More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0498 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0498  ribosomal protein S11  100 
 
 		 126 aa  254  3e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.423848  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  64.75 
 
 		 131 aa  172  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 129 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 129 aa  169  9e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 129 aa  167  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 129 aa  167  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  59.35 
 
 		 129 aa  167  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 129 aa  167  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0424  ribosomal protein S11  67.24 
 
 		 132 aa  168  3e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  59.35 
 
 		 129 aa  167  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  59.35 
 
 		 129 aa  167  4e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 129 aa  167  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  59.2 
 
 		 133 aa  167  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  59.2 
 
 		 133 aa  167  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  59.2 
 
 		 133 aa  167  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  59.2 
 
 		 133 aa  167  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  59.2 
 
 		 133 aa  167  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  59.2 
 
 		 133 aa  167  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  59.2 
 
 		 133 aa  167  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  59.2 
 
 		 133 aa  167  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  59.2 
 
 		 134 aa  167  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  59.2 
 
 		 134 aa  167  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2735  30S ribosomal protein S11  59.2 
 
 		 133 aa  167  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  59.2 
 
 		 133 aa  167  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  59.2 
 
 		 134 aa  167  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  59.2 
 
 		 133 aa  167  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  59.2 
 
 		 133 aa  167  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  59.2 
 
 		 133 aa  167  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  59.2 
 
 		 133 aa  167  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  59.2 
 
 		 133 aa  167  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 129 aa  166  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2995  30S ribosomal protein S11  60.8 
 
 		 133 aa  166  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3273  30S ribosomal protein S11  60.8 
 
 		 133 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0351  30S ribosomal protein S11  62.79 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  66.96 
 
 		 131 aa  165  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0082  30S ribosomal protein S11  62.79 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000625128  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2926  30S ribosomal protein S11  60.8 
 
 		 133 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0604  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 129 aa  164  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650942  normal  0.687917 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0428  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 129 aa  164  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.684596  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3728  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 129 aa  164  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00156058  hitchhiker  0.00442603 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0428  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 130 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.316417  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  65.22 
 
 		 130 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3799  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 129 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0744309  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  63.79 
 
 		 129 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0306  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 129 aa  164  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000963543  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3892  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 129 aa  164  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000147745  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3977  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 129 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300038  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 129 aa  164  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  58.14 
 
 		 129 aa  164  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 131 aa  164  4e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2151  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 129 aa  164  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000057735  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001719  SSU ribosomal protein S11p (S14e)  62.81 
 
 		 129 aa  164  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000259501  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00752  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 129 aa  164  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03148  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.175069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0416  ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000707305  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0416  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00339967  unclonable  0.0000000142813 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0342  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00110784  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 129 aa  164  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3613  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00134375  normal  0.497735 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3685  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00109954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3612  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000648166  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3683  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000095493  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3783  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0247375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  60.8 
 
 		 133 aa  163  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3592  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00516698  normal  0.0514386 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4619  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3720  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0247296  normal  0.144698 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3780  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000705759  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03099  hypothetical protein  62.81 
 
 		 129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.130382  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3491  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000857326  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 130 aa  163  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  59.2 
 
 		 131 aa  163  6.9999999999999995e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4521  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 129 aa  163  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000039204  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  65.22 
 
 		 131 aa  163  9e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  65.22 
 
 		 131 aa  163  9e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 129 aa  163  9e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 129 aa  163  9e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 129 aa  163  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 129 aa  163  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0317  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.219979  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  59.5 
 
 		 130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  59.5 
 
 		 129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  59.5 
 
 		 135 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  62.93 
 
 		 129 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  61.98 
 
 		 131 aa  162  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  62.93 
 
 		 129 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  63.79 
 
 		 137 aa  161  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 129 aa  161  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2301  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 129 aa  160  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.598814  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0649  ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 129 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4526  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 129 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.828676  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5057  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 129 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000518123  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  57.85 
 
 		 128 aa  160  6e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  59.5 
 
 		 129 aa  160  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  59.5 
 
 		 129 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  57.6 
 
 		 129 aa  159  9e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>