		 133 aa  174  3e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0314  30S ribosomal protein S11  67.26 
 
 		 127 aa  173  6e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000333021  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2398  30S ribosomal protein S11  67.26 
 
 		 127 aa  171  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000513173  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  64.29 
 
 		 131 aa  161  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  56.59 
 
 		 129 aa  159  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  56.59 
 
 		 129 aa  158  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  56.59 
 
 		 129 aa  158  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  61.06 
 
 		 137 aa  157  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  63.06 
 
 		 129 aa  157  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  63.72 
 
 		 131 aa  157  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  54.96 
 
 		 129 aa  156  9e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  63.72 
 
 		 131 aa  155  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  57.25 
 
 		 129 aa  155  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  56.49 
 
 		 129 aa  155  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  57.25 
 
 		 129 aa  155  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1549  ribosomal protein S11  56.49 
 
 		 131 aa  155  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  55.73 
 
 		 129 aa  154  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  55.73 
 
 		 129 aa  154  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1112  30S ribosomal protein S11  57.6 
 
 		 130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169024  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0591  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 136 aa  153  7e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.648378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  56.49 
 
 		 129 aa  153  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4001  30S ribosomal protein S11  59.52 
 
 		 138 aa  153  9e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000341479  hitchhiker  0.000619325 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  60.36 
 
 		 128 aa  152  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0979  30S ribosomal protein S11  54.26 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0952453  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  56.49 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  61.06 
 
 		 131 aa  152  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0438  ribosomal protein S11  58.56 
 
 		 183 aa  152  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00108118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0131  30S ribosomal protein S11  57.03 
 
 		 129 aa  151  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000108519  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2041  30S ribosomal protein S11  61.07 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00199904  hitchhiker  0.00122216 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1160  30S ribosomal protein S11  59.52 
 
 		 139 aa  152  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271221  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1860  30S ribosomal protein S11  56.9 
 
 		 136 aa  151  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1116  ribosomal protein S11  65.77 
 
 		 134 aa  150  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625499  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  60.36 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  52.67 
 
 		 131 aa  150  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04250  SSU ribosomal protein S11P  62.99 
 
 		 135 aa  150  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.333159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0608  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 134 aa  150  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0624  30S ribosomal protein S11  56.1 
 
 		 129 aa  150  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000665656  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1012  30S ribosomal protein S11  59.46 
 
 		 130 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00012191  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0276  30S ribosomal protein S11  60.47 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0714  30S ribosomal protein S11  60.31 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000403198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2302  30S ribosomal protein S11  56 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.12621  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2685  30S ribosomal protein S11  66.07 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000312441  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6024  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0867  ribosomal protein S11  61.42 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.322465  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0498  ribosomal protein S11  58.56 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.423848  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4292  ribosomal protein S11  65.77 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2995  30S ribosomal protein S11  53.08 
 
 		 133 aa  148  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4288  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 135 aa  148  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000331944 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2926  30S ribosomal protein S11  53.08 
 
 		 133 aa  148  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  51.54 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  51.54 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  51.54 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3273  30S ribosomal protein S11  53.08 
 
 		 133 aa  148  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  51.54 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  51.54 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0477  30S ribosomal protein S11  59.84 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000422996  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  51.54 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1629  30S ribosomal protein S11  61.83 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  51.54 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  61.26 
 
 		 129 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16561  30S ribosomal protein S11  65.49 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.750995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2735  30S ribosomal protein S11  51.54 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  51.54 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  51.54 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  51.54 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  51.54 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  51.54 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  51.54 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  51.54 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2210  30S ribosomal protein S11  60.31 
 
 		 130 aa  147  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  60.36 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  60.36 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3897  30S ribosomal protein S11  65.77 
 
 		 135 aa  148  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  56.76 
 
 		 134 aa  147  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  56.76 
 
 		 134 aa  147  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0207  30S ribosomal protein S11  57.02 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000194302  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0612  ribosomal protein S11  60.31 
 
 		 135 aa  148  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  56.76 
 
 		 134 aa  147  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0236  30S ribosomal protein S11  59.46 
 
 		 130 aa  147  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000127993  unclonable  0.00000919144 
 
 
-
 
NC_002936  DET0500  30S ribosomal protein S11  59.84 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000251151  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3671  30S ribosomal protein S11  60.8 
 
 		 135 aa  147  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4667  30S ribosomal protein S11  57.02 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000031185  unclonable  0.00000000812252 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1732  30S ribosomal protein S11  60.47 
 
 		 132 aa  147  4e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_442  ribosomal protein S11  59.84 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000234354  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3161  30S ribosomal protein S11  61.26 
 
 		 129 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.560785  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  60.36 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>