More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0870 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0870  aminotransferase, class V  100 
 
 		 338 aa  686    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05900  serine-pyruvate aminotransferase  44.28 
 
 		 355 aa  315  9.999999999999999e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000730264 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0969  aminotransferase class V  35.58 
 
 		 374 aa  186  5e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.716227  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  30.84 
 
 		 384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  31.56 
 
 		 384 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  29.64 
 
 		 391 aa  169  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  33.63 
 
 		 385 aa  169  6e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  31.64 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  33.44 
 
 		 379 aa  167  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  32.01 
 
 		 389 aa  166  5e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  31.52 
 
 		 360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  31.63 
 
 		 382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  31.63 
 
 		 382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  33.71 
 
 		 379 aa  162  8.000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  30.94 
 
 		 386 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  32.33 
 
 		 360 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1715  aminotransferase class V  28.4 
 
 		 389 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  29.52 
 
 		 388 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  32.63 
 
 		 381 aa  157  3e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  28.49 
 
 		 383 aa  156  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  30.79 
 
 		 383 aa  155  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  31.63 
 
 		 363 aa  155  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  30.89 
 
 		 386 aa  155  8e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  30.18 
 
 		 380 aa  154  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  32 
 
 		 380 aa  155  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  29.86 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  30.75 
 
 		 379 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  30.84 
 
 		 379 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  28.7 
 
 		 362 aa  150  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  28.99 
 
 		 362 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  29.19 
 
 		 382 aa  149  5e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  30.95 
 
 		 379 aa  149  7e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  30.09 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  30.27 
 
 		 395 aa  147  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  28.78 
 
 		 400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  29.57 
 
 		 384 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  29.73 
 
 		 385 aa  144  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  27.43 
 
 		 380 aa  145  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  30.84 
 
 		 383 aa  144  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0804  aminotransferase class V  29.32 
 
 		 394 aa  143  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  31.66 
 
 		 382 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  28.57 
 
 		 383 aa  143  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0114  L-aspartate aminotransferase / phosphoserine aminotransferase  28.34 
 
 		 395 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  30.06 
 
 		 384 aa  139  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  27.87 
 
 		 384 aa  139  7e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0909  aminotransferase class V  30.5 
 
 		 377 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.520093  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  27.24 
 
 		 391 aa  137  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  30.15 
 
 		 387 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  28.78 
 
 		 381 aa  137  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  29.52 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1315  aminotransferase, class V  25.73 
 
 		 356 aa  137  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.754091  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1287  aminotransferase, class V  28.9 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17916  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  27.19 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  29.38 
 
 		 387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  30.12 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  28.99 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  28.79 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  27.83 
 
 		 382 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  27.91 
 
 		 382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  30.79 
 
 		 360 aa  129  5.0000000000000004e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  27.72 
 
 		 382 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1887  Serine--pyruvate transaminase  30.5 
 
 		 373 aa  129  8.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2772  aminotransferase  27.78 
 
 		 358 aa  129  9.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.22169e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  27.62 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  27.69 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0063  aminotransferase, class V  29.68 
 
 		 358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  27.69 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1817  putative aminotransferase  29.33 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.372186  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  27.37 
 
 		 382 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  27.37 
 
 		 382 aa  126  5e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  25.55 
 
 		 396 aa  126  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3820  2-aminoethylphosphonate aminotransferase  27.3 
 
 		 363 aa  126  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154189  normal  0.305313 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0174  aminotransferase class V  34.74 
 
 		 360 aa  125  8.000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  29.11 
 
 		 358 aa  125  9e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  26.61 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  25.81 
 
 		 397 aa  124  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  29.39 
 
 		 394 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  25.96 
 
 		 380 aa  124  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  27.41 
 
 		 357 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  27.22 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0736  aminotransferase class V  27.74 
 
 		 356 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  25.3 
 
 		 385 aa  123  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  30.12 
 
 		 399 aa  123  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09401  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  29.17 
 
 		 394 aa  122  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  29.43 
 
 		 400 aa  122  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  26.26 
 
 		 398 aa  122  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1762  aminotransferase class V  26.71 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.0159311 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  26.13 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2233  putative aminotransferase class-V  26.11 
 
 		 355 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1674  aminotransferase, class V  28.31 
 
 		 372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00211461  normal  0.187219 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  28.87 
 
 		 394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3345  Alanine--glyoxylate transaminase  25.77 
 
 		 355 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000754514  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  27.84 
 
 		 375 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1813  aminotransferase class V  30.39 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.300679  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  30.39 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3533  aminotransferase, class V  26.75 
 
 		 354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4473  2-aminoethylphosphonate aminotransferase  26.75 
 
 		 354 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220366  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0751  aminotransferase class V  27.13 
 
 		 356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000622725 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  28.87 
 
 		 394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  27.73 
 
 		 421 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>