More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1631 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1631  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
312 aa  618  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0718199  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.76 
 
 
306 aa  413  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1118  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.84 
 
 
324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.588573  decreased coverage  0.00594817 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1833  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.88 
 
 
299 aa  295  5e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.03 
 
 
312 aa  290  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7777  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.51 
 
 
350 aa  280  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.08 
 
 
352 aa  259  4e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2825  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.64 
 
 
365 aa  255  6e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.151241  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15550  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  45.54 
 
 
396 aa  253  2.0000000000000002e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.409579  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26190  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  45.34 
 
 
325 aa  249  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.16491 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46 
 
 
319 aa  248  8e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1118  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.87 
 
 
354 aa  239  5.999999999999999e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.844451  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.21 
 
 
327 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.345661  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.07 
 
 
319 aa  229  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532842  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.7 
 
 
349 aa  228  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31120  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  45.39 
 
 
323 aa  226  3e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4431  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.93 
 
 
299 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531582  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.94 
 
 
366 aa  220  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.186697 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.04 
 
 
300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.78 
 
 
307 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4003  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.78 
 
 
307 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.78 
 
 
307 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.100329 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0250  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.86 
 
 
307 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.73 
 
 
308 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.717145 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0207  oligopeptide ABC transporter, permease  37.67 
 
 
307 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38 
 
 
307 aa  206  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  43.73 
 
 
304 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2256  oligopeptide ABC transporter, permease component  43.73 
 
 
304 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0243  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.51 
 
 
307 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39 
 
 
293 aa  206  4e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000296229  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0247  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.62 
 
 
306 aa  206  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0546254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0220  oligopeptide ABC transporter permease  39.51 
 
 
307 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0233  oligopeptide ABC transporter permease protein  39.51 
 
 
307 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0211  oligopeptide ABC transporter, permease  39.51 
 
 
307 aa  206  6e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5078  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.15 
 
 
306 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0268  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.15 
 
 
307 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.83 
 
 
307 aa  203  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11308  oligopeptide-transport integral membrane protein ABC transporter oppC  40.86 
 
 
291 aa  202  6e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0874  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.14 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.3 
 
 
319 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.112458  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.03 
 
 
311 aa  199  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.57975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2260  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.91 
 
 
299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0874815  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000093135  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.87 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.765267  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.78 
 
 
280 aa  196  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5301  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  41.02 
 
 
296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.527833  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2030  oligopeptide ABC transporter permease protein  40.59 
 
 
293 aa  196  5.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0128641  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.07 
 
 
280 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.64 
 
 
300 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.14 
 
 
303 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1867  ABC-type transport system protein  39.48 
 
 
288 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0534  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
303 aa  192  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.854176  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  35.96 
 
 
299 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  37.36 
 
 
299 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  37.36 
 
 
299 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  37.36 
 
 
299 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.86 
 
 
300 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  37.36 
 
 
299 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.86 
 
 
300 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.37 
 
 
280 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0407  peptide ABC transporter, permease protein  40.77 
 
 
302 aa  189  4e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404999  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1766  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.21 
 
 
468 aa  189  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0164204  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003659  oligopeptide transport system permease protein OppC  38.13 
 
 
310 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7028  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  38.85 
 
 
308 aa  189  8e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.6 
 
 
274 aa  189  8e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0146821  normal  0.125484 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1253  ABC transporter, permease protein  34.22 
 
 
315 aa  188  1e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000107069 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.09 
 
 
307 aa  188  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.09 
 
 
307 aa  188  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.385135  normal  0.0216142 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
305 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238767  normal  0.85069 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6953  oligopeptide ABC transporter (permease protein)  42.81 
 
 
310 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.85 
 
 
285 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
285 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0350  peptide ABC transporter, permease protein  40.42 
 
 
302 aa  187  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.11 
 
 
313 aa  186  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0216916  hitchhiker  0.00872775 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
299 aa  186  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.42 
 
 
323 aa  186  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.478272  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0590  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.32 
 
 
302 aa  186  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.2 
 
 
347 aa  186  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000434539  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0003  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.79 
 
 
313 aa  185  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.158402  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.11 
 
 
284 aa  185  8e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.75 
 
 
299 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499686  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.03 
 
 
300 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2964  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.28 
 
 
361 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.98 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3674  oligopeptide ABC transporter, permease  38.01 
 
 
279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.673312 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.54 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.03 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  40.37 
 
 
282 aa  183  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
292 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2587  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.66 
 
 
341 aa  183  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.969826  hitchhiker  0.0068543 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0117  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  41.58 
 
 
300 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.697818  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.07 
 
 
300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2260  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.52 
 
 
295 aa  181  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00197888  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5914  ABC transporter, permease protein  38.72 
 
 
331 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal  0.0354831 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4338  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
300 aa  181  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.244803  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0617  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 
326 aa  180  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.370514  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 
348 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0562507  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 
376 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0755  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, inner membrane subunit  36.54 
 
 
304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>