182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1062 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1062  SEC-C motif domain protein  100 
 
 		 127 aa  261  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1705  SEC-C motif domain protein  57.36 
 
 		 133 aa  148  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0687  hypothetical protein  57.94 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.347573 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2006  SEC-C motif domain protein  59.68 
 
 		 129 aa  138  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3744  hypothetical protein  54.03 
 
 		 132 aa  137  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0143  hypothetical protein  55.47 
 
 		 143 aa  136  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1738  hypothetical protein  57.58 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.563414  hitchhiker  0.00179924 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3050  hypothetical protein  55.22 
 
 		 132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3208  sec-C motif domain-containing protein  58.82 
 
 		 127 aa  133  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.656237  hitchhiker  0.00000000385617 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3857  SecC motif-containing protein  55.2 
 
 		 129 aa  133  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5982  hypothetical protein  53.79 
 
 		 137 aa  133  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101627 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0111  hypothetical protein  56.15 
 
 		 141 aa  132  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.990168 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0877  sec-C motif domain protein  54.26 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0486  hypothetical protein  56.91 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2086  SecC motif-containing protein  51.22 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2695  hypothetical protein  54.62 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0475646  normal  0.183499 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3964  hypothetical protein  58.2 
 
 		 138 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0121  hypothetical protein  56.82 
 
 		 146 aa  130  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2103  SecC motif-containing protein  49.59 
 
 		 128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2149  SecC motif-containing protein  49.59 
 
 		 128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.122113 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2354  SecC motif-containing protein  53.66 
 
 		 125 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360029 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20110  hypothetical protein  53.97 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00226632  normal  0.014073 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0129  hypothetical protein  54.48 
 
 		 146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4001  hypothetical protein  56 
 
 		 138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105567 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4932  hypothetical protein  57.14 
 
 		 125 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.553963  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3946  hypothetical protein  54.24 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2093  hypothetical protein  54.84 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.737091 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1355  hypothetical protein  46.34 
 
 		 126 aa  124  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9021  hypothetical protein  50.85 
 
 		 137 aa  124  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1106  hypothetical protein  49.65 
 
 		 150 aa  124  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12610  hypothetical protein  50.41 
 
 		 139 aa  124  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.770705  normal  0.29477 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4019  SecC motif-containing protein  53.72 
 
 		 124 aa  123  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0222184 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0332  SecC motif-containing protein  53.23 
 
 		 150 aa  122  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756149  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2786  SecC motif-containing protein  50 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0270  hypothetical protein  55.12 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0058  sec-C motif domain protein  54.92 
 
 		 132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0930299  decreased coverage  0.00597084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5815  SecC motif-containing protein  52.46 
 
 		 134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2653  hypothetical protein  55.93 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0466  hypothetical protein  52.24 
 
 		 136 aa  118  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.912558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2860  sec-C motif domain protein  51.28 
 
 		 141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000925444  normal  0.0386163 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3771  hypothetical protein  51.94 
 
 		 143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.223155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4182  hypothetical protein  56.49 
 
 		 139 aa  117  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0950  SecC motif-containing protein  51.24 
 
 		 121 aa  117  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.190346  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0033  hypothetical protein  49.15 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.694209  normal  0.0558215 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2916  sec-C motif domain protein  47.11 
 
 		 135 aa  114  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2165  sec-C motif domain protein  52.54 
 
 		 122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1396  SecC motif-containing protein  56 
 
 		 108 aa  114  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0319965  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4362  hypothetical protein  50 
 
 		 144 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19980  hypothetical protein  48.06 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.130675  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2841  hypothetical protein  53.57 
 
 		 145 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870685  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2978  hypothetical protein  52.86 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6272  hypothetical protein  52.52 
 
 		 145 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1982  SEC-C domain-containing protein  47.24 
 
 		 166 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0376  hypothetical protein  54.1 
 
 		 145 aa  107  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.745389 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1908  hypothetical protein  47.58 
 
 		 159 aa  106  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0591101  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4729  hypothetical protein  47.37 
 
 		 142 aa  107  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0342  hypothetical protein  49.64 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899892  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1581  hypothetical protein  45.6 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0394  hypothetical protein  50.36 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7473  hypothetical protein  45.69 
 
 		 191 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  50.39 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1390  hypothetical protein  42.06 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.334198  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1888  hypothetical protein  42.06 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.188129 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1573  hypothetical protein  42.06 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9407  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01209  hypothetical protein  46.77 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2416  SEC-C motif domain protein  46.77 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000597111  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1945  hypothetical protein  42.06 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1718  hypothetical protein  46.77 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0110448  normal  0.691398 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01219  hypothetical protein  46.77 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.598325  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2394  hypothetical protein  46.77 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143297 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1398  hypothetical protein  46.77 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1341  hypothetical protein  46.77 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00535372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1382  hypothetical protein  46.77 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.159988  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1882  hypothetical protein  42.06 
 
 		 168 aa  103  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.974002  normal  0.355304 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2944  hypothetical protein  51.82 
 
 		 144 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.878767 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0175  hypothetical protein  46.38 
 
 		 148 aa  103  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0494  hypothetical protein  45.8 
 
 		 150 aa  103  8e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0098  hypothetical protein  53.72 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65864  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0577  hypothetical protein  53.72 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2315  hypothetical protein  51.8 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2929  hypothetical protein  51.8 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.620501  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3083  hypothetical protein  53.72 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.457185  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2012  hypothetical protein  53.72 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0415  hypothetical protein  53.72 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2275  hypothetical protein  53.72 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1299  SEC-C domain-containing protein  39.84 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0448026  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2182  hypothetical protein  48.09 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.194641 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2203  hypothetical protein  42.64 
 
 		 155 aa  100  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2228  SEC-C motif domain protein  49.21 
 
 		 165 aa  100  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3796  SEC-C motif domain protein  40.16 
 
 		 163 aa  99.8  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00152057  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0458  hypothetical protein  47.83 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.590063 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2310  hypothetical protein  41.94 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4258  hypothetical protein  47.83 
 
 		 149 aa  98.2  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4297  hypothetical protein  45.93 
 
 		 158 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02530  hypothetical protein  44.06 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.676136  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1155  hypothetical protein  44.27 
 
 		 158 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  0.988255 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1119  hypothetical protein  44.27 
 
 		 160 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1977  hypothetical protein  44.19 
 
 		 155 aa  97.1  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3153  SecC motif-containing protein  38.71 
 
 		 160 aa  96.7  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00487139  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2381  SecC motif-containing protein  40 
 
 		 169 aa  96.7  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.792515  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>