More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0867 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0867  ribosomal protein S11  100 
 
 		 129 aa  266  7e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.322465  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0627  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  187  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2271  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 127 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0715573  hitchhiker  0.00306589 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  65.91 
 
 		 129 aa  180  6e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  65.91 
 
 		 129 aa  180  6e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  65.91 
 
 		 129 aa  180  7e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2039  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 127 aa  177  5.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000528036  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  66.42 
 
 		 131 aa  176  7e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  72.32 
 
 		 131 aa  176  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2204  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 127 aa  176  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000733078  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  71.17 
 
 		 137 aa  175  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0205  30S ribosomal protein S11  67.57 
 
 		 127 aa  173  7e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000759645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  70.54 
 
 		 131 aa  173  9e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  70.54 
 
 		 130 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  71.43 
 
 		 131 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  64.89 
 
 		 128 aa  171  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0314  30S ribosomal protein S11  65.77 
 
 		 127 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000333021  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2398  30S ribosomal protein S11  65.77 
 
 		 127 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000513173  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  61.83 
 
 		 131 aa  171  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1826  30S ribosomal protein S11  65.77 
 
 		 127 aa  171  5e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0373  30S ribosomal protein S11  61.79 
 
 		 127 aa  170  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  64.06 
 
 		 129 aa  169  7.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5762  30S ribosomal protein S11  64.1 
 
 		 131 aa  169  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  64.06 
 
 		 129 aa  169  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1160  30S ribosomal protein S11  70.54 
 
 		 139 aa  169  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271221  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1498  30S ribosomal protein S11  68.99 
 
 		 128 aa  168  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0172  30S ribosomal protein S11  59.69 
 
 		 130 aa  168  2e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.183798 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1112  30S ribosomal protein S11  62.1 
 
 		 130 aa  168  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169024  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0608  30S ribosomal protein S11  70.31 
 
 		 134 aa  167  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1116  ribosomal protein S11  70.87 
 
 		 134 aa  167  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625499  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4001  30S ribosomal protein S11  68.99 
 
 		 138 aa  167  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000341479  hitchhiker  0.000619325 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1549  ribosomal protein S11  64.18 
 
 		 131 aa  166  9e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  60.47 
 
 		 129 aa  166  9e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  64.17 
 
 		 131 aa  166  9e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1913  30S ribosomal protein S11  63.48 
 
 		 128 aa  166  1e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1368  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 130 aa  166  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3138  30S ribosomal protein S11  59.83 
 
 		 135 aa  166  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0205896  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1318  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 130 aa  166  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000513052  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01430  ribosomal protein S11  70.8 
 
 		 132 aa  165  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000902694  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0764  ribosomal protein S11  70.75 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  61.72 
 
 		 129 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  61.72 
 
 		 129 aa  164  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0424  ribosomal protein S11  69.37 
 
 		 132 aa  164  4e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4292  ribosomal protein S11  69.53 
 
 		 133 aa  164  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0591  30S ribosomal protein S11  75 
 
 		 136 aa  164  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.648378  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  60.47 
 
 		 129 aa  163  9e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0291  30S ribosomal protein S11  60.77 
 
 		 130 aa  163  9e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000693018  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  60.47 
 
 		 129 aa  163  9e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1882  30S ribosomal protein S11  69.23 
 
 		 127 aa  163  9e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  60.47 
 
 		 129 aa  163  9e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0979  30S ribosomal protein S11  58.59 
 
 		 129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0952453  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13496  30S ribosomal protein S11  70.08 
 
 		 139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2344e-17  normal  0.330141 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  66.96 
 
 		 129 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3877  30S ribosomal protein S11  67.19 
 
 		 135 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0624  30S ribosomal protein S11  58.91 
 
 		 129 aa  161  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000665656  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  58.91 
 
 		 129 aa  162  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  59.69 
 
 		 129 aa  162  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  60.16 
 
 		 129 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0616  30S ribosomal protein S11  61.36 
 
 		 129 aa  161  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1012  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 130 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00012191  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  62.12 
 
 		 129 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2989  30S ribosomal protein S11  60.94 
 
 		 130 aa  161  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4972  30S ribosomal protein S11  68.5 
 
 		 136 aa  161  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0332  30S ribosomal protein S11  70.31 
 
 		 135 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.147865  hitchhiker  0.000897065 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1434  30S ribosomal protein S11  68.5 
 
 		 137 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1111  30S ribosomal protein S11  68.5 
 
 		 138 aa  161  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1140  30S ribosomal protein S11  68.5 
 
 		 138 aa  161  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  67.69 
 
 		 130 aa  161  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494342  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6024  30S ribosomal protein S11  73.21 
 
 		 134 aa  161  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1128  30S ribosomal protein S11  68.5 
 
 		 138 aa  161  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5151  30S ribosomal protein S11  69.53 
 
 		 134 aa  160  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.589824 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3886  30S ribosomal protein S11  59.69 
 
 		 129 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3419  30S ribosomal protein S11  58.59 
 
 		 133 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.119474 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0308  30S ribosomal protein S11  61.72 
 
 		 129 aa  160  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0278  30S ribosomal protein S11  59.69 
 
 		 129 aa  160  5.0000000000000005e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  0.618273 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1580  30S ribosomal protein S11  62.41 
 
 		 130 aa  160  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0220248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  58.91 
 
 		 129 aa  160  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  60.61 
 
 		 129 aa  160  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0137  30S ribosomal protein S11  65.89 
 
 		 129 aa  160  6e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000197157  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2301  30S ribosomal protein S11  58.14 
 
 		 129 aa  160  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.598814  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0481  30S ribosomal protein S11  59.38 
 
 		 130 aa  160  6e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  60.83 
 
 		 129 aa  160  6e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0741  ribosomal protein S11  71.17 
 
 		 134 aa  160  7e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00961  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 130 aa  160  7e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000322377  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0438  ribosomal protein S11  63.87 
 
 		 183 aa  160  7e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00108118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  65.18 
 
 		 129 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  65.18 
 
 		 129 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3384  30S ribosomal protein S11  68.55 
 
 		 137 aa  160  8.000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0714  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 131 aa  159  9e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000403198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0241  30S ribosomal protein S11  70 
 
 		 129 aa  159  9e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0251  ribosomal protein S11  64.34 
 
 		 128 aa  159  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118892  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0083  30S ribosomal protein S11  70 
 
 		 127 aa  159  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000400569  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0131  30S ribosomal protein S11  64.34 
 
 		 129 aa  159  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000108519  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  60.47 
 
 		 129 aa  159  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0612  ribosomal protein S11  68.75 
 
 		 135 aa  159  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  57.81 
 
 		 133 aa  159  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2999  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 137 aa  159  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737948 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  61.07 
 
 		 130 aa  158  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  60.94 
 
 		 130 aa  158  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  63.39 
 
 		 131 aa  158  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>