More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1629 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1629  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 130 aa  262  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17441  30S ribosomal protein S11  99.23 
 
 		 130 aa  261  2e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.809321  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17281  30S ribosomal protein S11  98.46 
 
 		 130 aa  259  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0354  30S ribosomal protein S11  94.62 
 
 		 130 aa  224  4e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.837845 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16561  30S ribosomal protein S11  94.62 
 
 		 130 aa  224  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.750995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1977  30S ribosomal protein S11  90.77 
 
 		 130 aa  218  3e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333335  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17181  30S ribosomal protein S11  96.92 
 
 		 130 aa  211  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.962547  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1107  30S ribosomal protein S11  95.38 
 
 		 130 aa  205  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19821  30S ribosomal protein S11  96.15 
 
 		 130 aa  202  9e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.427205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23251  30S ribosomal protein S11  93.08 
 
 		 130 aa  202  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0714  30S ribosomal protein S11  82.4 
 
 		 131 aa  201  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000403198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2582  30S ribosomal protein S11  81.6 
 
 		 131 aa  199  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.16945  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2210  30S ribosomal protein S11  82.31 
 
 		 130 aa  197  5e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1315  ribosomal protein S11  81.1 
 
 		 132 aa  197  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.515443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3726  30S ribosomal protein S11  83.48 
 
 		 130 aa  187  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  68.33 
 
 		 128 aa  183  7e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  69.57 
 
 		 131 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0229  30S ribosomal protein S11  84.35 
 
 		 130 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0226  30S ribosomal protein S11  84.35 
 
 		 130 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000119719  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2989  30S ribosomal protein S11  81.74 
 
 		 131 aa  182  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.542716  normal  0.258691 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  69.57 
 
 		 131 aa  181  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  66.15 
 
 		 130 aa  178  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  68.1 
 
 		 137 aa  177  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  61.83 
 
 		 131 aa  177  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1160  30S ribosomal protein S11  68.22 
 
 		 139 aa  177  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271221  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 129 aa  177  4.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  66.96 
 
 		 131 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 129 aa  177  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 129 aa  177  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4001  30S ribosomal protein S11  67.72 
 
 		 138 aa  173  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000341479  hitchhiker  0.000619325 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  63.33 
 
 		 131 aa  173  8e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  65.38 
 
 		 130 aa  170  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494342  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  63.33 
 
 		 129 aa  170  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  62.5 
 
 		 129 aa  169  9e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2999  30S ribosomal protein S11  67.2 
 
 		 137 aa  169  9e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737948 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1580  30S ribosomal protein S11  69.17 
 
 		 130 aa  169  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0220248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  63.33 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1116  ribosomal protein S11  71.67 
 
 		 134 aa  168  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625499  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  63.33 
 
 		 129 aa  167  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  66.38 
 
 		 129 aa  168  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1006  30S ribosomal protein S11  66.41 
 
 		 131 aa  168  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109839  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  63.33 
 
 		 129 aa  167  5e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  64.41 
 
 		 131 aa  167  5e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  63.33 
 
 		 129 aa  167  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  63.33 
 
 		 129 aa  167  5e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  60.63 
 
 		 129 aa  167  6e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2271  30S ribosomal protein S11  58.46 
 
 		 127 aa  166  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0715573  hitchhiker  0.00306589 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  62.5 
 
 		 129 aa  166  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  62.5 
 
 		 129 aa  166  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  62.5 
 
 		 129 aa  166  8e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0608  30S ribosomal protein S11  71.67 
 
 		 134 aa  166  8e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2039  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 127 aa  166  8e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000528036  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2751  ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 129 aa  166  9e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2204  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 127 aa  166  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000733078  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  60.16 
 
 		 131 aa  166  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0251  ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 128 aa  166  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118892  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  61.67 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1719  30S ribosomal protein S11  65.38 
 
 		 130 aa  165  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000100084  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0591  30S ribosomal protein S11  73.91 
 
 		 136 aa  165  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.648378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  64.66 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  64.66 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1112  30S ribosomal protein S11  62.1 
 
 		 130 aa  165  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169024  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  59.17 
 
 		 132 aa  164  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3671  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 135 aa  164  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1549  ribosomal protein S11  62.31 
 
 		 131 aa  164  5e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  58.33 
 
 		 129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1012  30S ribosomal protein S11  58.46 
 
 		 130 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00012191  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2398  30S ribosomal protein S11  62.83 
 
 		 127 aa  163  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000513173  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3273  30S ribosomal protein S11  55.81 
 
 		 133 aa  163  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2926  30S ribosomal protein S11  55.81 
 
 		 133 aa  163  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1826  30S ribosomal protein S11  61.95 
 
 		 127 aa  163  6.9999999999999995e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0958  30S ribosomal protein S11  67.83 
 
 		 131 aa  163  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  59.17 
 
 		 133 aa  163  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0131  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 129 aa  163  6.9999999999999995e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000108519  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2989  30S ribosomal protein S11  61.67 
 
 		 130 aa  163  6.9999999999999995e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  61.67 
 
 		 129 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3303  30S ribosomal protein S11  67.83 
 
 		 131 aa  163  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  61.67 
 
 		 129 aa  163  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3384  30S ribosomal protein S11  68.33 
 
 		 137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0291  30S ribosomal protein S11  59.02 
 
 		 130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000693018  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2685  30S ribosomal protein S11  70.83 
 
 		 138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000312441  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0481  30S ribosomal protein S11  56.92 
 
 		 130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2995  30S ribosomal protein S11  55.04 
 
 		 133 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0205  30S ribosomal protein S11  61.06 
 
 		 127 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000759645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4972  30S ribosomal protein S11  67.5 
 
 		 136 aa  161  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1434  30S ribosomal protein S11  67.5 
 
 		 137 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0438  ribosomal protein S11  60.5 
 
 		 183 aa  161  3e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00108118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1458  30S ribosomal protein S11  64.84 
 
 		 129 aa  161  3e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000430937  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0314  30S ribosomal protein S11  61.06 
 
 		 127 aa  161  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000333021  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0726  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 131 aa  161  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.873114  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6024  30S ribosomal protein S11  73.04 
 
 		 134 aa  161  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3981  30S ribosomal protein S11  64.06 
 
 		 129 aa  161  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0315  30S ribosomal protein S11  69.47 
 
 		 129 aa  161  3e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.50356e-25 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  58.33 
 
 		 133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  58.33 
 
 		 133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  58.33 
 
 		 133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  58.33 
 
 		 133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  58.33 
 
 		 133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  58.33 
 
 		 133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  58.33 
 
 		 133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>