More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0500 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0500  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 130 aa  260  3e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000251151  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_442  ribosomal protein S11  100 
 
 		 130 aa  260  3e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000234354  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0477  30S ribosomal protein S11  98.46 
 
 		 130 aa  258  2e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000422996  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1160  30S ribosomal protein S11  72.87 
 
 		 139 aa  181  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271221  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4001  30S ribosomal protein S11  72.22 
 
 		 138 aa  180  6e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000341479  hitchhiker  0.000619325 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  66.14 
 
 		 129 aa  180  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  68.6 
 
 		 129 aa  180  6e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  71.93 
 
 		 131 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  67.2 
 
 		 131 aa  177  4.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  70.69 
 
 		 137 aa  176  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 129 aa  176  8e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 128 aa  176  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 129 aa  175  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 129 aa  175  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  70.18 
 
 		 131 aa  174  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  72.07 
 
 		 130 aa  174  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  63.78 
 
 		 129 aa  174  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 129 aa  174  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0308  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 129 aa  174  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 		 131 aa  174  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1498  30S ribosomal protein S11  69.23 
 
 		 128 aa  174  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2999  30S ribosomal protein S11  70.4 
 
 		 137 aa  173  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737948 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0783  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 		 129 aa  173  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  70.18 
 
 		 131 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  62.2 
 
 		 129 aa  171  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  62.2 
 
 		 129 aa  171  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0726  30S ribosomal protein S11  68.25 
 
 		 131 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.873114  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 		 129 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  61.42 
 
 		 131 aa  172  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  62.2 
 
 		 129 aa  171  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1006  30S ribosomal protein S11  65.65 
 
 		 131 aa  171  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109839  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0251  ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 128 aa  171  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118892  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 129 aa  170  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 		 129 aa  170  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1580  30S ribosomal protein S11  66.92 
 
 		 130 aa  170  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0220248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 		 130 aa  169  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 		 129 aa  169  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0291  30S ribosomal protein S11  64.06 
 
 		 130 aa  169  9e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000693018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 		 130 aa  169  9e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0278  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 		 129 aa  169  9e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  0.618273 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 129 aa  169  9e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2989  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 130 aa  169  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2039  30S ribosomal protein S11  59.5 
 
 		 127 aa  169  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000528036  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2930  30S ribosomal protein S11  70 
 
 		 134 aa  169  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000145745  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1434  30S ribosomal protein S11  67.15 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0714  30S ribosomal protein S11  63.49 
 
 		 131 aa  168  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000403198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1315  ribosomal protein S11  64.29 
 
 		 132 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.515443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2685  30S ribosomal protein S11  71.9 
 
 		 138 aa  168  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000312441  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2271  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 127 aa  169  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0715573  hitchhiker  0.00306589 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2582  30S ribosomal protein S11  63.49 
 
 		 131 aa  167  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.16945  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 129 aa  167  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 129 aa  167  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4972  30S ribosomal protein S11  68.22 
 
 		 136 aa  167  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2041  30S ribosomal protein S11  66.14 
 
 		 131 aa  168  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00199904  hitchhiker  0.00122216 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 129 aa  167  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1116  ribosomal protein S11  65.67 
 
 		 134 aa  167  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625499  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0608  30S ribosomal protein S11  70.87 
 
 		 134 aa  167  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  61.6 
 
 		 131 aa  167  5e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 129 aa  167  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1923  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 130 aa  167  7e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194942  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1549  ribosomal protein S11  64.57 
 
 		 131 aa  166  7e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1111  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 138 aa  166  9e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1140  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 138 aa  166  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1128  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 138 aa  166  9e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  66.38 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4292  ribosomal protein S11  67.67 
 
 		 133 aa  166  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3384  30S ribosomal protein S11  65.87 
 
 		 137 aa  165  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2751  ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3161  30S ribosomal protein S11  67.24 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.560785  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13496  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 139 aa  165  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2344e-17  normal  0.330141 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2204  30S ribosomal protein S11  57.85 
 
 		 127 aa  165  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000733078  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3671  30S ribosomal protein S11  65.6 
 
 		 135 aa  164  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0616  30S ribosomal protein S11  60.63 
 
 		 129 aa  164  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  68.25 
 
 		 130 aa  163  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494342  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 133 aa  163  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 133 aa  163  9e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 133 aa  163  9e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 133 aa  163  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 133 aa  163  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 133 aa  163  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 133 aa  163  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 133 aa  163  9e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 133 aa  163  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2735  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 133 aa  163  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 133 aa  163  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 133 aa  163  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 133 aa  163  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 133 aa  163  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 133 aa  163  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  59.84 
 
 		 135 aa  162  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0741  ribosomal protein S11  70.18 
 
 		 134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  64.66 
 
 		 129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>