More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1977 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1977  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 130 aa  261  3e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333335  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0354  30S ribosomal protein S11  96.15 
 
 		 130 aa  230  5e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.837845 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16561  30S ribosomal protein S11  91.54 
 
 		 130 aa  219  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.750995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1629  30S ribosomal protein S11  90.77 
 
 		 130 aa  219  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17441  30S ribosomal protein S11  90 
 
 		 130 aa  218  3e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.809321  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17281  30S ribosomal protein S11  89.23 
 
 		 130 aa  215  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23251  30S ribosomal protein S11  94.62 
 
 		 130 aa  207  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2210  30S ribosomal protein S11  83.85 
 
 		 130 aa  204  4e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1107  30S ribosomal protein S11  92.31 
 
 		 130 aa  202  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17181  30S ribosomal protein S11  93.91 
 
 		 130 aa  200  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.962547  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19821  30S ribosomal protein S11  91.54 
 
 		 130 aa  200  7e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.427205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1315  ribosomal protein S11  81.89 
 
 		 132 aa  199  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.515443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0714  30S ribosomal protein S11  80 
 
 		 131 aa  196  6e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000403198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2582  30S ribosomal protein S11  79.2 
 
 		 131 aa  195  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.16945  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3726  30S ribosomal protein S11  80 
 
 		 130 aa  190  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  70.43 
 
 		 131 aa  184  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0226  30S ribosomal protein S11  79.23 
 
 		 130 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000119719  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  69.57 
 
 		 131 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0229  30S ribosomal protein S11  79.23 
 
 		 130 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2989  30S ribosomal protein S11  80.87 
 
 		 131 aa  182  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.542716  normal  0.258691 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  64.89 
 
 		 131 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  65.83 
 
 		 128 aa  180  5.0000000000000004e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  67.83 
 
 		 131 aa  179  8.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  69.57 
 
 		 130 aa  179  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 129 aa  177  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 129 aa  177  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 129 aa  177  4e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  67.24 
 
 		 137 aa  176  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1160  30S ribosomal protein S11  68.22 
 
 		 139 aa  176  8e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271221  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1006  30S ribosomal protein S11  67.94 
 
 		 131 aa  173  7e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109839  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4001  30S ribosomal protein S11  67.72 
 
 		 138 aa  173  8e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000341479  hitchhiker  0.000619325 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  66.15 
 
 		 130 aa  171  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494342  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  64.17 
 
 		 129 aa  171  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  63.36 
 
 		 131 aa  170  5.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2999  30S ribosomal protein S11  67.2 
 
 		 137 aa  170  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737948 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  61.67 
 
 		 131 aa  169  9e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  68.1 
 
 		 129 aa  169  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1580  30S ribosomal protein S11  65.38 
 
 		 130 aa  169  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0220248  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  63.08 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2989  30S ribosomal protein S11  63.08 
 
 		 130 aa  169  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  63.08 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  62.5 
 
 		 129 aa  169  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  63.08 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  61.54 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1116  ribosomal protein S11  64.93 
 
 		 134 aa  167  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625499  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  64.17 
 
 		 129 aa  167  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  61.54 
 
 		 129 aa  167  4e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0251  ribosomal protein S11  68.33 
 
 		 128 aa  167  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118892  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3671  30S ribosomal protein S11  64.44 
 
 		 135 aa  167  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  66.38 
 
 		 129 aa  167  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  66.38 
 
 		 129 aa  167  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  61.67 
 
 		 129 aa  166  7e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  59.23 
 
 		 129 aa  166  9e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3303  30S ribosomal protein S11  68.7 
 
 		 131 aa  166  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  62.5 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0591  30S ribosomal protein S11  73.04 
 
 		 136 aa  166  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.648378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0726  30S ribosomal protein S11  64.12 
 
 		 131 aa  166  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.873114  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4972  30S ribosomal protein S11  66.17 
 
 		 136 aa  166  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0608  30S ribosomal protein S11  70 
 
 		 134 aa  166  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  60.77 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0958  30S ribosomal protein S11  68.7 
 
 		 131 aa  166  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0481  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 130 aa  166  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1434  30S ribosomal protein S11  64.23 
 
 		 137 aa  166  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  63.33 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2751  ribosomal protein S11  65.83 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1923  30S ribosomal protein S11  59.23 
 
 		 130 aa  164  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194942  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  58.78 
 
 		 131 aa  164  5e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3384  30S ribosomal protein S11  68.33 
 
 		 137 aa  164  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1719  30S ribosomal protein S11  64.62 
 
 		 130 aa  163  5.9999999999999996e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000100084  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1012  30S ribosomal protein S11  59.23 
 
 		 130 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00012191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0131  30S ribosomal protein S11  67.5 
 
 		 129 aa  163  6.9999999999999995e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000108519  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2685  30S ribosomal protein S11  70.83 
 
 		 138 aa  163  8e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000312441  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00961  30S ribosomal protein S11  59.23 
 
 		 130 aa  163  9e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000322377  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  61.67 
 
 		 129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0137  30S ribosomal protein S11  69.17 
 
 		 129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000197157  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1458  30S ribosomal protein S11  66.14 
 
 		 129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000430937  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1140  30S ribosomal protein S11  68.33 
 
 		 138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1111  30S ribosomal protein S11  68.33 
 
 		 138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  61.67 
 
 		 129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1128  30S ribosomal protein S11  68.33 
 
 		 138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469294  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl149  30S ribosomal protein S11  55.81 
 
 		 130 aa  161  2.0000000000000002e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000575404  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  58.46 
 
 		 130 aa  161  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6024  30S ribosomal protein S11  71.3 
 
 		 134 aa  161  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  57.69 
 
 		 130 aa  161  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  59.23 
 
 		 129 aa  161  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0315  30S ribosomal protein S11  68.75 
 
 		 129 aa  161  3e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.50356e-25 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2271  30S ribosomal protein S11  55.38 
 
 		 127 aa  160  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0715573  hitchhiker  0.00306589 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2926  30S ribosomal protein S11  55.04 
 
 		 133 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3273  30S ribosomal protein S11  55.04 
 
 		 133 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0424  ribosomal protein S11  63.79 
 
 		 132 aa  160  4.0000000000000004e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  59.23 
 
 		 129 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0308  30S ribosomal protein S11  60.8 
 
 		 129 aa  160  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4481  30S ribosomal protein S11  68.33 
 
 		 135 aa  160  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.401787  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1549  ribosomal protein S11  60.31 
 
 		 131 aa  160  5.0000000000000005e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3877  30S ribosomal protein S11  68.33 
 
 		 135 aa  160  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0291  30S ribosomal protein S11  58.02 
 
 		 130 aa  160  6e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000693018  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 129 aa  160  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  57.5 
 
 		 132 aa  160  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4292  ribosomal protein S11  70 
 
 		 133 aa  160  7e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  58.33 
 
 		 133 aa  159  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>