34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0551 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0551  hypothetical protein  100 
 
 		 944 aa  1936    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1217  hypothetical protein  43.49 
 
 		 997 aa  702    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1821  hypothetical protein  33.15 
 
 		 892 aa  371  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.330688  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3548  type II secretion system protein C  31.4 
 
 		 980 aa  369  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1237  hypothetical protein  29.75 
 
 		 885 aa  333  8e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3711  hypothetical protein  28.11 
 
 		 730 aa  147  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120943  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1290  protein of unknown function DUF323  24.19 
 
 		 1160 aa  109  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.286485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2953  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  32.8 
 
 		 1004 aa  95.9  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.5475 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0550  hypothetical protein  24.18 
 
 		 766 aa  85.9  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3713  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  23.34 
 
 		 997 aa  84.7  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.419088 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3821  hypothetical protein  29.86 
 
 		 953 aa  74.7  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00157336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1000  hypothetical protein  28.1 
 
 		 954 aa  72.8  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1624  hypothetical protein  48.48 
 
 		 646 aa  67.4  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1974  hypothetical protein  25.31 
 
 		 885 aa  62.8  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  27.19 
 
 		 446 aa  59.3  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2952  hypothetical protein  44.83 
 
 		 683 aa  53.9  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174565  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.27 
 
 		 446 aa  52.4  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  26.27 
 
 		 446 aa  52.4  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  27.07 
 
 		 450 aa  51.6  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.88 
 
 		 446 aa  51.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  25.3 
 
 		 442 aa  50.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  24.6 
 
 		 442 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  25.74 
 
 		 450 aa  48.9  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  25.3 
 
 		 445 aa  47.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  30.51 
 
 		 1042 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  24.62 
 
 		 446 aa  47.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  25.74 
 
 		 450 aa  47.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  25.64 
 
 		 462 aa  47.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  25.11 
 
 		 450 aa  46.6  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  30.51 
 
 		 1040 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  24.79 
 
 		 444 aa  46.6  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1039  WD40 domain-containing protein  28.41 
 
 		 379 aa  45.8  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2899  TolB domain-containing protein  27.27 
 
 		 469 aa  45.1  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000201302  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  29.66 
 
 		 1042 aa  44.3  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>